RNA–Protein interactions for RNA: YCL043C

PDI1, Transcript of Protein disulfide isomerase, yeast

Gene PDI1, Length 1,569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PDI1	YCL043C	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	AIM46	P38885	310 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	FET3	P38993	636 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	YEL073C	P39974	107 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	PGD1	P40356	397 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	YIL024C	P40543	189 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	PFA3	P42836	336 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	RPE1	P46969	238 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	YJL016W	P47072	561 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	CCH1	P50077	2039 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	ROG1	P53118	685 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	IGO1	P53897	168 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	YCL001W-A	P87012	153 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	REC102	Q02721	264 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	MDM30	Q05930	598 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	GIC2	Q06648	383 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	WSC3	Q12215	556 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	YPR011C	Q12251	326 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	PCC1	Q3E833	88 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	YOS9	Q99220	542 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	ISN1	Q99312	450 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	INH1	P01097	85 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	AI3	P03877	415 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	ARG80	P07249	177 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	SSH4	P32343	579 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	HXT4	P32467	576 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	SIP1	P32578	815 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	YKL077W	P36081	392 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	YCR087C-A	P37263	153 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	INM1	P38710	295 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	MAD2	P40958	196 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	LOH1	P47055	219 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	COS10	P52924	374 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	YNR061C	P53747	219 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	GOR1	P53839	350 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	PEX25	Q02969	394 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	SNZ1	Q03148	297 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	ARG7	Q04728	441 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	YDR056C	Q12025	205 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	NMD4	Q12129	218 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	RGT2	Q12300	763 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	SNF8	Q12483	233 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	SIR2	P06700	562 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	CMP2	P14747	604 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	HOP1	P20050	605 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
PDI1	YCL043C	MSN2	P33748	704 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	MRPL36	P36531	177 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	COS111	P38308	924 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	YHR035W	P38769	630 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	ALP1	P38971	573 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	BNA6	P43619	295 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	MRX5	P47007	382 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	YJL043W	P47053	257 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	IMO32	P53219	342 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	BUD9	P53226	547 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	MNT4	P53745	580 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	DAP1	Q12091	152 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	ERD2	P18414	219 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	SNF6	P18888	332 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	TRX3	P25372	127 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	RER1	P25560	188 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	MKK2	P32491	506 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	SPO23	P33757	523 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	YKL162C	P36052	402 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	YKL151C	P36059	337 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	CCZ1	P38273	704 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	PKP1	P40530	394 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	RTS2	P40962	232 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	CIN1	P40987	1014 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	YGR201C	P42936	225 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64

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