RNA–Protein interactions for RNA: YJL036W

SNX4, Transcript of Sorting nexin, yeastyeast

Gene SNX4, Length 1,272 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNX4YJL036W ATF2P53296 535 aa6.96□□□□□ -1.3
SNX4YJL036W TRK2P28584 889 aa6.95□□□□□ -1.3
SNX4YJL036W YGR035CP53222 116 aa6.95□□□□□ -1.3
SNX4YJL036W YBL086CP38177 466 aa6.94□□□□□ -1.3
SNX4YJL036W YJU3P28321 313 aa6.93□□□□□ -1.3
SNX4YJL036W AAD14P42884 376 aa6.93□□□□□ -1.3
SNX4YJL036W HPF1Q05164 967 aa6.93□□□□□ -1.3
SNX4YJL036W ARG82P07250 355 aa6.92□□□□□ -1.3
SNX4YJL036W MTC5Q03897 1148 aa6.92□□□□□ -1.3
SNX4YJL036W RSC30P38781 883 aa6.91□□□□□ -1.3
SNX4YJL036W LSC2P53312 427 aa6.91□□□□□ -1.3
SNX4YJL036W UBP2Q01476 1272 aa6.89□□□□□ -1.31
SNX4YJL036W YNR021WP53723 404 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SNX4YJL036W ITT1Q04638 464 aa6.88□□□□□ -1.31
SNX4YJL036W GLC3P32775 704 aa6.87□□□□□ -1.31
SNX4YJL036W EMW1P42842 904 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
SNX4YJL036W YJR098CP47139 656 aa6.87□□□□□ -1.31
SNX4YJL036W APP1P53933 587 aa6.87□□□□□ -1.31
SNX4YJL036W DLD1P32891 587 aa6.86□□□□□ -1.31
SNX4YJL036W KTR1P27810 393 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SNX4YJL036W PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SNX4YJL036W TCB1Q12466 1186 aa6.84□□□□□ -1.31
SNX4YJL036W ROG3P43602 733 aa6.82□□□□□ -1.32
SNX4YJL036W ARG8P18544 423 aa6.81□□□□□ -1.32
SNX4YJL036W OSH7P38755 437 aa6.81□□□□□ -1.32
SNX4YJL036W FIG4P42837 879 aa6.81□□□□□ -1.32
SNX4YJL036W TY1A-MR1Q04215 440 aa6.81□□□□□ -1.32
SNX4YJL036W YPR204WQ08995 1032 aa6.79□□□□□ -1.32
SNX4YJL036W CCP1P00431 361 aa6.78□□□□□ -1.32
SNX4YJL036W MKS1P34072 584 aa6.78□□□□□ -1.32
SNX4YJL036W DFG5Q05031 458 aa6.78□□□□□ -1.32
SNX4YJL036W AIM7Q12156 149 aa6.77□□□□□ -1.33
SNX4YJL036W DPH6Q12429 685 aa6.77□□□□□ -1.33
SNX4YJL036W CSN12P47130 423 aa6.76□□□□□ -1.33
SNX4YJL036W ICP55P40051 511 aa6.74□□□□□ -1.33
SNX4YJL036W BDS1Q08347 646 aa6.73□□□□□ -1.33
SNX4YJL036W RAD59Q12223 238 aa6.73□□□□□ -1.33
SNX4YJL036W TEC1P18412 486 aa6.72□□□□□ -1.33
SNX4YJL036W FBP26P32604 452 aa6.72□□□□□ -1.33
SNX4YJL036W LYS5P50113 272 aa6.72□□□□□ -1.33
SNX4YJL036W YPR084WQ06821 456 aa6.72□□□□□ -1.33
SNX4YJL036W CDC19P00549 500 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SNX4YJL036W STE6P12866 1290 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX4YJL036W JJJ3P47138 172 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX4YJL036W PUS1Q12211 544 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SNX4YJL036W NAM8Q00539 523 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SNX4YJL036W TAF7Q05021 590 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX4YJL036W VTC4P47075 721 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX4YJL036W PHM7Q12252 991 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX4YJL036W LSB3P43603 459 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SNX4YJL036W MDJ1P35191 511 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX4YJL036W MAK16P10962 306 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SNX4YJL036W GUT2P32191 649 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX4YJL036W ISU1Q03020 165 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX4YJL036W ATG20Q07528 640 aa6.62□□□□□ -1.35
