RNA–Protein interactions for RNA: YJL104W

PAM16, Transcript of Subunit of the import motor (PAM complex), yeast

Gene PAM16, Length 450 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM16	YJL104W	SPT8	P38915	602 aa		0.87	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	ERP2	P39704	215 aa		0.87	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	FLC2	P39719	783 aa		0.87	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	YEL073C	P39974	107 aa		0.87	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	YIL012W	P40551	113 aa		0.87	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	0.87	□□□□□ -2.27	not detected
PAM16	YJL104W	APS3	P47064	194 aa		0.87	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	SBH2	P52871	88 aa		0.87	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	LCL3	P53153	274 aa		0.87	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	TIM13	P53299	105 aa		0.87	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	MNT4	P53745	580 aa		0.87	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	VPS9	P54787	451 aa		0.87	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	GTR1	Q00582	310 aa		0.87	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	CDC14	Q00684	551 aa		0.87	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	PRM15	Q03262	622 aa		0.87	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	TAF12	Q03761	539 aa		0.87	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	TRM12	Q04235	462 aa		0.87	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	NKP2	Q06162	153 aa		0.87	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	TAZ1	Q06510	381 aa		0.87	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	NDL1	Q06568	189 aa		0.87	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	RAF1	Q06891	181 aa		0.87	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	YEH1	Q07804	573 aa		0.87	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	SRL2	Q12020	392 aa		0.87	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	0.87	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	ATG29	Q12092	213 aa		0.87	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	0.87	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	SRN2	Q99176	213 aa		0.87	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	HEM4	P06174	275 aa		0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	COR1	P07256	457 aa		0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	NFT1	P0CE68	1218 aa		0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	MSI1	P13712	422 aa		0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	MET8	P15807	274 aa		0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	KAR3	P17119	729 aa		0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	VMA16	P23968	213 aa		0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	BOS1	P25385	244 aa		0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	RAD51	P25454	400 aa		0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	MIG1	P27705	504 aa		0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	POP5	P28005	173 aa		0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	AEP1	P32493	518 aa		0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	CNS1	P33313	385 aa		0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	YKL187C	P34231	750 aa		0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	PEX5	P35056	612 aa		0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	CSG2	P35206	410 aa		0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	PRY2	P36110	329 aa		0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	ALY1	P36117	915 aa		0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	RRN10	P38204	145 aa		0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	FMP23	P38231	175 aa		0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	RPS27B	P38711	82 aa		0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	SEN34	P39707	275 aa		0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	ICE2	P40499	491 aa		0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	YIL001W	P40560	513 aa		0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	PAC11	P40960	533 aa		0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	SNZ3	P43545	298 aa		0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	SHE4	P51534	789 aa		0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	YGR066C	P53242	292 aa		0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	YNR068C	P53754	272 aa		0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	SNZ2	P53824	298 aa		0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	YNL260C	P53846	198 aa		0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.86	□□□□□ -2.27	not detected
PAM16	YJL104W	MSC1	Q03104	513 aa		0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	GAS3	Q03655	524 aa		0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	RIM9	Q04734	239 aa		0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	ROY1	Q04847	553 aa		0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	VAC14	Q06708	880 aa		0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	CSI2	Q08054	341 aa		0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	SGT1	Q08446	395 aa		0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	FCY22	Q12119	530 aa		0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	YOR012W	Q12351	137 aa		0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	SPE4	Q12455	300 aa		0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	0.86	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	0.85	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	YAK1	P14680	807 aa		0.85	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	PUT4	P15380	627 aa		0.85	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	PHO81	P17442	1178 aa		0.85	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	CDC42	P19073	191 aa		0.85	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	0.85	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	MXR2	P25566	168 aa		0.85	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	ITR1	P30605	584 aa		0.85	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	ZIP1	P31111	875 aa		0.85	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	PHA2	P32452	334 aa		0.85	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	0.85	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	0.85	□□□□□ -2.27
PAM16	YJL104W	NIP100	P33420	868 aa		0.85	□□□□□ -2.27

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