RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591598.5

CTDP1-207, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTDP1, Length 3,228 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-207ENST00000591598 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CTDP1-207ENST00000591598 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.66■■□□□ 1.22
CTDP1-207ENST00000591598 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.64■■□□□ 1.21
CTDP1-207ENST00000591598 CHD1O14646 1710 aa22.64■■□□□ 1.21
CTDP1-207ENST00000591598 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.64■■□□□ 1.21
CTDP1-207ENST00000591598 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.63■■□□□ 1.21
CTDP1-207ENST00000591598 AFAP1Q8N556 730 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDP1-207ENST00000591598 NUDCQ9Y266 331 aa22.61■■□□□ 1.21
CTDP1-207ENST00000591598 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CTDP1-207ENST00000591598 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDP1-207ENST00000591598 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.21
CTDP1-207ENST00000591598 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.59■■□□□ 1.21
CTDP1-207ENST00000591598 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
CTDP1-207ENST00000591598 PREX2Q70Z35 1606 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDP1-207ENST00000591598 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
CTDP1-207ENST00000591598 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDP1-207ENST00000591598 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.55■■□□□ 1.2
CTDP1-207ENST00000591598 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.55■■□□□ 1.2
CTDP1-207ENST00000591598 PLA2R1Q13018 1463 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDP1-207ENST00000591598 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDP1-207ENST00000591598 PANK3Q9H999 370 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDP1-207ENST00000591598 RALBP1Q15311 655 aa22.53■■□□□ 1.2
CTDP1-207ENST00000591598 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.53■■□□□ 1.2
CTDP1-207ENST00000591598 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
CTDP1-207ENST00000591598 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
CTDP1-207ENST00000591598 MSH5O43196 834 aa22.51■■□□□ 1.19
CTDP1-207ENST00000591598 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.51■■□□□ 1.19
CTDP1-207ENST00000591598 A2MP01023 1474 aa22.5■■□□□ 1.19
CTDP1-207ENST00000591598 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
CTDP1-207ENST00000591598 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.5■■□□□ 1.19
CTDP1-207ENST00000591598 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.49■■□□□ 1.19
CTDP1-207ENST00000591598 ABCC2Q92887 1545 aa22.49■■□□□ 1.19
CTDP1-207ENST00000591598 NLRP13Q86W25 1043 aa22.49■■□□□ 1.19
CTDP1-207ENST00000591598 TMF1P82094 1093 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDP1-207ENST00000591598 TESK2Q96S53 571 aa22.46■■□□□ 1.19
CTDP1-207ENST00000591598 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.19
CTDP1-207ENST00000591598 KIF3BO15066 747 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDP1-207ENST00000591598 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDP1-207ENST00000591598 PLCH2O75038 1416 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDP1-207ENST00000591598 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CTDP1-207ENST00000591598 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDP1-207ENST00000591598 ERBINQ96RT1 1412 aa22.39■■□□□ 1.18
CTDP1-207ENST00000591598 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDP1-207ENST00000591598 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CTDP1-207ENST00000591598 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.37■■□□□ 1.17
CTDP1-207ENST00000591598 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.37■■□□□ 1.17
CTDP1-207ENST00000591598 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CTDP1-207ENST00000591598 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDP1-207ENST00000591598 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDP1-207ENST00000591598 PLIN1O60240 522 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDP1-207ENST00000591598 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
CTDP1-207ENST00000591598 SHROOM2Q13796 1616 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDP1-207ENST00000591598 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.35■■□□□ 1.17
CTDP1-207ENST00000591598 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CTDP1-207ENST00000591598 UNC13BO14795 1591 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDP1-207ENST00000591598 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.33■■□□□ 1.16
CTDP1-207ENST00000591598 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.33■■□□□ 1.16
CTDP1-207ENST00000591598 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
CTDP1-207ENST00000591598 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDP1-207ENST00000591598 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
CTDP1-207ENST00000591598 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDP1-207ENST00000591598 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDP1-207ENST00000591598 BCL11AQ9H165 835 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDP1-207ENST00000591598 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDP1-207ENST00000591598 PLXNC1O60486 1568 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDP1-207ENST00000591598 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDP1-207ENST00000591598 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDP1-207ENST00000591598 ABCC1P33527 1531 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDP1-207ENST00000591598 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.16
CTDP1-207ENST00000591598 KANK1Q14678 1352 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDP1-207ENST00000591598 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CTDP1-207ENST00000591598 GGT6Q6P531 493 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDP1-207ENST00000591598 FANCAO15360 1455 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDP1-207ENST00000591598 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CTDP1-207ENST00000591598 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDP1-207ENST00000591598 E9PCH4 1651 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDP1-207ENST00000591598 PPP2R1AP30153 589 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDP1-207ENST00000591598 ATP10AO60312 1499 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDP1-207ENST00000591598 SKAP1Q86WV1 359 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDP1-207ENST00000591598 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDP1-207ENST00000591598 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CTDP1-207ENST00000591598 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDP1-207ENST00000591598 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
CTDP1-207ENST00000591598 PDE3BQ13370 1112 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDP1-207ENST00000591598 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDP1-207ENST00000591598 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CTDP1-207ENST00000591598 ADGRL1O94910 1474 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDP1-207ENST00000591598 CDCA8Q53HL2 280 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDP1-207ENST00000591598 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CTDP1-207ENST00000591598 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDP1-207ENST00000591598 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDP1-207ENST00000591598 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDP1-207ENST00000591598 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CTDP1-207ENST00000591598 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDP1-207ENST00000591598 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDP1-207ENST00000591598 NBR1Q14596 966 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDP1-207ENST00000591598 CRBNQ96SW2 442 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDP1-207ENST00000591598 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDP1-207ENST00000591598 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CTDP1-207ENST00000591598 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
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