SNX4YJL036W DAL1P32375 460 aa6.61□□□□□ -1.35
SNX4YJL036W CUZ1P53899 274 aa6.61□□□□□ -1.35
SNX4YJL036W NSG2P53898 299 aa6.6□□□□□ -1.35
SNX4YJL036W SSA2P10592 639 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SNX4YJL036W NAF1P53919 492 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SNX4YJL036W FRA1Q07825 749 aa6.59□□□□□ -1.35
SNX4YJL036W YFL066CP43538 392 aa6.58□□□□□ -1.36
SNX4YJL036W DLD3P39976 496 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SNX4YJL036W STE20Q03497 939 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SNX4YJL036W RPP2BP02400 110 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SNX4YJL036W AI1P03875 834 aa6.56□□□□□ -1.36
SNX4YJL036W CEM1P39525 442 aa6.56□□□□□ -1.36
SNX4YJL036W THI72Q08579 599 aa6.56□□□□□ -1.36
SNX4YJL036W UBP15P50101 1230 aa6.54□□□□□ -1.36
SNX4YJL036W KIN1P13185 1064 aa6.53□□□□□ -1.36
SNX4YJL036W SLA1P32790 1244 aa6.52□□□□□ -1.37
SNX4YJL036W LEU3P08638 886 aa6.51□□□□□ -1.37
SNX4YJL036W DIT1P21623 536 aa6.51□□□□□ -1.37
SNX4YJL036W SSN3P39073 555 aa6.51□□□□□ -1.37
SNX4YJL036W MSN5P52918 1224 aa6.51□□□□□ -1.37
SNX4YJL036W YMR265CQ03508 461 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SNX4YJL036W SYT1Q06836 1226 aa6.51□□□□□ -1.37
SNX4YJL036W WTM2Q12206 467 aa6.51□□□□□ -1.37
SNX4YJL036W CCT8P47079 568 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SNX4YJL036W TY1A-DR3Q12441 440 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX4YJL036W APL6P46682 809 aa6.49□□□□□ -1.37
SNX4YJL036W MRX12P47084 519 aa6.49□□□□□ -1.37
SNX4YJL036W ISR1Q06098 443 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SNX4YJL036W SPT2P06843 333 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SNX4YJL036W CSE4P36012 229 aa6.47□□□□□ -1.37
SNX4YJL036W LEO1P38439 464 aa6.47□□□□□ -1.37
SNX4YJL036W EMP47P43555 445 aa6.47□□□□□ -1.37
SNX4YJL036W KRE33P53914 1056 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SNX4YJL036W ADE12P80210 433 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SNX4YJL036W YDR461C-AQ2V2P7 80 aa6.47□□□□□ -1.37
SNX4YJL036W YPR053CQ6Q5F3 151 aa6.47□□□□□ -1.37
SNX4YJL036W DAT1P13483 248 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SNX4YJL036W ISF1P32488 338 aa6.46□□□□□ -1.38
SNX4YJL036W UTR2P32623 467 aa6.46□□□□□ -1.38
SNX4YJL036W RPN1P38764 993 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SNX4YJL036W MCM16Q12262 181 aa6.45□□□□□ -1.38
SNX4YJL036W AHP1P38013 176 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SNX4YJL036W SBE2P42223 864 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SNX4YJL036W SPT5P27692 1063 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SNX4YJL036W HAL5P38970 855 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
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