RNA–Protein interactions for RNA: YJL033W

HCA4, Transcript of DEAD box RNA helicase, yeastyeast

Gene HCA4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCA4YJL033W KIP2P28743 706 aa6.21□□□□□ -1.41
HCA4YJL033W YPP1P46951 817 aa6.2□□□□□ -1.42
HCA4YJL033W HED1Q03937 162 aa6.2□□□□□ -1.42
HCA4YJL033W GUT2P32191 649 aa6.2□□□□□ -1.42
HCA4YJL033W IXR1P33417 597 aa6.19□□□□□ -1.42
HCA4YJL033W RTG2P32608 588 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
HCA4YJL033W MCM16Q12262 181 aa6.19□□□□□ -1.42
HCA4YJL033W ENO2P00925 437 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
HCA4YJL033W STE20Q03497 939 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
HCA4YJL033W YPR084WQ06821 456 aa6.17□□□□□ -1.42
HCA4YJL033W MRX12P47084 519 aa6.17□□□□□ -1.42
HCA4YJL033W FRA1Q07825 749 aa6.17□□□□□ -1.42
HCA4YJL033W EMP47P43555 445 aa6.15□□□□□ -1.42
HCA4YJL033W RIM21P48565 533 aa6.15□□□□□ -1.42
HCA4YJL033W ISF1P32488 338 aa6.14□□□□□ -1.43
HCA4YJL033W CLA4P48562 842 aa6.14□□□□□ -1.43
HCA4YJL033W YPR204WQ08995 1032 aa6.14□□□□□ -1.43
HCA4YJL033W CDC4P07834 779 aa6.13□□□□□ -1.43
HCA4YJL033W ATG3P40344 310 aa6.12□□□□□ -1.43
HCA4YJL033W MRX10Q05648 414 aa6.12□□□□□ -1.43
HCA4YJL033W ENO1P00924 437 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
HCA4YJL033W MRT4P33201 236 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
HCA4YJL033W AIR1P40507 360 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
HCA4YJL033W EMW1P42842 904 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
HCA4YJL033W ENV9Q08651 330 aa6.11□□□□□ -1.43
HCA4YJL033W ITT1Q04638 464 aa6.1□□□□□ -1.43
HCA4YJL033W SIS2P36024 562 aa6.1□□□□□ -1.43
HCA4YJL033W MET32Q12041 191 aa6.1□□□□□ -1.43
HCA4YJL033W APP1P53933 587 aa6.09□□□□□ -1.43
HCA4YJL033W UTP13Q05946 817 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
HCA4YJL033W RTT106P40161 455 aa6.09□□□□□ -1.43
HCA4YJL033W APL6P46682 809 aa6.09□□□□□ -1.43
HCA4YJL033W ATG20Q07528 640 aa6.08□□□□□ -1.44
HCA4YJL033W TRK1P12685 1235 aa6.08□□□□□ -1.44
HCA4YJL033W HST3P53687 447 aa6.08□□□□□ -1.44
HCA4YJL033W RDS2P19541 446 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
HCA4YJL033W AFT1P22149 690 aa6.07□□□□□ -1.44
HCA4YJL033W ASH1P34233 588 aa6.06□□□□□ -1.44
HCA4YJL033W TTI1P36097 1038 aa6.06□□□□□ -1.44
HCA4YJL033W YBL086CP38177 466 aa6.05□□□□□ -1.44
HCA4YJL033W MKS1P34072 584 aa6.05□□□□□ -1.44
HCA4YJL033W SOH1P38633 127 aa6.05□□□□□ -1.44
HCA4YJL033W SRC1Q03707 834 aa6.05□□□□□ -1.44
HCA4YJL033W UGA3P26370 528 aa6.04□□□□□ -1.44
HCA4YJL033W FBP26P32604 452 aa6.04□□□□□ -1.44
HCA4YJL033W PEP12P32854 288 aa6.04□□□□□ -1.44
HCA4YJL033W MSB3P48566 633 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
HCA4YJL033W ISR1Q06098 443 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
HCA4YJL033W SSA4P22202 642 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
HCA4YJL033W CPS1P27614 576 aa6.02□□□□□ -1.45
