RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 NCOA2Q15596 1464 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRM-202ENST00000400053 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PTPRM-202ENST00000400053 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PTPRM-202ENST00000400053 ZBED9Q6R2W3 1325 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRM-202ENST00000400053 ITPRIPQ8IWB1 547 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRM-202ENST00000400053 USP47Q96K76 1375 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRM-202ENST00000400053 GGT6Q6P531 493 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRM-202ENST00000400053 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
PTPRM-202ENST00000400053 TPM4P67936 248 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-202ENST00000400053 CCDC144AA2RUR9 1427 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-202ENST00000400053 PLIN1O60240 522 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-202ENST00000400053 HDGFP51858 240 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-202ENST00000400053 EXOC6Q8TAG9 804 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-202ENST00000400053 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-202ENST00000400053 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-202ENST00000400053 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-202ENST00000400053 EFCAB5A4FU69 1503 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRM-202ENST00000400053 PTPRGP23470 1445 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRM-202ENST00000400053 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PTPRM-202ENST00000400053 KIF3BO15066 747 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRM-202ENST00000400053 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
PTPRM-202ENST00000400053 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRM-202ENST00000400053 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRM-202ENST00000400053 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
PTPRM-202ENST00000400053 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
PTPRM-202ENST00000400053 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP11.08□□□□□ -0.64
PTPRM-202ENST00000400053 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP11.08□□□□□ -0.64
PTPRM-202ENST00000400053 BICRAQ9NZM4 1560 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
PTPRM-202ENST00000400053 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
PTPRM-202ENST00000400053 HDAC5Q9UQL6 1122 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRM-202ENST00000400053 TIAM1Q13009 1591 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRM-202ENST00000400053 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
PTPRM-202ENST00000400053 LMOD2Q6P5Q4 547 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRM-202ENST00000400053 CCDC7Q96M83 1385 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRM-202ENST00000400053 CCDC146Q8IYE0 955 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRM-202ENST00000400053 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRM-202ENST00000400053 SOX12O15370 315 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRM-202ENST00000400053 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
PTPRM-202ENST00000400053 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-202ENST00000400053 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-202ENST00000400053 FAM161AQ3B820 660 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-202ENST00000400053 KIF7Q2M1P5 1343 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-202ENST00000400053 TOPBP1Q92547 1522 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-202ENST00000400053 PANK3Q9H999 370 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-202ENST00000400053 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
PTPRM-202ENST00000400053 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
PTPRM-202ENST00000400053 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
PTPRM-202ENST00000400053 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
PTPRM-202ENST00000400053 PEG3Q9GZU2 1588 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRM-202ENST00000400053 CNTLNQ9NXG0 1405 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRM-202ENST00000400053 CEP89Q96ST8 783 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRM-202ENST00000400053 WASHC2AQ641Q2 1341 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRM-202ENST00000400053 HFM1A2PYH4 1435 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRM-202ENST00000400053 SMC4Q9NTJ3 1288 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRM-202ENST00000400053 GRIN2BQ13224 1484 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRM-202ENST00000400053 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRM-202ENST00000400053 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
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PTPRM-202ENST00000400053 CRBNQ96SW2 442 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRM-202ENST00000400053 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
PTPRM-202ENST00000400053 PRM3Q9NNZ6 103 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRM-202ENST00000400053 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.64
PTPRM-202ENST00000400053 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
PTPRM-202ENST00000400053 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
PTPRM-202ENST00000400053 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa11.02□□□□□ -0.65
PTPRM-202ENST00000400053 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
PTPRM-202ENST00000400053 MIA2Q96PC5 1412 aa11.02□□□□□ -0.65
PTPRM-202ENST00000400053 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
PTPRM-202ENST00000400053 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
PTPRM-202ENST00000400053 NESP48681 1621 aa11.02□□□□□ -0.65
PTPRM-202ENST00000400053 STK26Q9P289 416 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRM-202ENST00000400053 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRM-202ENST00000400053 DDX11L8A8MPP1 907 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRM-202ENST00000400053 BCL2L13Q9BXK5 485 aa11□□□□□ -0.65
PTPRM-202ENST00000400053 TPM3P06753 285 aa11□□□□□ -0.65
PTPRM-202ENST00000400053 KIF3AQ9Y496 699 aa11□□□□□ -0.65
PTPRM-202ENST00000400053 CHMP4CQ96CF2 233 aa11□□□□□ -0.65
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PTPRM-202ENST00000400053 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
PTPRM-202ENST00000400053 IL27Q8NEV9 243 aa10.98□□□□□ -0.65
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PTPRM-202ENST00000400053 COG6Q9Y2V7 657 aa10.97□□□□□ -0.65
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PTPRM-202ENST00000400053 GPATCH3Q96I76 525 aa10.97□□□□□ -0.65
PTPRM-202ENST00000400053 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa10.97□□□□□ -0.65
PTPRM-202ENST00000400053 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa10.97□□□□□ -0.65
PTPRM-202ENST00000400053 SETQ01105 290 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
PTPRM-202ENST00000400053 BRPF3Q9ULD4 1205 aa10.97□□□□□ -0.65
PTPRM-202ENST00000400053 PRDM2Q13029 1718 aa10.97□□□□□ -0.65
PTPRM-202ENST00000400053 TERF2IPQ9NYB0 399 aa10.96□□□□□ -0.65
PTPRM-202ENST00000400053 MLECQ14165 292 aa10.96□□□□□ -0.66
PTPRM-202ENST00000400053 TRAK1Q9UPV9 953 aa10.95□□□□□ -0.66
PTPRM-202ENST00000400053 WDR97A6NE52 1622 aa10.95□□□□□ -0.66
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