RNA–Protein interactions for RNA: YLR018C

POM34, Transcript of Subunit of the transmembrane ring of the nuclear pore complex (NPC), yeastyeast

Gene POM34, Length 900 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
POM34YLR018C MRPL16P38064 232 aa8.99□□□□□ -0.97
POM34YLR018C OM14P38325 134 aa8.99□□□□□ -0.97
POM34YLR018C GRE3P38715 327 aaKnown RBP RIP-Chip data8.99□□□□□ -0.97not detected
POM34YLR018C RPP1P38786 293 aa8.99□□□□□ -0.97
POM34YLR018C VNX1P42839 908 aa8.99□□□□□ -0.97
POM34YLR018C MDE1P47095 244 aa8.99□□□□□ -0.97
POM34YLR018C SAM37P50110 327 aa8.99□□□□□ -0.97
POM34YLR018C MAK3Q03503 176 aa8.99□□□□□ -0.97
POM34YLR018C SNX41Q04053 625 aa8.99□□□□□ -0.97
POM34YLR018C RAX1Q08760 435 aa8.99□□□□□ -0.97
POM34YLR018C RRG7Q08774 242 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
POM34YLR018C PCL9Q12477 304 aa8.99□□□□□ -0.97
POM34YLR018C RAS1P01119 309 aa8.98□□□□□ -0.97
POM34YLR018C RAD51P25454 400 aa8.98□□□□□ -0.97
POM34YLR018C LDB16P25587 256 aa8.98□□□□□ -0.97
POM34YLR018C CPR3P25719 182 aa8.98□□□□□ -0.97
POM34YLR018C GPX1P36014 167 aa8.98□□□□□ -0.97
POM34YLR018C NAB3P38996 802 aaKnown RBP RIP-Chip data8.98□□□□□ -0.97not detected
POM34YLR018C IES5P40060 125 aa8.98□□□□□ -0.97
POM34YLR018C COS10P52924 374 aa8.98□□□□□ -0.97
POM34YLR018C RRN9P53437 365 aa8.98□□□□□ -0.97
POM34YLR018C MNT4P53745 580 aa8.98□□□□□ -0.97
POM34YLR018C YLR346CQ06139 101 aa8.98□□□□□ -0.97
POM34YLR018C MLC2Q06580 163 aa8.98□□□□□ -0.97
POM34YLR018C MCM21Q06675 368 aa8.98□□□□□ -0.97
POM34YLR018C HRT1Q08273 121 aa8.98□□□□□ -0.97
POM34YLR018C RDR1Q08904 546 aa8.98□□□□□ -0.97
POM34YLR018C RKM1Q08961 583 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
POM34YLR018C YOR289WQ12012 251 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
POM34YLR018C IES3Q12345 250 aa8.98□□□□□ -0.97
POM34YLR018C MDH1P17505 334 aaKnown RBP RIP-Chip data8.97□□□□□ -0.97not detected
POM34YLR018C YKL071WP36086 256 aa8.97□□□□□ -0.97
POM34YLR018C BAP2P38084 609 aa8.97□□□□□ -0.97
POM34YLR018C SHE1P38200 338 aa8.97□□□□□ -0.97
POM34YLR018C FET3P38993 636 aa8.97□□□□□ -0.97
POM34YLR018C YER158CP40095 573 aa8.97□□□□□ -0.97
POM34YLR018C ECL1P48235 211 aa8.97□□□□□ -0.97
POM34YLR018C RSM10Q03201 203 aa8.97□□□□□ -0.97
POM34YLR018C GIS1Q03833 894 aa8.97□□□□□ -0.97
POM34YLR018C YPS7Q06325 596 aa8.97□□□□□ -0.97
POM34YLR018C HDA2Q06629 674 aa8.97□□□□□ -0.97
POM34YLR018C YOR389WQ08912 624 aa8.97□□□□□ -0.97
POM34YLR018C RPP2BP02400 110 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
POM34YLR018C PHO80P20052 293 aa8.96□□□□□ -0.98
POM34YLR018C RPB8P20436 146 aa8.96□□□□□ -0.98
POM34YLR018C NUP1P20676 1076 aa8.96□□□□□ -0.98
POM34YLR018C SBA1P28707 216 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
POM34YLR018C ARO7P32178 256 aa8.96□□□□□ -0.98
