RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000171737.2

Odc1-201, Transcript of Ornithine decarboxylase, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Odc1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odc1-201ENSMUST00000171737 Usp47Q8BY87 1376 aa35,15■■■■□ 3,22
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ptch1Q61115 1434 aa35,14■■■■□ 3,22
Odc1-201ENSMUST00000171737 Robo2Q7TPD3 1470 aa35,13■■■■□ 3,21
Odc1-201ENSMUST00000171737 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP35,13■■■■□ 3,21
Odc1-201ENSMUST00000171737 Clstn2Q9ER65 966 aa35,12■■■■□ 3,21
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cul9Q80TT8 1865 aa35,1■■■■□ 3,21
Odc1-201ENSMUST00000171737 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP35,1■■■■□ 3,21
Odc1-201ENSMUST00000171737 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP35,09■■■■□ 3,21
Odc1-201ENSMUST00000171737 Dip2cE9PWR4 1557 aa35,09■■■■□ 3,21
Odc1-201ENSMUST00000171737 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP35,09■■■■□ 3,21
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa35,08■■■■□ 3,21
Odc1-201ENSMUST00000171737 Myo5cE9Q1F5 1742 aa35,08■■■■□ 3,21
Odc1-201ENSMUST00000171737 RereQ80TZ9 1558 aa35,07■■■■□ 3,21
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cd109Q8R422 1442 aa35,04■■■■□ 3,2
Odc1-201ENSMUST00000171737 Pde4cQ3UEI1 686 aa35,04■■■■□ 3,2
Odc1-201ENSMUST00000171737 AdgbG3UZ78 1657 aa35,01■■■■□ 3,2
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa35■■■■□ 3,19
Odc1-201ENSMUST00000171737 Kif3bQ61771 747 aa35■■■■□ 3,19
Odc1-201ENSMUST00000171737 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa34,99■■■■□ 3,19
Odc1-201ENSMUST00000171737 Dot1lQ6XZL8 1540 aa34,97■■■■□ 3,19
Odc1-201ENSMUST00000171737 Fndc1E9Q043 1732 aa34,97■■■■□ 3,19
Odc1-201ENSMUST00000171737 Wdr66E9Q743 1299 aa34,97■■■■□ 3,19
Odc1-201ENSMUST00000171737 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP34,97■■■■□ 3,19
Odc1-201ENSMUST00000171737 Atp7aQ64430 1491 aa34,97■■■■□ 3,19
Odc1-201ENSMUST00000171737 Hecw2Q6I6G8 1578 aa34,96■■■■□ 3,19
Odc1-201ENSMUST00000171737 Camsap2Q8C1B1 1461 aa34,95■■■■□ 3,18
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gli2Q0VGT2 1544 aa34,94■■■■□ 3,18
Odc1-201ENSMUST00000171737 Yeats2Q3TUF7 1407 aa34,93■■■■□ 3,18
Odc1-201ENSMUST00000171737 Plch2A2AP18 1501 aa34,93■■■■□ 3,18
Odc1-201ENSMUST00000171737 Synj2Q9D2G5 1434 aa34,91■■■■□ 3,18
Odc1-201ENSMUST00000171737 Pcgf6Q99NA9 353 aa34,9■■■■□ 3,18
Odc1-201ENSMUST00000171737 Abca6Q8K441 1624 aa34,9■■■■□ 3,18
Odc1-201ENSMUST00000171737 Myom3A2ABU4 1439 aa34,9■■■■□ 3,18
Odc1-201ENSMUST00000171737 Sall2Q9QX96 1004 aa34,89■■■■□ 3,18
Odc1-201ENSMUST00000171737 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP34,89■■■■□ 3,18
Odc1-201ENSMUST00000171737 Naip6Q9JIB6 1403 aa34,89■■■■□ 3,18
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa34,86■■■■□ 3,17
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tarbp1E9Q368 1579 aa34,85■■■■□ 3,17
Odc1-201ENSMUST00000171737 Uggt2E9Q4X2 1504 aa34,84■■■■□ 3,17
Odc1-201ENSMUST00000171737 Prex1Q69ZK0 1650 aa34,84■■■■□ 3,17
Odc1-201ENSMUST00000171737 Trpm1Q2TV84 1622 aa34,84■■■■□ 3,17
Odc1-201ENSMUST00000171737 Nsd2Q8BVE8 1365 aa34,81■■■■□ 3,16
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rgl3Q3UYI5 709 aa34,79■■■■□ 3,16
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP34,78■■■■□ 3,16
Odc1-201ENSMUST00000171737 ClspnQ80YR7 1315 aa34,77■■■■□ 3,16
Odc1-201ENSMUST00000171737 AnkarA2RT91 1465 aa34,76■■■■□ 3,16
Odc1-201ENSMUST00000171737 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP34,75■■■■□ 3,15
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cfap65Q3V0B4 1847 aa34,75■■■■□ 3,15
Odc1-201ENSMUST00000171737 Neurod1Q60867 357 aa34,74■■■■□ 3,15
