RNA–Protein interactions for RNA: YER103W

SSA4, Transcript of Heat shock protein that is highly induced upon stress, yeast

Gene SSA4, Length 1,929 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SSA4	YER103W	MEP3	P53390	489 aa		11.9	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	YMR252C	Q04814	134 aa		11.9	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	GAS2	Q06135	555 aa		11.9	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	KEI1	Q06346	221 aa		11.9	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	PEX11	Q12462	236 aa		11.9	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	QCR7	P00128	127 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	PRB1	P09232	635 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	SSN3	P39073	555 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	YIL166C	P40445	542 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	YIR035C	P40579	254 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	SNM1	P40993	198 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	JIP4	Q03361	876 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	SWF1	Q04629	336 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	ARG7	Q04728	441 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	MDM30	Q05930	598 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	TRX3	P25372	127 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	MTH1	P35198	433 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	CBP4	P37267	147 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	MRPL22	P53881	309 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	YCL001W-A	P87012	153 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	HLR1	Q04429	423 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	SRO77	P38163	1010 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	CHL4	P38907	458 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	MET28	P40573	187 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	IBA57	P47158	497 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	HAP2	P06774	265 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	PUT1	P09368	476 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.87	□□□□□ -0.51	not detected
SSA4	YER103W	DOA4	P32571	926 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	THI2	P38141	450 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	ERV15	P38312	142 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	SPO74	P45819	413 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	NNF1	P47149	201 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	YJR149W	P47177	404 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	YNR065C	P53751	1116 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	SNO1	Q03144	224 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	PUN1	Q06991	263 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	YDL086W	Q07505	273 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	GRC3	Q07845	632 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	PER33	Q12144	273 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	SEC22	P22214	214 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	ATS1	P31386	333 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	CAC2	Q04199	468 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	CRT10	Q08226	957 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	CAN1	P04817	590 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	ACP1	P32463	125 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	PPG1	P32838	368 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	ECT1	P33412	323 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	TIM17	P39515	158 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	FAU1	P40099	211 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	UFE1	P41834	346 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	COQ6	P53318	479 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	BOP2	Q06150	570 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	GUP2	Q08929	609 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	FRE6	Q12473	712 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	DTR1	P38125	572 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	INM1	P38710	295 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	RGA1	P39083	1007 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	PTC2	P39966	464 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	BTS1	Q12051	335 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	TRM13	Q12383	476 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	RRI1	Q12468	440 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	YPR015C	Q12531	247 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	FSH3	Q99369	266 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	ZRC1	P20107	442 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	YCL002C	P25565	263 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	CTS1	P29029	562 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	SCO2	P38072	301 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	PGA1	P53896	198 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	DCN1	Q12395	269 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	PCL5	P38794	229 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	POG1	P40473	351 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	YPR127W	Q06494	345 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	SPC3	Q12133	184 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSA4	YER103W	NAM2	P11325	894 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SSA4	YER103W	SEC12	P11655	471 aa		11.83	□□□□□ -0.52

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 44.6 ms