RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461018.5

CNN3-204, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNN3, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-204ENST00000461018 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CNN3-204ENST00000461018 CLASP1Q7Z460 1538 aa8.65□□□□□ -1.02
CNN3-204ENST00000461018 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CNN3-204ENST00000461018 DMRTA1Q5VZB9 504 aa8.65□□□□□ -1.02
CNN3-204ENST00000461018 PSEN2P49810 448 aa8.64□□□□□ -1.03
CNN3-204ENST00000461018 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa8.64□□□□□ -1.03
CNN3-204ENST00000461018 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CNN3-204ENST00000461018 KCNH8Q96L42 1107 aa8.63□□□□□ -1.03
CNN3-204ENST00000461018 TBC1D12O60347 775 aa8.62□□□□□ -1.03
CNN3-204ENST00000461018 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CNN3-204ENST00000461018 TOPBP1Q92547 1522 aa8.62□□□□□ -1.03
CNN3-204ENST00000461018 GAPVD1Q14C86 1478 aa8.62□□□□□ -1.03
CNN3-204ENST00000461018 FOXK1P85037 733 aa8.6□□□□□ -1.03
CNN3-204ENST00000461018 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CNN3-204ENST00000461018 KIF13AQ9H1H9 1805 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-204ENST00000461018 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CNN3-204ENST00000461018 PLPP6Q8IY26 295 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-204ENST00000461018 ERCC6L2Q5T890 1561 aa8.59□□□□□ -1.03
CNN3-204ENST00000461018 RGS20O76081 388 aa8.58□□□□□ -1.04
CNN3-204ENST00000461018 ILDR2Q71H61 639 aa8.58□□□□□ -1.04
CNN3-204ENST00000461018 FBXO41Q8TF61 875 aa8.58□□□□□ -1.04
CNN3-204ENST00000461018 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CNN3-204ENST00000461018 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CNN3-204ENST00000461018 CFAP44Q96MT7 982 aa8.57□□□□□ -1.04
CNN3-204ENST00000461018 KCNK17Q96T54 332 aa8.56□□□□□ -1.04
CNN3-204ENST00000461018 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CNN3-204ENST00000461018 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa8.56□□□□□ -1.04
CNN3-204ENST00000461018 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa8.56□□□□□ -1.04
CNN3-204ENST00000461018 PTPN5P54829 565 aa8.55□□□□□ -1.04
CNN3-204ENST00000461018 IFFO2Q5TF58 517 aa8.55□□□□□ -1.04
CNN3-204ENST00000461018 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa8.55□□□□□ -1.04
CNN3-204ENST00000461018 HECW2Q9P2P5 1572 aa8.55□□□□□ -1.04
CNN3-204ENST00000461018 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CNN3-204ENST00000461018 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa8.54□□□□□ -1.04
CNN3-204ENST00000461018 DSG2Q14126 1118 aa8.53□□□□□ -1.04
CNN3-204ENST00000461018 SYNJ1O43426 1573 aa8.52□□□□□ -1.04
CNN3-204ENST00000461018 LMTK3Q96Q04 1460 aa8.52□□□□□ -1.05
CNN3-204ENST00000461018 FAM69CQ0P6D2 419 aa8.52□□□□□ -1.05
CNN3-204ENST00000461018 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CNN3-204ENST00000461018 PDE4AP27815 886 aa8.51□□□□□ -1.05
CNN3-204ENST00000461018 SLC4A5Q9BY07 1137 aa8.51□□□□□ -1.05
CNN3-204ENST00000461018 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CNN3-204ENST00000461018 SOCS7O14512 581 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-204ENST00000461018 CADPS2Q86UW7 1296 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-204ENST00000461018 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CNN3-204ENST00000461018 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa8.5□□□□□ -1.05
CNN3-204ENST00000461018 DNMBPQ6XZF7 1577 aa8.49□□□□□ -1.05
