RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552346.1

USP15-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 655 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-218ENST00000552346 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP6.87□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa6.87□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa6.87□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 DSEQ9UL01 958 aa6.87□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 PTPN22Q9Y2R2 807 aa6.87□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 IL18BPO95998 194 aa6.86□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 KRT85P78386 507 aa6.86□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 UBE4AQ14139 1066 aa6.86□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 MLC1Q15049 377 aa6.86□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 CRY1Q16526 586 aa6.86□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 PTPN21Q16825 1174 aa6.86□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 MAGEB6Q8N7X4 407 aa6.86□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 ARNT2Q9HBZ2 717 aa6.86□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 VTA1Q9NP79 307 aa6.86□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 OXSMQ9NWU1 459 aa6.86□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 CBLCQ9ULV8 474 aa6.86□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 FZD9O00144 591 aa6.85□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 KRT18P05783 430 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 COMTP21964 271 aa6.85□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 FHL2Q14192 279 aa6.85□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 MIIPQ5JXC2 388 aa6.85□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 GORABQ5T7V8 394 aa6.85□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 KCTD1Q719H9 257 aa6.85□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 SMC5Q8IY18 1101 aa6.85□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.85□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 MORC4Q8TE76 937 aa6.85□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 SLC5A5Q92911 643 aa6.85□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 CARD11Q9BXL7 1154 aa6.85□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 CATSPERZQ9NTU4 200 aa6.85□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 TGM5O43548 720 aa6.84□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 MYL1P05976 194 aa6.84□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 EPHA5P54756 1037 aa6.84□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 RAC3P60763 192 aa6.84□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 TGFB2P61812 414 aa6.84□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 BIRC2Q13490 618 aa6.84□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 GFOD2Q3B7J2 385 aa6.84□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 TMEM240Q5SV17 173 aa6.84□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 AGBL4Q5VU57 503 aa6.84□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 FUKQ8N0W3 1084 aa6.84□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 EDAQ92838 391 aa6.84□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 ZNF503Q96F45 646 aa6.84□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 BOCQ9BWV1 1114 aa6.84□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa6.84□□□□□ -1.31
USP15-218ENST00000552346 WASHC2AQ641Q2 1341 aa6.83□□□□□ -1.32
USP15-218ENST00000552346 SLC12A8A0AV02 714 aa6.83□□□□□ -1.32
USP15-218ENST00000552346 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.83□□□□□ -1.32
USP15-218ENST00000552346 ACOT7O00154 380 aa6.83□□□□□ -1.32
USP15-218ENST00000552346 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
USP15-218ENST00000552346 PLIN1O60240 522 aa6.83□□□□□ -1.32
USP15-218ENST00000552346 CFBP00751 764 aa6.83□□□□□ -1.32
USP15-218ENST00000552346 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
USP15-218ENST00000552346 MYBL2P10244 700 aa6.83□□□□□ -1.32
USP15-218ENST00000552346 RBP3P10745 1247 aa6.83□□□□□ -1.32
USP15-218ENST00000552346 CCND1P24385 295 aa6.83□□□□□ -1.32
USP15-218ENST00000552346 POLD1P28340 1107 aa6.83□□□□□ -1.32
USP15-218ENST00000552346 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
USP15-218ENST00000552346 PHC1P78364 1004 aa6.83□□□□□ -1.32
USP15-218ENST00000552346 DDB1Q16531 1140 aa6.83□□□□□ -1.32
USP15-218ENST00000552346 ABCB5Q2M3G0 1257 aa6.83□□□□□ -1.32
USP15-218ENST00000552346 GPR158Q5T848 1215 aa6.83□□□□□ -1.32
USP15-218ENST00000552346 RASSF3Q86WH2 238 aa6.83□□□□□ -1.32
USP15-218ENST00000552346 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
USP15-218ENST00000552346 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
USP15-218ENST00000552346 FAXDC2Q96IV6 333 aa6.83□□□□□ -1.32
USP15-218ENST00000552346 RPS6KC1Q96S38 1066 aa6.83□□□□□ -1.32
USP15-218ENST00000552346 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.83□□□□□ -1.32
USP15-218ENST00000552346 CSRNP2Q9H175 543 aa6.83□□□□□ -1.32
USP15-218ENST00000552346 SLC39A2Q9NP94 309 aa6.83□□□□□ -1.32
USP15-218ENST00000552346 IP6K2Q9UHH9 426 aa6.83□□□□□ -1.32
USP15-218ENST00000552346 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
USP15-218ENST00000552346 SPO11Q9Y5K1 396 aa6.83□□□□□ -1.32
USP15-218ENST00000552346 TRIM75PA6NK02 468 aa6.82□□□□□ -1.32
USP15-218ENST00000552346 H7C1D1 291 aa6.82□□□□□ -1.32
USP15-218ENST00000552346 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
USP15-218ENST00000552346 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
USP15-218ENST00000552346 PDE6AP16499 860 aa6.82□□□□□ -1.32
USP15-218ENST00000552346 IARSP41252 1262 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
USP15-218ENST00000552346 ABHD18Q0P651 414 aa6.82□□□□□ -1.32
USP15-218ENST00000552346 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
USP15-218ENST00000552346 TERF2Q15554 542 aa6.82□□□□□ -1.32
USP15-218ENST00000552346 GPR19Q15760 415 aa6.82□□□□□ -1.32
USP15-218ENST00000552346 BROXQ5VW32 411 aa6.82□□□□□ -1.32
USP15-218ENST00000552346 OSTM1Q86WC4 334 aa6.82□□□□□ -1.32
USP15-218ENST00000552346 EXOC8Q8IYI6 725 aa6.82□□□□□ -1.32
USP15-218ENST00000552346 CPA6Q8N4T0 437 aa6.82□□□□□ -1.32
USP15-218ENST00000552346 EXTL1Q92935 676 aa6.82□□□□□ -1.32
USP15-218ENST00000552346 SLC39A13Q96H72 371 aa6.82□□□□□ -1.32
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