RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641549.1

PTPRVP-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

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Gene PTPRVP, Length 5,067 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-205ENST00000641549 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
PTPRVP-205ENST00000641549 SYNJ1O43426 1573 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRVP-205ENST00000641549 HMMRO75330 724 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRVP-205ENST00000641549 NGEFQ8N5V2 710 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRVP-205ENST00000641549 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
PTPRVP-205ENST00000641549 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRVP-205ENST00000641549 SYNJ2O15056 1496 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRVP-205ENST00000641549 TOP2BQ02880 1626 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRVP-205ENST00000641549 PRDM2Q13029 1718 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRVP-205ENST00000641549 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP16.97■□□□□ 0.31
PTPRVP-205ENST00000641549 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRVP-205ENST00000641549 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP16.96■□□□□ 0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 COG3Q96JB2 828 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 TOPBP1Q92547 1522 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 PRXQ9BXM0 1461 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 CCDC146Q8IYE0 955 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 MIA2Q96PC5 1412 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 ARAP1Q96P48 1450 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 FAM69CQ0P6D2 419 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 PTMSP20962 102 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 E9PSI1 815 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 GPATCH3Q96I76 525 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 ZBED9Q6R2W3 1325 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 APBB1O00213 710 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 NESP48681 1621 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 ARHGAP5Q13017 1502 aa16.89■□□□□ 0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 NRDCO43847 1150 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRVP-205ENST00000641549 DNMBPQ6XZF7 1577 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRVP-205ENST00000641549 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
PTPRVP-205ENST00000641549 TPRNQ4KMQ1 711 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRVP-205ENST00000641549 NUTM2FA1L443 756 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRVP-205ENST00000641549 GBP4Q96PP9 640 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRVP-205ENST00000641549 CCDC7Q96M83 1385 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRVP-205ENST00000641549 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
PTPRVP-205ENST00000641549 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
PTPRVP-205ENST00000641549 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
PTPRVP-205ENST00000641549 HFM1A2PYH4 1435 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRVP-205ENST00000641549 CLUAP1Q96AJ1 413 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRVP-205ENST00000641549 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
PTPRVP-205ENST00000641549 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.29
PTPRVP-205ENST00000641549 SLC4A10Q6U841 1118 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRVP-205ENST00000641549 HECW1Q76N89 1606 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRVP-205ENST00000641549 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
PTPRVP-205ENST00000641549 GORABQ5T7V8 394 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRVP-205ENST00000641549 PLCB2Q00722 1185 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRVP-205ENST00000641549 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRVP-205ENST00000641549 TAF7LQ5H9L4 462 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRVP-205ENST00000641549 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
PTPRVP-205ENST00000641549 C1orf141Q5JVX7 400 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRVP-205ENST00000641549 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
PTPRVP-205ENST00000641549 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
PTPRVP-205ENST00000641549 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
PTPRVP-205ENST00000641549 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
PTPRVP-205ENST00000641549 KIF7Q2M1P5 1343 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRVP-205ENST00000641549 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRVP-205ENST00000641549 TAOK2Q9UL54 1235 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRVP-205ENST00000641549 CNTLNQ9NXG0 1405 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRVP-205ENST00000641549 AFAP1Q8N556 730 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRVP-205ENST00000641549 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
PTPRVP-205ENST00000641549 CHMP3Q9Y3E7 222 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRVP-205ENST00000641549 C9orf84Q5VXU9 1444 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRVP-205ENST00000641549 RRP1P56182 461 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
PTPRVP-205ENST00000641549 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRVP-205ENST00000641549 TEFQ10587 303 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRVP-205ENST00000641549 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP16.77■□□□□ 0.282e-6■■■□□ 15.2
PTPRVP-205ENST00000641549 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRVP-205ENST00000641549 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRVP-205ENST00000641549 APAF1O14727 1248 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRVP-205ENST00000641549 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRVP-205ENST00000641549 TIAM1Q13009 1591 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRVP-205ENST00000641549 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PTPRVP-205ENST00000641549 RUNDC1Q96C34 613 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRVP-205ENST00000641549 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRVP-205ENST00000641549 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRVP-205ENST00000641549 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
PTPRVP-205ENST00000641549 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
PTPRVP-205ENST00000641549 WASHC2AQ641Q2 1341 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRVP-205ENST00000641549 PSME1Q06323 249 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRVP-205ENST00000641549 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
PTPRVP-205ENST00000641549 DDX19BQ9UMR2 479 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRVP-205ENST00000641549 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
PTPRVP-205ENST00000641549 RIPK4P57078 832 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRVP-205ENST00000641549 AAMPQ13685 434 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRVP-205ENST00000641549 ROCK1Q13464 1354 aa16.71■□□□□ 0.26
PTPRVP-205ENST00000641549 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
PTPRVP-205ENST00000641549 EVA1CP58658 441 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRVP-205ENST00000641549 BICRAQ9NZM4 1560 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRVP-205ENST00000641549 ST18O60284 1047 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRVP-205ENST00000641549 NEXNQ0ZGT2 675 aa16.7■□□□□ 0.26
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