POM34YLR018C SUR1P33300 382 aa8.96□□□□□ -0.98
POM34YLR018C DDI1P40087 428 aa8.96□□□□□ -0.98
POM34YLR018C BUR6P40096 142 aa8.96□□□□□ -0.98
POM34YLR018C NTA1P40354 457 aa8.96□□□□□ -0.98
POM34YLR018C FMC1P40491 155 aa8.96□□□□□ -0.98
POM34YLR018C YJR098CP47139 656 aa8.96□□□□□ -0.98
POM34YLR018C OGG1P53397 376 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
POM34YLR018C PFA5Q03289 374 aa8.96□□□□□ -0.98
POM34YLR018C YDR249CQ03787 373 aa8.96□□□□□ -0.98
POM34YLR018C COX20Q04935 205 aa8.96□□□□□ -0.98
POM34YLR018C BUR2Q05949 395 aa8.96□□□□□ -0.98
POM34YLR018C COQ10Q08058 207 aa8.96□□□□□ -0.98
POM34YLR018C YRA1Q12159 226 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
POM34YLR018C YRM1Q12340 786 aa8.96□□□□□ -0.98
POM34YLR018C HAP4P14064 554 aa8.95□□□□□ -0.98
POM34YLR018C RPL24BP24000 155 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
POM34YLR018C MDH3P32419 343 aaKnown RBP RIP-Chip data8.95□□□□□ -0.98not detected
POM34YLR018C TRS65P32893 560 aa8.95□□□□□ -0.98
POM34YLR018C NIC96P34077 839 aa8.95□□□□□ -0.98
POM34YLR018C RPE1P46969 238 aa8.95□□□□□ -0.98
POM34YLR018C MGR3Q04472 501 aa8.95□□□□□ -0.98
POM34YLR018C YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
POM34YLR018C FMP42Q04991 504 aa8.95□□□□□ -0.98
POM34YLR018C MDM32Q12171 622 aa8.95□□□□□ -0.98
POM34YLR018C RLM1Q12224 676 aa8.95□□□□□ -0.98
POM34YLR018C YGR161W-CQ3E744 92 aa8.95□□□□□ -0.98
POM34YLR018C YOR032W-AQ8TGS1 66 aa8.95□□□□□ -0.98
POM34YLR018C GAS1P22146 559 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
POM34YLR018C FPS1P23900 669 aa8.94□□□□□ -0.98
POM34YLR018C YCL002CP25565 263 aa8.94□□□□□ -0.98
POM34YLR018C HIS7P33734 552 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
POM34YLR018C PHO90P39535 881 aa8.94□□□□□ -0.98
POM34YLR018C SER3P40054 469 aa8.94□□□□□ -0.98
POM34YLR018C PKP1P40530 394 aa8.94□□□□□ -0.98
POM34YLR018C NAS2P40555 220 aa8.94□□□□□ -0.98
POM34YLR018C MPP6P53725 186 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
POM34YLR018C GAL83Q04739 417 aa8.94□□□□□ -0.98
POM34YLR018C YLR173WQ06247 608 aa8.94□□□□□ -0.98
POM34YLR018C TAZ1Q06510 381 aa8.94□□□□□ -0.98
POM34YLR018C HNT3Q08702 217 aa8.94□□□□□ -0.98
POM34YLR018C FRE5Q08908 694 aa8.94□□□□□ -0.98
POM34YLR018C SWM1Q12379 170 aa8.94□□□□□ -0.98
POM34YLR018C IRA1P18963 3092 aa8.94□□□□□ -0.98
POM34YLR018C KIN28P06242 306 aa8.93□□□□□ -0.98
POM34YLR018C YHR214C-DP0CX93 97 aa8.93□□□□□ -0.98
POM34YLR018C ERG8P24521 451 aa8.93□□□□□ -0.98
POM34YLR018C YCR102CP25608 368 aa8.93□□□□□ -0.98
POM34YLR018C NUD1P32336 851 aa8.93□□□□□ -0.98
POM34YLR018C MSN4P33749 630 aa8.93□□□□□ -0.98
POM34YLR018C UTP11P34247 250 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
POM34YLR018C TPO5P36029 618 aa8.93□□□□□ -0.98
POM34YLR018C YPK3P38070 525 aa8.93□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.9 ms