RNA–Protein interactions for RNA: YKR065C

PAM17, Transcript of Constituent of the TIM23 complex, yeast

Gene PAM17, Length 594 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM17	YKR065C	YOR365C	Q08844	703 aa		6.7	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	6.7	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	AAC3	P18238	307 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	PBN1	P25580	416 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	PUP2	P32379	260 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	YOR062C	P36025	268 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	RPS27B	P38711	82 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	YIL024C	P40543	189 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	STE24	P47154	453 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	PLM2	Q04383	521 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	SMA2	Q04658	369 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	GPI11	Q06636	219 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	ASA1	Q06822	443 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	YOR214C	Q12282	236 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	YDL199C	Q12407	687 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	HFA1	P32874	2273 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	RIP1	P08067	215 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	COQ3	P27680	312 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	NUF2	P33895	451 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	BIG1	P38813	335 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	ECM10	P39987	644 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	FMP33	P46998	180 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	TWF1	P53250	332 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	IGO1	P53897	168 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	KRE28	Q04431	385 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	MRPL1	Q04599	285 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	YDL242W	Q07746	117 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	COX1	P00401	534 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	GRR1	P24814	1151 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	RIB1	P38066	345 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	YLF2	P38746	405 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	YHR210C	P38893	341 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	AGP3	P43548	558 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	YGR016W	P53209	190 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	YPL107W	Q02873	248 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	URC2	Q04411	772 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	ARR1	Q06596	294 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	GLE1	Q12315	538 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	HSP42	Q12329	375 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	YOS9	Q99220	542 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	CBS1	P14066	229 aa		6.66	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	MKK1	P32490	508 aa		6.66	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	SDS22	P36047	338 aa		6.66	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	SPC34	P36131	295 aa		6.66	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	YIL152W	P40455	235 aa		6.66	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	MDV1	P47025	714 aa		6.66	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	PEX25	Q02969	394 aa		6.66	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	YDR239C	Q03780	787 aa		6.66	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	RAD30	Q04049	632 aa		6.66	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	YOL024W	Q08172	172 aa		6.66	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	VIK1	Q12045	647 aa		6.66	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	PSY3	Q12318	242 aa		6.66	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	SKS1	Q12505	502 aa		6.66	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		6.65	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	YER190C-B	P0CX94	160 aa		6.65	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		6.65	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		6.65	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		6.65	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		6.65	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	LDB16	P25587	256 aa		6.65	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	CIN1	P40987	1014 aa		6.65	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	LCL3	P53153	274 aa		6.65	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	YGR079W	P53249	370 aa		6.65	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	YLR460C	P54007	376 aa		6.65	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	RSA1	Q08932	381 aa		6.65	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	BSC1	Q12140	328 aa		6.65	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		6.65	□□□□□ -1.34
PAM17	YKR065C	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
PAM17	YKR065C	SEC62	P21825	274 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PAM17	YKR065C	HCS1	P34243	683 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PAM17	YKR065C	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
PAM17	YKR065C	FES1	P38260	290 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PAM17	YKR065C	EXO84	P38261	753 aa		6.64	□□□□□ -1.35

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