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rock1P70335 1354 aa34,74■■■■□ 3,15
Odc1-201ENSMUST00000171737 Mbd5B1AYB6 1498 aa34,73■■■■□ 3,15
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa34,71■■■■□ 3,15
Odc1-201ENSMUST00000171737 Dnajc5P60904 198 aa34,69■■■■□ 3,14
Odc1-201ENSMUST00000171737 Washc2Q6PGL7 1334 aa34,68■■■■□ 3,14
Odc1-201ENSMUST00000171737 Qser1A2BIE1 1698 aa34,68■■■■□ 3,14
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ttc21bQ0HA38 1315 aa34,66■■■■□ 3,14
Odc1-201ENSMUST00000171737 Iqgap1Q9JKF1 1657 aaKnown RBP34,66■■■■□ 3,14
Odc1-201ENSMUST00000171737 Iqgap3F8VQ29 1632 aa34,63■■■■□ 3,13
Odc1-201ENSMUST00000171737 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP34,62■■■■□ 3,13
Odc1-201ENSMUST00000171737 Mug2P28666 1451 aa34,62■■■■□ 3,13
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm13697A2AK42 830 aa34,59■■■■□ 3,13
Odc1-201ENSMUST00000171737 Prdm2A2A7B5 1709 aaKnown RBP34,57■■■■□ 3,13
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cdk13Q69ZA1 1511 aaKnown RBP34,56■■■■□ 3,12
Odc1-201ENSMUST00000171737 Dnajc5gQ8C632 165 aa34,55■■■■□ 3,12
Odc1-201ENSMUST00000171737 Erich6D3Z6S9 713 aa34,54■■■■□ 3,12
Odc1-201ENSMUST00000171737 Adamts13Q769J6 1426 aa34,53■■■■□ 3,12
Odc1-201ENSMUST00000171737 NpatQ8BMA5 1420 aa34,52■■■■□ 3,12
Odc1-201ENSMUST00000171737 Abca8aQ8K442 1620 aa34,51■■■■□ 3,11
Odc1-201ENSMUST00000171737 Grwd1Q810D6 446 aaKnown RBP34,5■■■■□ 3,11
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP34,5■■■■□ 3,11
Odc1-201ENSMUST00000171737 Akap12Q9WTQ5 1684 aa34,5■■■■□ 3,11
Odc1-201ENSMUST00000171737 Sall3Q62255 1320 aa34,49■■■■□ 3,11
Odc1-201ENSMUST00000171737 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP34,49■■■■□ 3,11
Odc1-201ENSMUST00000171737 Abcc6Q9R1S7 1498 aa34,47■■■■□ 3,11
Odc1-201ENSMUST00000171737 Adamts7Q68SA9 1657 aa34,47■■■■□ 3,11
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tulp4Q9JIL5 1547 aa34,47■■■■□ 3,11
Odc1-201ENSMUST00000171737 Dapk1Q80YE7 1442 aa34,46■■■■□ 3,11
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ino80Q6ZPV2 1559 aa34,46■■■■□ 3,11
Odc1-201ENSMUST00000171737 Polr3aB2RXC6 1390 aa34,46■■■■□ 3,11
Odc1-201ENSMUST00000171737 Talpid3E9PV87 1520 aa34,42■■■■□ 3,1
Odc1-201ENSMUST00000171737 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa34,41■■■■□ 3,1
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa34,41■■■■□ 3,1
Odc1-201ENSMUST00000171737 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa34,41■■■■□ 3,1
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tecpr2Q3UH45 1423 aa34,4■■■■□ 3,1
Odc1-201ENSMUST00000171737 ErbinQ80TH2 1402 aa34,39■■■■□ 3,1
Odc1-201ENSMUST00000171737 Knl1Q66JQ7 1612 aa34,38■■■■□ 3,09
Odc1-201ENSMUST00000171737 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa34,38■■■■□ 3,09
Odc1-201ENSMUST00000171737 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa34,37■■■■□ 3,09
Odc1-201ENSMUST00000171737 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa34,36■■■■□ 3,09
Odc1-201ENSMUST00000171737 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP34,35■■■■□ 3,09
Odc1-201ENSMUST00000171737 Afap1Q80YS6 731 aa34,35■■■■□ 3,09
Odc1-201ENSMUST00000171737 Efcab6Q6P1E8 1516 aa34,34■■■■□ 3,09
Odc1-201ENSMUST00000171737 Stk24Q99KH8 431 aa34,34■■■■□ 3,09
Odc1-201ENSMUST00000171737 Adamtsl3G3UXC7 1706 aa34,33■■■■□ 3,09
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa34,33■■■■□ 3,09
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rundc1Q0VDN7 615 aa34,33■■■■□ 3,09
Odc1-201ENSMUST00000171737 AatkQ80YE4 1365 aa34,29■■■■□ 3,08
Odc1-201ENSMUST00000171737 Myom2Q14BI5 1463 aa34,29■■■■□ 3,08
Odc1-201ENSMUST00000171737 RictorQ6QI06 1708 aa34,28■■■■□ 3,08
Odc1-201ENSMUST00000171737 Arhgap23Q69ZH9 1483 aa34,27■■■■□ 3,08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18,2 ms