HCA4YJL033W ISU1Q03020 165 aa6.02□□□□□ -1.45
HCA4YJL033W RPP2BP02400 110 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
HCA4YJL033W BDS1Q08347 646 aa6□□□□□ -1.45
HCA4YJL033W STE6P12866 1290 aa6□□□□□ -1.45
HCA4YJL033W HAL5P38970 855 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
HCA4YJL033W GCR2Q01722 534 aa6□□□□□ -1.45
HCA4YJL033W DFG5Q05031 458 aa6□□□□□ -1.45
HCA4YJL033W TGL4P36165 910 aa5.99□□□□□ -1.45
HCA4YJL033W KTR7P40504 517 aa5.98□□□□□ -1.45
HCA4YJL033W HDA3Q06623 655 aa5.98□□□□□ -1.45
HCA4YJL033W SPT2P06843 333 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
HCA4YJL033W BRE2P43132 505 aa5.98□□□□□ -1.45
HCA4YJL033W YFL034WP43564 1073 aa5.98□□□□□ -1.45
HCA4YJL033W YJR115WP47152 169 aa5.98□□□□□ -1.45
HCA4YJL033W CBC2Q08920 208 aaKnown RBP RIP-Chip data5.98□□□□□ -1.45not detected
HCA4YJL033W SRF1Q12516 437 aa5.98□□□□□ -1.45
HCA4YJL033W ARG82P07250 355 aa5.97□□□□□ -1.45
HCA4YJL033W MIP1P15801 1254 aa5.97□□□□□ -1.45
HCA4YJL033W UTR2P32623 467 aa5.97□□□□□ -1.45
HCA4YJL033W SUB2Q07478 446 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
HCA4YJL033W TSC13Q99190 310 aa5.97□□□□□ -1.45
HCA4YJL033W SGS1P35187 1447 aa5.96□□□□□ -1.46
HCA4YJL033W PTK2P47116 818 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
HCA4YJL033W GAL2P13181 574 aa5.96□□□□□ -1.46
HCA4YJL033W DAT1P13483 248 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
HCA4YJL033W PHO87P25360 923 aa5.96□□□□□ -1.46
HCA4YJL033W TBS1P38114 1094 aa5.96□□□□□ -1.46
HCA4YJL033W HAP4P14064 554 aa5.95□□□□□ -1.46
HCA4YJL033W AIM9P40053 627 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
HCA4YJL033W PUP1P25043 261 aa5.94□□□□□ -1.46
HCA4YJL033W DLD3P39976 496 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
HCA4YJL033W AAD14P42884 376 aa5.94□□□□□ -1.46
HCA4YJL033W ECM23Q02710 187 aa5.94□□□□□ -1.46
HCA4YJL033W PDI1P17967 522 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
HCA4YJL033W WTM2Q12206 467 aa5.93□□□□□ -1.46
HCA4YJL033W ACS2P52910 683 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
HCA4YJL033W NOB1Q08444 459 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
HCA4YJL033W SLX8P40072 274 aa5.92□□□□□ -1.46
HCA4YJL033W NUP85P46673 744 aa5.92□□□□□ -1.46
HCA4YJL033W GAS4Q08271 471 aa5.92□□□□□ -1.46
HCA4YJL033W NTH2P35172 780 aa5.91□□□□□ -1.46
HCA4YJL033W SWI5P08153 709 aa5.9□□□□□ -1.46
HCA4YJL033W SSA1P10591 642 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
HCA4YJL033W RPS6AP0CX37 236 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
HCA4YJL033W RPS6BP0CX38 236 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
HCA4YJL033W UBX7P38349 436 aa5.9□□□□□ -1.47
HCA4YJL033W LSC2P53312 427 aa5.9□□□□□ -1.47
HCA4YJL033W ROM1P53046 1155 aa5.88□□□□□ -1.47
HCA4YJL033W YML083CQ04526 418 aa5.88□□□□□ -1.47
HCA4YJL033W YLR346CQ06139 101 aa5.88□□□□□ -1.47
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