RNA–Protein interactions for RNA: YGL196W

DSD1, Transcript of D-serine dehydratase (aka D-serine ammonia-lyase), yeast

Gene DSD1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSD1	YGL196W	SHY1	P53266	389 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	YGR266W	P53326	701 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	IRC4	Q03036	179 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	YLR012C	Q07927	99 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	PLP2	Q12017	286 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	SLM3	Q12093	417 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	PET123	P17558	318 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	CSM1	P25651	190 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	CPR3	P25719	182 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	LDS1	P31379	325 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	PEP1	P32319	1579 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	TPO5	P36029	618 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	RCK2	P38623	610 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	SMF2	P38778	549 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	DSE1	P40077	573 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	DFG10	P40526	253 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	YGR210C	P42942	411 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	YLL007C	Q07799	665 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	DDC1	Q08949	612 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	FRE8	Q12209	686 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	SFM1	Q12314	213 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	RPN6	Q12377	434 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	YCF1	P39109	1515 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	PAN1	P32521	1480 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	ATP6	P00854	259 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	IME2	P32581	645 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	COT1	P32798	439 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	KRE9	P39005	276 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	SCC4	P40090	624 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	PMT4	P46971	762 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	FMP33	P46998	180 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	MFG1	Q07684	458 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	APC9	Q12107	265 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	IZH2	Q12442	317 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	CBS2	P14905	389 aa		4.06	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	CTA1	P15202	515 aa		4.06	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	SPR1	P32603	445 aa		4.06	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	ZRT1	P32804	376 aa		4.06	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	AGP3	P43548	558 aa		4.06	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	ATG18	P43601	500 aa		4.06	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	MRX5	P47007	382 aa		4.06	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	BNS1	P50084	137 aa		4.06	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	KAP114	P53067	1004 aa		4.06	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	SUR7	P54003	302 aa		4.06	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	YPL080C	Q02826	108 aa		4.06	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	YPL077C	Q02831	240 aa		4.06	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	PRM4	Q12498	284 aa		4.06	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.06	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	IZH4	Q99393	312 aa		4.06	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	REP1	P03871	373 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	RSR1	P13856	272 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	GIT1	P25346	518 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	NAM9	P27929	486 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	COY1	P34237	679 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	DTR1	P38125	572 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	YER186C	P40101	306 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	EGT2	P42835	1041 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	MOB2	P43563	287 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	BIR1	P47134	954 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	YGL242C	P53066	181 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	CRH1	P53301	507 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	SPP2	Q02521	185 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	RNH1	Q04740	348 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	GAS2	Q06135	555 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	GMC2	Q06201	188 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	GPN3	Q06543	272 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	YPQ1	Q12010	308 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	SAL1	D6W196	494 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	PHO2	P07269	559 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	UNG1	P12887	359 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	AIM23	P47015	356 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	SED5	Q01590	340 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	FSH2	Q05015	223 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	ATP16	Q12165	160 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	MCT1	Q12283	360 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	MED4	Q12343	284 aa		4.04	□□□□□ -1.76
DSD1	YGL196W	TSC11	P40061	1430 aa		4.04	□□□□□ -1.76

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