RNA–Protein interactions for RNA: YHR143W-A

RPC10, Transcript of RNA polymerase subunit ABC10-alpha, found in RNA pol I, II, and III, yeastyeast

Gene RPC10, Length 213 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPC10YHR143W-A CLA4P48562 842 aa4.63□□□□□ -1.67
RPC10YHR143W-A MCM16Q12262 181 aa4.63□□□□□ -1.67
RPC10YHR143W-A SUP45P12385 437 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
RPC10YHR143W-A AIR1P40507 360 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
RPC10YHR143W-A MRX12P47084 519 aa4.62□□□□□ -1.67
RPC10YHR143W-A SRC1Q03707 834 aa4.62□□□□□ -1.67
RPC10YHR143W-A YPR084WQ06821 456 aa4.62□□□□□ -1.67
RPC10YHR143W-A MRT4P33201 236 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
RPC10YHR143W-A ATG32P40458 529 aa4.61□□□□□ -1.67
RPC10YHR143W-A YNL108CP53929 270 aa4.61□□□□□ -1.67
RPC10YHR143W-A STE20Q03497 939 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
RPC10YHR143W-A FRA1Q07825 749 aa4.61□□□□□ -1.67
RPC10YHR143W-A YDJ1P25491 409 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RPC10YHR143W-A RTT106P40161 455 aa4.6□□□□□ -1.67
RPC10YHR143W-A MET32Q12041 191 aa4.6□□□□□ -1.67
RPC10YHR143W-A ENO2P00925 437 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RPC10YHR143W-A TIF1P10081 395 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RPC10YHR143W-A AFT1P22149 690 aa4.59□□□□□ -1.67
RPC10YHR143W-A ATG3P40344 310 aa4.59□□□□□ -1.67
RPC10YHR143W-A HST3P53687 447 aa4.59□□□□□ -1.67
RPC10YHR143W-A EMW1P42842 904 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RPC10YHR143W-A EMP47P43555 445 aa4.58□□□□□ -1.68
RPC10YHR143W-A RIM21P48565 533 aa4.58□□□□□ -1.68
RPC10YHR143W-A MSB3P48566 633 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RPC10YHR143W-A ISF1P32488 338 aa4.56□□□□□ -1.68
RPC10YHR143W-A RTG2P32608 588 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RPC10YHR143W-A ASH1P34233 588 aa4.56□□□□□ -1.68
RPC10YHR143W-A BRE2P43132 505 aa4.56□□□□□ -1.68
RPC10YHR143W-A APL6P46682 809 aa4.56□□□□□ -1.68
RPC10YHR143W-A APP1P53933 587 aa4.56□□□□□ -1.68
RPC10YHR143W-A MKS1P34072 584 aa4.55□□□□□ -1.68
RPC10YHR143W-A SIS2P36024 562 aa4.55□□□□□ -1.68
RPC10YHR143W-A YBL086CP38177 466 aa4.55□□□□□ -1.68
RPC10YHR143W-A ITT1Q04638 464 aa4.55□□□□□ -1.68
RPC10YHR143W-A UTP13Q05946 817 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RPC10YHR143W-A YPR204WQ08995 1032 aa4.55□□□□□ -1.68
RPC10YHR143W-A RLF2Q12495 606 aa4.55□□□□□ -1.68
RPC10YHR143W-A UGA3P26370 528 aa4.54□□□□□ -1.68
RPC10YHR143W-A FBP26P32604 452 aa4.54□□□□□ -1.68
RPC10YHR143W-A GCR2Q01722 534 aa4.54□□□□□ -1.68
RPC10YHR143W-A MRX10Q05648 414 aa4.54□□□□□ -1.68
RPC10YHR143W-A ATG20Q07528 640 aa4.54□□□□□ -1.68
RPC10YHR143W-A ENO1P00924 437 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RPC10YHR143W-A TAF7Q05021 590 aa4.53□□□□□ -1.68
RPC10YHR143W-A RPP2BP02400 110 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RPC10YHR143W-A ENV9Q08651 330 aa4.52□□□□□ -1.69
RPC10YHR143W-A RDS2P19541 446 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
RPC10YHR143W-A SOH1P38633 127 aa4.51□□□□□ -1.69
