RNA–Protein interactions for RNA: YCL057W

PRD1, Transcript of Zinc metalloendopeptidase, yeast

Gene PRD1, Length 2,139 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRD1	YCL057W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	YPL107W	Q02873	248 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	MAK3	Q03503	176 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	YMR087W	Q04299	284 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	RAX1	Q08760	435 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	GTT2	Q12390	233 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	FMP16	Q12497	93 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	YCR007C	P25354	239 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	RHB1	P25378	209 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	PTM1	P32857	523 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	SDH3	P33421	198 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	ECM15	P35195	104 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	IPT1	P38954	527 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	MET30	P39014	640 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	YND1	P40009	630 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	COX20	Q04935	205 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	YLR345W	Q06137	509 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	ECM7	Q06200	448 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	ICT1	Q12385	394 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	MHF1	Q3E835	90 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	TOM1	Q03280	3268 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	APE1	P14904	514 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	GIT1	P25346	518 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	RML2	P32611	393 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	VPS17	P32913	551 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	YIL169C	P40442	995 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	YKE4	P40544	346 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	YGR210C	P42942	411 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	GTR2	P53290	341 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	TIM13	P53299	105 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	KTR6	P54070	446 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	MPS1	P54199	764 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	RBD2	Q12270	262 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	ATG34	Q12292	412 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	ERP3	Q12403	225 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	CDC23	P16522	626 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	ATP11	P32453	318 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	DPH2	P32461	534 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	PPQ1	P32945	549 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	TUL1	P36096	758 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	FHL1	P39521	936 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	COG3	P40094	801 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	AZF1	P41696	914 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	NUP49	Q02199	472 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	PEX27	Q08580	376 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	YLR126C	Q12288	251 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	TRM10	Q12400	293 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	COS2	P0CX12	379 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	COS3	P0CX13	379 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	GLN3	P18494	730 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	RNP1	P32385	249 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	YKL063C	P35725	167 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	VAB2	P40003	282 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	SER2	P42941	309 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	EAF6	P47128	113 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	YGR149W	P48236	432 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	ZRG17	P53735	605 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	YNR068C	P53754	272 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	IBD2	P53892	351 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	DID2	P69771	204 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	NEJ1	Q06148	342 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	PHO92	Q06390	306 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	YDL109C	Q12103	647 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	ATG31	Q12421	196 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	CAP2	P13517	287 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	PPH22	P23595	377 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	YIM1	P28625	365 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	GCS1	P35197	352 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.34	□□□□□ -1.71	not detected
PRD1	YCL057W	ATG7	P38862	630 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	YEL028W	P39989	153 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PRD1	YCL057W	SOK1	P40317	901 aa		4.34	□□□□□ -1.71

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