RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C SMF2P38778 549 aa1.39□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C TAF6P53040 516 aa1.39□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C FLC3P53121 802 aa1.39□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C PRO2P54885 456 aaKnown RBP1.39□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C REX3Q12090 404 aa1.39□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C TIR4Q12218 487 aaPredicted RBP1.39□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C SAL1D6W196 494 aa1.38□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C TPI1P00942 248 aaKnown RBP1.38□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C CDC37P06101 506 aaKnown RBP1.38□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C BGL2P15703 313 aaKnown RBP1.38□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C RBK1P25332 333 aa1.38□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C VMA5P31412 392 aaKnown RBP1.38□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C SPS19P32573 292 aaKnown RBP1.38□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C YKL071WP36086 256 aa1.38□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C ECM34P38728 170 aa1.38□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C RRT13P40042 185 aa1.38□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C AIM20P40451 204 aa1.38□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C YFL012WP43580 148 aa1.38□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C HCH1P53834 153 aa1.38□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C MGR3Q04472 501 aa1.38□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C MMT2Q08970 484 aa1.38□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C APC2Q12440 853 aa1.38□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C RAX2Q12465 1220 aa1.38□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C STE2D6VTK4 431 aa1.38□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C YPS1P32329 569 aa1.38□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C GGC1P38988 300 aa1.38□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C YER184CP39961 794 aa1.38□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C YGR168CP53293 376 aa1.38□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C NRM1P53718 249 aa1.38□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C ABZ2Q03266 374 aa1.38□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C RVB1Q03940 463 aaKnown RBP1.38□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C VPS20Q04272 221 aa1.38□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C API2Q04413 109 aa1.38□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C RTC5Q12108 567 aaKnown RBP1.38□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C RFM1Q12192 310 aa1.38□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C YOL085CQ99345 113 aa1.38□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C VPS63O13549 108 aa1.37□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C REP1P03871 373 aa1.37□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C RPS19AP07280 144 aaKnown RBP1.37□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C RPS19BP07281 144 aaPredicted RBP1.37□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C SPS100P13130 326 aa1.37□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C CTA1P15202 515 aa1.37□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C ITR2P30606 609 aa1.37□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C ACB1P31787 87 aa1.37□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C MEI5P32489 222 aa1.37□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C CYM1P32898 989 aa1.37□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C TAE1P38340 232 aa1.37□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C END3P39013 349 aa1.37□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C FHL1P39521 936 aa1.37□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C SSO2P39926 295 aa1.37□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C OSW5P40219 148 aa1.37□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C YFR018CP43599 363 aa1.37□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C SED5Q01590 340 aa1.37□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C CAB5Q03941 241 aa1.37□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C FAR10Q06001 478 aa1.37□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C YOL029CQ08187 201 aa1.37□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C RPN8Q08723 338 aaKnown RBP1.37□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C YPS3Q12303 508 aa1.37□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C YAL067W-AQ8TGK6 75 aa1.37□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C MHP1P43638 1398 aa1.36□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C CBP2P03874 630 aaPredicted RBP1.36□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C PET18P25362 215 aa1.36□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C KTI12P34253 313 aaKnown RBP1.36□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C SWC5P38326 303 aa1.36□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C YDR089WP38966 869 aa1.36□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C UTP25P40498 721 aaKnown RBP1.36□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C PFS2P42841 465 aaKnown RBP1.36□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C TPC1P53257 314 aa1.36□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C YLR297WQ05899 129 aa1.36□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C PRM7Q12459 698 aa1.36□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C BUD2P33314 1104 aa1.36□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C CBF5P33322 483 aaKnown RBP RIP-Chip data1.36□□□□□ -2.19not detected
HDA3YPR179C TIP20P33891 701 aa1.36□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C YKL162CP36052 402 aa1.36□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C DBP7P36120 742 aaKnown RBP1.36□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C EFM1P38732 585 aa1.36□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C PES4P39684 611 aa1.36□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C HIT1P46973 164 aa1.36□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C COQ5P49017 307 aa1.36□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C YGR067CP53243 804 aa1.36□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C MRX9Q07349 420 aaKnown RBP1.36□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C RDL2Q08742 149 aaKnown RBP1.36□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C SLF1Q12034 447 aaKnown RBP1.36□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C YDR018CQ12185 396 aa1.36□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C MDY2Q12285 212 aa1.36□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C PAA1Q12447 191 aaKnown RBP1.36□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C FLO11P08640 1367 aa1.35□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C AUS1Q08409 1394 aa1.35□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C RCK1P38622 512 aa1.35□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C FET3P38993 636 aa1.35□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C INA22P40576 216 aa1.35□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C PMT4P46971 762 aa1.35□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C DBP6P53734 629 aaKnown RBP1.35□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C YPL080CQ02826 108 aa1.35□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C YLR012CQ07927 99 aa1.35□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C SAM4Q08985 325 aaKnown RBP1.35□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C PRM4Q12498 284 aa1.35□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C GCD2P12754 651 aaPredicted RBP1.34□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C MSS116P15424 664 aaKnown RBP1.34□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C ZIP1P31111 875 aa1.34□□□□□ -2.19
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