RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563830.2

SNAP23-208, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5

Gene SNAP23, Length 570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-208	ENST00000563830	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	KATNBL1	Q9H079	304 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	GREM2	Q9H772	168 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	DTNB	O60941	627 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	CAND2	O75155	1236 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	PCDH8	O95206	1070 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	COL6A1	P12109	1028 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	HSPA6	P17066	643 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	IL13	P35225	146 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	EPHB3	P54753	998 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	CD83	Q01151	205 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	ACAP2	Q15057	778 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	ZNF827	Q17R98	1081 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	TOR2A	Q5JU69	321 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	AJUBA	Q96IF1	538 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	WDR92	Q96MX6	357 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	DAPK3	O43293	454 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	PAX4	O43316	350 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	PRC1	O43663	620 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	NDUFS2	O75306	463 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	PF4V1	P10720	104 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	GLRB	P48167	497 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	NCKAP1L	P55160	1127 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	WNT3A	P56704	352 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	PPARA	Q07869	468 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	ADRM1	Q16186	407 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	CMIP	Q8IY22	773 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	JADE2	Q9NQC1	790 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	DPP7	Q9UHL4	492 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	KLHL18	O94889	574 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	IL33	O95760	270 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	IL12RB1	P42701	662 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	MLC1	Q15049	377 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	CD320	Q9NPF0	282 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	SCOC	Q9UIL1	159 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	CROT	Q9UKG9	612 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	LCHN	A4D1U4	455 aa		6.53	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	MTSS1	O43312	755 aa		6.53	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	GAST	P01350	101 aa		6.53	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	MGAT2	Q10469	447 aa		6.53	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		6.53	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		6.53	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		6.53	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830		Q6ZUG5	572 aa		6.53	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	TTC8	Q8TAM2	541 aa		6.53	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		6.53	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	NOX5	Q96PH1	765 aa		6.53	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	ADI1	Q9BV57	179 aa		6.53	□□□□□ -1.36
SNAP23-208	ENST00000563830	SGPP1	Q9BX95	441 aa		6.53	□□□□□ -1.36

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