RNA–Protein interactions for RNA: YLL013C

PUF3, Transcript of Protein of the mitochondrial outer surface, yeast

Gene PUF3, Length 2,640 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUF3	YLL013C	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
PUF3	YLL013C	TRS65	P32893	560 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PUF3	YLL013C	KRE29	P40026	464 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PUF3	YLL013C	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
PUF3	YLL013C	IRC7	P43623	340 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PUF3	YLL013C	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
PUF3	YLL013C	KAP120	Q02932	1032 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PUF3	YLL013C	TFB3	Q03290	321 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PUF3	YLL013C	NDL1	Q06568	189 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PUF3	YLL013C	YOR343C	Q12484	108 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PUF3	YLL013C	SIR3	P06701	978 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PUF3	YLL013C	RPB8	P20436	146 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PUF3	YLL013C	SRO77	P38163	1010 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PUF3	YLL013C	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
PUF3	YLL013C	IDP2	P41939	412 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PUF3	YLL013C	DML1	Q03652	475 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PUF3	YLL013C	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
PUF3	YLL013C	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
PUF3	YLL013C	MED2	Q12124	431 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PUF3	YLL013C	YOL162W	P0CF19	215 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PUF3	YLL013C	TFS1	P14306	219 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PUF3	YLL013C	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PUF3	YLL013C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PUF3	YLL013C	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.09	□□□□□ -1.59	not detected
PUF3	YLL013C	RMR1	P53060	241 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PUF3	YLL013C	BRR6	P53062	197 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PUF3	YLL013C	YGL235W	P53071	178 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PUF3	YLL013C	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PUF3	YLL013C	HFD1	Q04458	532 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PUF3	YLL013C	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PUF3	YLL013C	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PUF3	YLL013C	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	YKL077W	P36081	392 aa		5.09	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	YKL071W	P36086	256 aa		5.09	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	YGR016W	P53209	190 aa		5.09	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	SNO4	Q04902	237 aa		5.09	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	HSP32	Q08992	237 aa		5.09	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	VIK1	Q12045	647 aa		5.09	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	MSN4	P33749	630 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	MTC6	P38849	526 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	CTF8	P38877	133 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	POP1	P41812	875 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	IDS2	P46958	469 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	MRPL19	P53875	158 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	MRP51	Q02950	344 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	NFI1	Q12216	726 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	YPR015C	Q12531	247 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	HAP4	P14064	554 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	MCM10	P32354	571 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	ALP1	P38971	573 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	FAR7	P43592	221 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	MDE1	P47095	244 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	HRT1	Q08273	121 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	SPC3	Q12133	184 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	YLR126C	Q12288	251 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	PRB1	P09232	635 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	NIC96	P34077	839 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	MAL32	P38158	584 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	ARN2	P38724	620 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	AVT7	P40501	490 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	PRM8	P53174	237 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	PCP1	P53259	346 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	COS1	P53822	381 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	INN1	P53901	409 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	TIM10	P87108	93 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	MRPL1	Q04599	285 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	YDL176W	Q12027	708 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	5.07	□□□□□ -1.6	not detected
PUF3	YLL013C	SEC12	P11655	471 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	UBC8	P28263	218 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	YHL037C	P38733	133 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	RPP1	P38786	293 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	YAR028W	P39548	234 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	NAS2	P40555	220 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	YFL051C	P43552	160 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	SAM37	P50110	327 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	HMS1	Q12398	434 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	SET6	Q12529	373 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	SNF6	P18888	332 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	THI4	P32318	326 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	DAM1	P53267	343 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	CTS2	Q06350	511 aa		5.06	□□□□□ -1.6

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