RNA–Protein interactions for RNA: YER128W

VFA1, Transcript of Protein that interacts with Vps4p and has a role in vacuolar sorting, yeastyeast

Gene VFA1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1YER128W YIR007WP40566 764 aa6.34□□□□□ -1.39
VFA1YER128W TRK2P28584 889 aa6.33□□□□□ -1.4
VFA1YER128W TY1A-BLQ12266 440 aa6.33□□□□□ -1.4
VFA1YER128W YJU3P28321 313 aa6.32□□□□□ -1.4
VFA1YER128W LSC2P53312 427 aa6.32□□□□□ -1.4
VFA1YER128W YBL086CP38177 466 aa6.31□□□□□ -1.4
VFA1YER128W AAD14P42884 376 aa6.31□□□□□ -1.4
VFA1YER128W UBP2Q01476 1272 aa6.31□□□□□ -1.4
VFA1YER128W GLC3P32775 704 aa6.3□□□□□ -1.4
VFA1YER128W YNR021WP53723 404 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
VFA1YER128W MTC5Q03897 1148 aa6.3□□□□□ -1.4
VFA1YER128W HPF1Q05164 967 aa6.3□□□□□ -1.4
VFA1YER128W APP1P53933 587 aa6.29□□□□□ -1.4
VFA1YER128W RSC30P38781 883 aa6.27□□□□□ -1.41
VFA1YER128W PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
VFA1YER128W DLD1P32891 587 aa6.26□□□□□ -1.41
VFA1YER128W YJR098CP47139 656 aa6.26□□□□□ -1.41
VFA1YER128W ITT1Q04638 464 aa6.26□□□□□ -1.41
VFA1YER128W ARG8P18544 423 aa6.25□□□□□ -1.41
VFA1YER128W EMW1P42842 904 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
VFA1YER128W TCB1Q12466 1186 aa6.25□□□□□ -1.41
VFA1YER128W KTR1P27810 393 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
VFA1YER128W ROG3P43602 733 aa6.21□□□□□ -1.42
VFA1YER128W YPR204WQ08995 1032 aa6.21□□□□□ -1.42
VFA1YER128W MKS1P34072 584 aa6.2□□□□□ -1.42
VFA1YER128W OSH7P38755 437 aa6.2□□□□□ -1.42
VFA1YER128W FIG4P42837 879 aa6.2□□□□□ -1.42
VFA1YER128W AIM7Q12156 149 aa6.2□□□□□ -1.42
VFA1YER128W CSN12P47130 423 aa6.19□□□□□ -1.42
VFA1YER128W TY1A-MR1Q04215 440 aa6.19□□□□□ -1.42
VFA1YER128W DFG5Q05031 458 aa6.19□□□□□ -1.42
VFA1YER128W DPH6Q12429 685 aa6.18□□□□□ -1.42
VFA1YER128W TEC1P18412 486 aa6.16□□□□□ -1.42
VFA1YER128W BDS1Q08347 646 aa6.16□□□□□ -1.42
VFA1YER128W RAD59Q12223 238 aa6.15□□□□□ -1.42
VFA1YER128W ICP55P40051 511 aa6.14□□□□□ -1.43
VFA1YER128W CCP1P00431 361 aa6.13□□□□□ -1.43
VFA1YER128W FBP26P32604 452 aa6.13□□□□□ -1.43
VFA1YER128W LYS5P50113 272 aa6.13□□□□□ -1.43
VFA1YER128W PUS1Q12211 544 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
VFA1YER128W STE6P12866 1290 aa6.1□□□□□ -1.43
VFA1YER128W YPR084WQ06821 456 aa6.1□□□□□ -1.43
VFA1YER128W JJJ3P47138 172 aa6.09□□□□□ -1.43
VFA1YER128W CDC19P00549 500 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
VFA1YER128W GUT2P32191 649 aa6.08□□□□□ -1.44
VFA1YER128W PHM7Q12252 991 aa6.08□□□□□ -1.44
VFA1YER128W VTC4P47075 721 aa6.07□□□□□ -1.44
VFA1YER128W NAM8Q00539 523 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
VFA1YER128W SSA2P10592 639 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
VFA1YER128W LSB3P43603 459 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
VFA1YER128W ISU1Q03020 165 aa6.06□□□□□ -1.44
VFA1YER128W ATG20Q07528 640 aa6.06□□□□□ -1.44