RPC10YHR143W-A ISU1Q03020 165 aa4.51□□□□□ -1.69
RPC10YHR143W-A ISR1Q06098 443 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
RPC10YHR143W-A ARG82P07250 355 aa4.5□□□□□ -1.69
RPC10YHR143W-A STE6P12866 1290 aa4.5□□□□□ -1.69
RPC10YHR143W-A PTK2P47116 818 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RPC10YHR143W-A YJR115WP47152 169 aa4.5□□□□□ -1.69
RPC10YHR143W-A DFG5Q05031 458 aa4.5□□□□□ -1.69
RPC10YHR143W-A SRF1Q12516 437 aa4.5□□□□□ -1.69
RPC10YHR143W-A SPT2P06843 333 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RPC10YHR143W-A PEP12P32854 288 aa4.49□□□□□ -1.69
RPC10YHR143W-A HAL5P38970 855 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RPC10YHR143W-A AAD14P42884 376 aa4.49□□□□□ -1.69
RPC10YHR143W-A BDS1Q08347 646 aa4.49□□□□□ -1.69
RPC10YHR143W-A UTR2P32623 467 aa4.48□□□□□ -1.69
RPC10YHR143W-A TTI1P36097 1038 aa4.48□□□□□ -1.69
RPC10YHR143W-A YFL034WP43564 1073 aa4.47□□□□□ -1.69
RPC10YHR143W-A NUP85P46673 744 aa4.47□□□□□ -1.69
RPC10YHR143W-A TBS1P38114 1094 aa4.46□□□□□ -1.7
RPC10YHR143W-A DLD3P39976 496 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
RPC10YHR143W-A MIP1P15801 1254 aa4.45□□□□□ -1.7
RPC10YHR143W-A SSA4P22202 642 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
RPC10YHR143W-A LSC2P53312 427 aa4.45□□□□□ -1.7
RPC10YHR143W-A HDA3Q06623 655 aa4.45□□□□□ -1.7
RPC10YHR143W-A WTM2Q12206 467 aa4.45□□□□□ -1.7
RPC10YHR143W-A DAT1P13483 248 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
RPC10YHR143W-A PHO87P25360 923 aa4.44□□□□□ -1.7
RPC10YHR143W-A CPS1P27614 576 aa4.44□□□□□ -1.7
RPC10YHR143W-A TGL4P36165 910 aa4.44□□□□□ -1.7
RPC10YHR143W-A AIM9P40053 627 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
RPC10YHR143W-A YLR346CQ06139 101 aa4.44□□□□□ -1.7
RPC10YHR143W-A CBC2Q08920 208 aaKnown RBP RIP-Chip data4.44□□□□□ -1.7not detected
RPC10YHR143W-A HAP4P14064 554 aa4.43□□□□□ -1.7
RPC10YHR143W-A SLX8P40072 274 aa4.43□□□□□ -1.7
RPC10YHR143W-A KTR7P40504 517 aa4.43□□□□□ -1.7
RPC10YHR143W-A YJR098CP47139 656 aa4.43□□□□□ -1.7
RPC10YHR143W-A TSC13Q99190 310 aa4.43□□□□□ -1.7
RPC10YHR143W-A GAL2P13181 574 aa4.42□□□□□ -1.7
RPC10YHR143W-A MET22P32179 357 aa4.42□□□□□ -1.7
RPC10YHR143W-A GLY1P37303 387 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
RPC10YHR143W-A LCB5Q06147 687 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
RPC10YHR143W-A SWI5P08153 709 aa4.41□□□□□ -1.7
RPC10YHR143W-A DLD1P32891 587 aa4.41□□□□□ -1.7
RPC10YHR143W-A VTC4P47075 721 aa4.41□□□□□ -1.7
RPC10YHR143W-A YDR444WQ04093 687 aa4.41□□□□□ -1.7
RPC10YHR143W-A GAS4Q08271 471 aa4.41□□□□□ -1.7
RPC10YHR143W-A RPS6AP0CX37 236 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
RPC10YHR143W-A RPS6BP0CX38 236 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
RPC10YHR143W-A PDI1P17967 522 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
RPC10YHR143W-A PUP1P25043 261 aa4.4□□□□□ -1.71
RPC10YHR143W-A ACS2P52910 683 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
RPC10YHR143W-A UBP2Q01476 1272 aa4.4□□□□□ -1.71
RPC10YHR143W-A OPT2Q06593 877 aa4.4□□□□□ -1.71
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