CNN3-204ENST00000461018 GOLGA8CPA6NN73 597 aa8.49□□□□□ -1.05
CNN3-204ENST00000461018 PRDM2Q13029 1718 aa8.49□□□□□ -1.05
CNN3-204ENST00000461018 THSD4Q6ZMP0 1018 aa8.48□□□□□ -1.05
CNN3-204ENST00000461018 ZNF454Q8N9F8 522 aa8.48□□□□□ -1.05
CNN3-204ENST00000461018 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa8.48□□□□□ -1.05
CNN3-204ENST00000461018 BCL2L12Q9HB09 334 aa8.48□□□□□ -1.05
CNN3-204ENST00000461018 SYNJ2O15056 1496 aa8.47□□□□□ -1.05
CNN3-204ENST00000461018 ADGRL1O94910 1474 aa8.47□□□□□ -1.05
CNN3-204ENST00000461018 A0A0G2JS52 829 aa8.47□□□□□ -1.05
CNN3-204ENST00000461018 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa8.47□□□□□ -1.05
CNN3-204ENST00000461018 OXER1Q8TDS5 423 aa8.47□□□□□ -1.05
CNN3-204ENST00000461018 SOGA1O94964 1423 aa8.46□□□□□ -1.05
CNN3-204ENST00000461018 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CNN3-204ENST00000461018 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP8.46□□□□□ -1.06
CNN3-204ENST00000461018 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CNN3-204ENST00000461018 KDM6BO15054 1643 aa8.46□□□□□ -1.06
CNN3-204ENST00000461018 PTPREP23469 700 aa8.45□□□□□ -1.06
CNN3-204ENST00000461018 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CNN3-204ENST00000461018 WNT2BQ93097 391 aa8.45□□□□□ -1.06
CNN3-204ENST00000461018 ABCC8Q09428 1581 aa8.44□□□□□ -1.06
CNN3-204ENST00000461018 ABCC10Q5T3U5 1492 aa8.44□□□□□ -1.06
CNN3-204ENST00000461018 TSPOAP1O95153 1857 aa8.43□□□□□ -1.06
CNN3-204ENST00000461018 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CNN3-204ENST00000461018 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CNN3-204ENST00000461018 FOSBP53539 338 aa8.42□□□□□ -1.06
CNN3-204ENST00000461018 ZBED2Q9BTP6 218 aa8.42□□□□□ -1.06
CNN3-204ENST00000461018 NBPF3Q9H094 633 aa8.42□□□□□ -1.06
CNN3-204ENST00000461018 CCDC88BA6NC98 1476 aa8.42□□□□□ -1.06
CNN3-204ENST00000461018 CEP170Q5SW79 1584 aa8.41□□□□□ -1.06
CNN3-204ENST00000461018 GRIN2BQ13224 1484 aa8.4□□□□□ -1.06
CNN3-204ENST00000461018 DIP2BQ9P265 1576 aa8.39□□□□□ -1.07
CNN3-204ENST00000461018 DISP3Q9P2K9 1392 aa8.39□□□□□ -1.07
CNN3-204ENST00000461018 JPH4Q96JJ6 628 aa8.38□□□□□ -1.07
CNN3-204ENST00000461018 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CNN3-204ENST00000461018 MAP3K9P80192 1104 aa8.37□□□□□ -1.07
CNN3-204ENST00000461018 MFSD10Q14728 455 aa8.37□□□□□ -1.07
CNN3-204ENST00000461018 ZDHHC16Q969W1 377 aa8.37□□□□□ -1.07
CNN3-204ENST00000461018 FGD5Q6ZNL6 1462 aa8.37□□□□□ -1.07
CNN3-204ENST00000461018 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CNN3-204ENST00000461018 WDR70Q9NW82 654 aa8.35□□□□□ -1.07
CNN3-204ENST00000461018 ADAM33Q9BZ11 813 aa8.34□□□□□ -1.07
CNN3-204ENST00000461018 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa8.34□□□□□ -1.07
CNN3-204ENST00000461018 EMILIN3Q9NT22 766 aa8.34□□□□□ -1.07
CNN3-204ENST00000461018 EVI5O60447 810 aa8.33□□□□□ -1.08
CNN3-204ENST00000461018 ANKK1Q8NFD2 765 aa8.33□□□□□ -1.08
CNN3-204ENST00000461018 PBRM1Q86U86 1689 aa8.33□□□□□ -1.08
CNN3-204ENST00000461018 SHROOM2Q13796 1616 aa8.32□□□□□ -1.08
CNN3-204ENST00000461018 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CNN3-204ENST00000461018 MAPKBP1O60336 1514 aa8.32□□□□□ -1.08
CNN3-204ENST00000461018 NUP160Q12769 1436 aa8.31□□□□□ -1.08
CNN3-204ENST00000461018 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CNN3-204ENST00000461018 Q6ZNB5 142 aa8.31□□□□□ -1.08
CNN3-204ENST00000461018 RABGEF1Q9UJ41 708 aa8.31□□□□□ -1.08
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