RNA–Protein interactions for RNA: YNL057W

YNL057W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL057W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL057W	YNL057W	PEF1	P53238	335 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	PRM15	Q03262	622 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	SCS7	Q03529	384 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	SNA4	Q07549	140 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	FIT3	Q08907	204 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	YMR085W	P0CF18	432 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	RAP1	P11938	827 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	UGA1	P17649	471 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	RPB8	P20436	146 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	CLB3	P24870	427 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	ERG4	P25340	473 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	HSP30	P25619	332 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	MCM10	P32354	571 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.8	□□□□□ -1.8	not detected
YNL057W	YNL057W	CLB6	P32943	380 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	MDL1	P33310	695 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	SLC1	P33333	303 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	OAF3	P36023	863 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	MRPL17	P36528	281 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	ROT2	P38138	954 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	ECM8	P38246	354 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	YHR219W	P38900	624 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	POP1	P41812	875 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	SKP1	P52286	194 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	YIP4	P53093	235 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	TWF1	P53250	332 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	YPL077C	Q02831	240 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	RSC9	Q03124	581 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	YDR102C	Q03864	110 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	KRE28	Q04431	385 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	GAT3	Q07928	141 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	NTG2	Q08214	380 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	YOR343C	Q12484	108 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	RPS23B	P0CX30	145 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	HCS1	P34243	683 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	SPT10	P35208	640 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	MPH1	P40562	993 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	BRR6	P53062	197 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	VPS60	Q03390	229 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	MUM3	Q08750	479 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	UIP4	Q08926	304 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	YPL191C	Q08930	360 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	RLM1	Q12224	676 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	DFG16	Q99234	619 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	FSH3	Q99369	266 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	ARG3	P05150	338 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	PHO81	P17442	1178 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	CCA1	P21269	546 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	SED4	P25365	1065 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	YBR032W	P38223	100 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	YBR138C	P38277	524 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	RCK1	P38622	512 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	ARN1	P38731	627 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.78	□□□□□ -1.8	not detected
YNL057W	YNL057W	MET28	P40573	187 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	MRM2	P53123	320 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	YNL181W	P53878	407 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	APJ1	P53940	528 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.78	□□□□□ -1.8	not detected
YNL057W	YNL057W	YMR279C	Q03263	540 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	RSM24	Q03976	319 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	YLR413W	Q06689	675 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	HMS1	Q12398	434 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YNL057W	YNL057W	YPK2	P18961	677 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YNL057W	YNL057W	THI4	P32318	326 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YNL057W	YNL057W	TIM12	P32830	109 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YNL057W	YNL057W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
YNL057W	YNL057W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
YNL057W	YNL057W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
YNL057W	YNL057W	YDL186W	P48568	277 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YNL057W	YNL057W	NIT3	P49954	291 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YNL057W	YNL057W	PPT1	P53043	513 aa		3.77	□□□□□ -1.81

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.1 ms