RNA–Protein interactions for RNA: YHR064C

SSZ1, Transcript of Hsp70 protein that interacts with Zuo1p (a DnaJ homolog), yeast

Gene SSZ1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SSZ1	YHR064C	MLC2	Q06580	163 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	ATG41	Q12048	136 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	FRE6	Q12473	712 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	HCM1	P25364	564 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
SSZ1	YHR064C	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
SSZ1	YHR064C	ECM25	P32525	599 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	ECT1	P33412	323 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	GCS1	P35197	352 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	GMH1	P36125	273 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	PAU24	P38155	120 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	SRO77	P38163	1010 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	IML3	P38265	245 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	OSH7	P38755	437 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	CHL4	P38907	458 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	YIL165C	P40446	119 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	APQ12	P40532	138 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	MAD2	P40958	196 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	QRI7	P43122	407 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	IDS2	P46958	469 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	ROG1	P53118	685 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	YGL101W	P53144	215 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	SWC4	P53201	476 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	SAY1	P53324	424 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	DCR2	Q05924	578 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	DCI1	Q08558	271 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	KIN3	P22209	435 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	SFC1	P33303	322 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	KKQ8	P36004	724 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	NSG1	P38837	291 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	FMP52	P40008	231 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	PFA3	P42836	336 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	MTL1	P53214	551 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	MEP3	P53390	489 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	SPC19	Q03954	165 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	HDA2	Q06629	674 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	BTS1	Q12051	335 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	PER33	Q12144	273 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	YLR108C	Q12259	485 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	FSH3	Q99369	266 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSZ1	YHR064C	COX9	P07255	59 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	PRE4	P30657	266 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	PMT2	P31382	759 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	COQ2	P32378	372 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	SRB6	P32570	121 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	SFA1	P32771	386 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	PDC2	P32896	925 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	VPS17	P32913	551 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	SKN1	P33336	771 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	YEL068C	P39977	110 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	HEM14	P40012	539 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	ICE2	P40499	491 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	PRM10	P42946	383 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	SLI1	P53304	468 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	MTQ1	P53944	314 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	TPO4	Q12256	659 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	YSR3	P23501	404 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	LDS1	P31379	325 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	SSH4	P32343	579 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	THI2	P38141	450 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	POP1	P41812	875 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	LSB6	P42951	607 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	HHO1	P53551	258 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	YNR065C	P53751	1116 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	VBA1	Q04301	562 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62

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