RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263012.10

NOMO3-201, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOMO3, Length 3,911 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-201ENST00000263012 HSCBQ8IWL3 235 aa22.57■■□□□ 1.2
NOMO3-201ENST00000263012 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.57■■□□□ 1.2
NOMO3-201ENST00000263012 NCAPD3P42695 1498 aa22.56■■□□□ 1.2
NOMO3-201ENST00000263012 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
NOMO3-201ENST00000263012 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
NOMO3-201ENST00000263012 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.56■■□□□ 1.2
NOMO3-201ENST00000263012 USP35Q9P2H5 1018 aa22.55■■□□□ 1.2
NOMO3-201ENST00000263012 PTPRKQ15262 1439 aa22.53■■□□□ 1.2
NOMO3-201ENST00000263012 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
NOMO3-201ENST00000263012 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
NOMO3-201ENST00000263012 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
NOMO3-201ENST00000263012 HFM1A2PYH4 1435 aa22.53■■□□□ 1.2
NOMO3-201ENST00000263012 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.52■■□□□ 1.2
NOMO3-201ENST00000263012 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.52■■□□□ 1.2
NOMO3-201ENST00000263012 JPH4Q96JJ6 628 aa22.51■■□□□ 1.19
NOMO3-201ENST00000263012 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.51■■□□□ 1.19
NOMO3-201ENST00000263012 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.5■■□□□ 1.19
NOMO3-201ENST00000263012 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
NOMO3-201ENST00000263012 PTMAP06454 111 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
NOMO3-201ENST00000263012 MS4A1P11836 297 aa22.5■■□□□ 1.19
NOMO3-201ENST00000263012 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.49■■□□□ 1.19
NOMO3-201ENST00000263012 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
NOMO3-201ENST00000263012 KIF3BO15066 747 aa22.47■■□□□ 1.19
NOMO3-201ENST00000263012 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
NOMO3-201ENST00000263012 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
NOMO3-201ENST00000263012 POGKQ9P215 609 aa22.47■■□□□ 1.19
NOMO3-201ENST00000263012 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
NOMO3-201ENST00000263012 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
NOMO3-201ENST00000263012 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.46■■□□□ 1.19
NOMO3-201ENST00000263012 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
NOMO3-201ENST00000263012 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.44■■□□□ 1.18
NOMO3-201ENST00000263012 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
NOMO3-201ENST00000263012 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
NOMO3-201ENST00000263012 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.42■■□□□ 1.18
NOMO3-201ENST00000263012 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.39■■□□□ 1.17
NOMO3-201ENST00000263012 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.38■■□□□ 1.17
NOMO3-201ENST00000263012 C14orf37Q86TY3 774 aa22.38■■□□□ 1.17
NOMO3-201ENST00000263012 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
NOMO3-201ENST00000263012 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.35■■□□□ 1.17
NOMO3-201ENST00000263012 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
NOMO3-201ENST00000263012 PPP2R1AP30153 589 aa22.35■■□□□ 1.17
NOMO3-201ENST00000263012 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.34■■□□□ 1.17
NOMO3-201ENST00000263012 LNPKQ9C0E8 428 aa22.34■■□□□ 1.17
NOMO3-201ENST00000263012 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.34■■□□□ 1.17
NOMO3-201ENST00000263012 NUTM2FA1L443 756 aa22.33■■□□□ 1.17
NOMO3-201ENST00000263012 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.17
NOMO3-201ENST00000263012 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.32■■□□□ 1.16
NOMO3-201ENST00000263012 E9PSI1 815 aa22.32■■□□□ 1.16
NOMO3-201ENST00000263012 MLECQ14165 292 aa22.31■■□□□ 1.16
NOMO3-201ENST00000263012 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.31■■□□□ 1.16
NOMO3-201ENST00000263012 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
NOMO3-201ENST00000263012 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
NOMO3-201ENST00000263012 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
NOMO3-201ENST00000263012 MSNP26038 577 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
NOMO3-201ENST00000263012 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.3■■□□□ 1.16
NOMO3-201ENST00000263012 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.29■■□□□ 1.16
NOMO3-201ENST00000263012 ERCC6Q03468 1493 aa22.28■■□□□ 1.16
NOMO3-201ENST00000263012 NCOA1Q15788 1441 aa22.28■■□□□ 1.16
NOMO3-201ENST00000263012 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
NOMO3-201ENST00000263012 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
NOMO3-201ENST00000263012 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.25■■□□□ 1.15
NOMO3-201ENST00000263012 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
NOMO3-201ENST00000263012 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.25■■□□□ 1.15
NOMO3-201ENST00000263012 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.24■■□□□ 1.15
NOMO3-201ENST00000263012 TOPBP1Q92547 1522 aa22.23■■□□□ 1.15
NOMO3-201ENST00000263012 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.23■■□□□ 1.15
NOMO3-201ENST00000263012 GBP4Q96PP9 640 aa22.23■■□□□ 1.15
NOMO3-201ENST00000263012 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.23■■□□□ 1.15
NOMO3-201ENST00000263012 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.22■■□□□ 1.15
NOMO3-201ENST00000263012 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
NOMO3-201ENST00000263012 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.22■■□□□ 1.15
NOMO3-201ENST00000263012 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.22■■□□□ 1.15
NOMO3-201ENST00000263012 MTHFSP49914 203 aa22.21■■□□□ 1.15
NOMO3-201ENST00000263012 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.21■■□□□ 1.15
NOMO3-201ENST00000263012 AFAP1Q8N556 730 aa22.21■■□□□ 1.15
NOMO3-201ENST00000263012 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.21■■□□□ 1.15
NOMO3-201ENST00000263012 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
NOMO3-201ENST00000263012 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.21■■□□□ 1.15
NOMO3-201ENST00000263012 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.21■■□□□ 1.15
NOMO3-201ENST00000263012 MPNDQ8N594 471 aa22.2■■□□□ 1.14
NOMO3-201ENST00000263012 PRDM2Q13029 1718 aa22.19■■□□□ 1.14
NOMO3-201ENST00000263012 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.19■■□□□ 1.14
NOMO3-201ENST00000263012 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
NOMO3-201ENST00000263012 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
NOMO3-201ENST00000263012 CASC1Q6TDU7 716 aa22.17■■□□□ 1.14
NOMO3-201ENST00000263012 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.17■■□□□ 1.14
NOMO3-201ENST00000263012 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.17■■□□□ 1.14
NOMO3-201ENST00000263012 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
NOMO3-201ENST00000263012 IGHDP01880 384 aa22.15■■□□□ 1.14
NOMO3-201ENST00000263012 DAPK1P53355 1430 aa22.15■■□□□ 1.14
NOMO3-201ENST00000263012 HMOX1P09601 288 aa22.15■■□□□ 1.14
NOMO3-201ENST00000263012 TRAK2O60296 914 aa22.15■■□□□ 1.14
NOMO3-201ENST00000263012 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
NOMO3-201ENST00000263012 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
NOMO3-201ENST00000263012 RIPK4P57078 832 aa22.12■■□□□ 1.13
NOMO3-201ENST00000263012 CABP2Q9NPB3 220 aa22.12■■□□□ 1.13
NOMO3-201ENST00000263012 TNNQ9UQP3 1299 aa22.12■■□□□ 1.13
NOMO3-201ENST00000263012 KANK1Q14678 1352 aa22.11■■□□□ 1.13
NOMO3-201ENST00000263012 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
NOMO3-201ENST00000263012 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.11■■□□□ 1.13
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