RNA–Protein interactions for RNA: YCL028W

RNQ1, Transcript of [PIN(+)] prion, yeast

Gene RNQ1, Length 1,218 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RNQ1	YCL028W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	IES5	P40060	125 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	STB1	P42845	420 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	IRC5	P43610	853 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	IKS1	P47042	667 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	EFM3	P47163	339 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	COS10	P52924	374 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	ATG21	Q02887	496 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	MLC2	Q06580	163 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	YPL191C	Q08930	360 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	CPR3	P25719	182 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	GPX1	P36014	167 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	YHR180W	P38868	163 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	YJR098C	P47139	656 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	ECL1	P48235	211 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	SAM37	P50110	327 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	PGA1	P53896	198 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	FMP45	Q07651	309 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	RAX1	Q08760	435 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	RBD2	Q12270	262 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	PCL9	Q12477	304 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	RAD51	P25454	400 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	YEF1	P32622	495 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	OM14	P38325	134 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	10.12	□□□□□ -0.79	not detected
RNQ1	YCL028W	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	10.12	□□□□□ -0.79	not detected
RNQ1	YCL028W	IRC7	P43623	340 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	SSY5	P47002	699 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	MNT4	P53745	580 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	YDR249C	Q03787	373 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	BUR2	Q05949	395 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	YPS7	Q06325	596 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	ERF2	Q06551	359 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	NTG2	Q08214	380 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	BTS1	Q12051	335 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	RAS1	P01119	309 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	HAP4	P14064	554 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	10.11	□□□□□ -0.79	not detected
RNQ1	YCL028W	PHO80	P20052	293 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	NUP1	P20676	1076 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	YKL071W	P36086	256 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	RPP1	P38786	293 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	FET3	P38993	636 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	BUR6	P40096	142 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	NTA1	P40354	457 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	RRN9	P53437	365 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	PFA5	Q03289	374 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	MAK3	Q03503	176 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	SNX41	Q04053	625 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	YLR346C	Q06139	101 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	HDA2	Q06629	674 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	COQ10	Q08058	207 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	TRS65	P32893	560 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	SUR1	P33300	382 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	NIC96	P34077	839 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	MRPL16	P38064	232 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	BAP2	P38084	609 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	DDI1	P40087	428 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	PKP1	P40530	394 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	SPC19	Q03954	165 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	HNT3	Q08702	217 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	RDR1	Q08904	546 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	YCR102C	P25608	368 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	TPO5	P36029	618 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	YKR073C	P36153	106 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	SHE1	P38200	338 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	SER3	P40054	469 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	RPE1	P46969	238 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	PLM2	Q04383	521 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	COX20	Q04935	205 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	MCM21	Q06675	368 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	HRT1	Q08273	121 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	MDM32	Q12171	622 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	RLM1	Q12224	676 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNQ1	YCL028W	ERG8	P24521	451 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNQ1	YCL028W	NUD1	P32336	851 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNQ1	YCL028W	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	10.08	□□□□□ -0.8	not detected
RNQ1	YCL028W	MSN4	P33749	630 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNQ1	YCL028W	PGU1	P47180	361 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNQ1	YCL028W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RNQ1	YCL028W	GIS1	Q03833	894 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNQ1	YCL028W	FMP42	Q04991	504 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNQ1	YCL028W	YPR109W	Q06104	294 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNQ1	YCL028W	YOR389W	Q08912	624 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNQ1	YCL028W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8

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