RNA–Protein interactions for RNA: YNL323W

LEM3, Transcript of Membrane protein of the plasma membrane and ER, yeast

Gene LEM3, Length 1,245 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LEM3	YNL323W	MAL11	P53048	616 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	YGL101W	P53144	215 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	REC102	Q02721	264 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	SIZ1	Q04195	904 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	YML096W	Q04489	525 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	YLR173W	Q06247	608 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	RXT3	Q07458	294 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	YOL107W	Q12239	342 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	HSP42	Q12329	375 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	APC2	Q12440	853 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	RTN2	Q12443	393 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	PCL9	Q12477	304 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	FAB1	P34756	2278 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	YOL162W	P0CF19	215 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	RML2	P32611	393 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	MSN2	P33748	704 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	MTC2	P34246	357 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	ECM15	P35195	104 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	SHE1	P38200	338 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	CHL4	P38907	458 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	YKE4	P40544	346 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	IDS2	P46958	469 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	MDV1	P47025	714 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	COS10	P52924	374 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	TPN1	P53099	579 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	IMO32	P53219	342 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	RRN9	P53437	365 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
LEM3	YNL323W	TDA1	Q03533	586 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	PLB2	Q03674	706 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	NAT4	Q04751	285 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	YEH1	Q07804	573 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	FRE5	Q08908	694 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	YPL199C	Q08954	240 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	MMT2	Q08970	484 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	TPO4	Q12256	659 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	SFG1	Q12507	346 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	LAG2	Q92325	660 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	SIR2	P06700	562 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	RED1	P14291	827 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	AAC3	P18238	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	PHO80	P20052	293 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	AHC2	P25649	128 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	ORC2	P32833	620 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	RPC34	P32910	317 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	YKL063C	P35725	167 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	YOR062C	P36025	268 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	GID8	P40208	455 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	FMC1	P40491	155 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	DIE2	P50076	525 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	FHN1	P53279	174 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	RNH70	P53331	553 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	MRPL50	P53724	139 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	YPL068C	Q02749	293 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	PLM2	Q04383	521 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	MLC2	Q06580	163 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	SYO1	Q07395	620 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	CRT10	Q08226	957 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	IRC13	Q08630	104 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	YDL211C	Q12121	372 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	SPC3	Q12133	184 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	YPR1	Q12458	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	YOR019W	Q99248	730 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	STT4	P37297	1900 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	SEC12	P11655	471 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	ERD1	P16151	362 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	YCR100C	P25606	316 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	THI4	P32318	326 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	YMC1	P32331	307 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	SRB5	P32585	307 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	DUT1	P33317	147 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LEM3	YNL323W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.6 ms