VFA1YER128W RPP2BP02400 110 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
VFA1YER128W MAK16P10962 306 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
VFA1YER128W MDJ1P35191 511 aa6.04□□□□□ -1.44
VFA1YER128W DLD3P39976 496 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
VFA1YER128W NSG2P53898 299 aa6.03□□□□□ -1.44
VFA1YER128W DAL1P32375 460 aa6.02□□□□□ -1.45
VFA1YER128W CUZ1P53899 274 aa6.02□□□□□ -1.45
VFA1YER128W NAF1P53919 492 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
VFA1YER128W STE20Q03497 939 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
VFA1YER128W CEM1P39525 442 aa6□□□□□ -1.45
VFA1YER128W FRA1Q07825 749 aa6□□□□□ -1.45
VFA1YER128W THI72Q08579 599 aa6□□□□□ -1.45
VFA1YER128W AI1P03875 834 aa5.99□□□□□ -1.45
VFA1YER128W KIN1P13185 1064 aa5.98□□□□□ -1.45
VFA1YER128W UBP15P50101 1230 aa5.96□□□□□ -1.46
VFA1YER128W MSN5P52918 1224 aa5.95□□□□□ -1.46
VFA1YER128W YMR265CQ03508 461 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
VFA1YER128W WTM2Q12206 467 aa5.95□□□□□ -1.46
VFA1YER128W DIT1P21623 536 aa5.94□□□□□ -1.46
VFA1YER128W YFL066CP43538 392 aa5.94□□□□□ -1.46
VFA1YER128W MRX12P47084 519 aa5.94□□□□□ -1.46
VFA1YER128W ISR1Q06098 443 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
VFA1YER128W DAT1P13483 248 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
VFA1YER128W CSE4P36012 229 aa5.93□□□□□ -1.46
VFA1YER128W ADE12P80210 433 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
VFA1YER128W UTR2P32623 467 aa5.92□□□□□ -1.46
VFA1YER128W AHP1P38013 176 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
VFA1YER128W SSN3P39073 555 aa5.92□□□□□ -1.46
VFA1YER128W EMP47P43555 445 aa5.92□□□□□ -1.46
VFA1YER128W KRE33P53914 1056 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
VFA1YER128W SYT1Q06836 1226 aa5.92□□□□□ -1.46
VFA1YER128W SPT2P06843 333 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
VFA1YER128W ISF1P32488 338 aa5.91□□□□□ -1.46
VFA1YER128W SLA1P32790 1244 aa5.91□□□□□ -1.46
VFA1YER128W YPR053CQ6Q5F3 151 aa5.91□□□□□ -1.46
VFA1YER128W TBS1P38114 1094 aa5.9□□□□□ -1.46
VFA1YER128W CCT8P47079 568 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
VFA1YER128W MCM16Q12262 181 aa5.9□□□□□ -1.46
VFA1YER128W SPT5P27692 1063 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
VFA1YER128W TY1A-DR3Q12441 440 aa5.89□□□□□ -1.47
VFA1YER128W YDR461C-AQ2V2P7 80 aa5.89□□□□□ -1.47
VFA1YER128W GUA1P38625 525 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
VFA1YER128W APL6P46682 809 aa5.88□□□□□ -1.47
VFA1YER128W YBL036CP38197 257 aa5.87□□□□□ -1.47
VFA1YER128W UTP7P40055 554 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
VFA1YER128W ALA1P40825 983 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
VFA1YER128W SBE2P42223 864 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
VFA1YER128W NRD1P53617 575 aaKnown RBP RIP-Chip data5.86□□□□□ -1.47 RIP-Chip
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.4 ms