RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000113312.8

Shq1-202, Transcript of Protein SHQ1 homolog, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Shq1, Length 6,816 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1-202ENSMUST00000113312 Lemd3Q9WU40 921 aa20,58■□□□□ 0,89
Shq1-202ENSMUST00000113312 FosbP13346 338 aa20,57■□□□□ 0,88
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ccp110Q7TSH4 1004 aa20,55■□□□□ 0,88
Shq1-202ENSMUST00000113312 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP20,55■□□□□ 0,88
Shq1-202ENSMUST00000113312 BcanQ61361 883 aa20,54■□□□□ 0,88
Shq1-202ENSMUST00000113312 Smarce1O54941 411 aaKnown RBP20,53■□□□□ 0,88
Shq1-202ENSMUST00000113312 Tpm2P58774 284 aa20,53■□□□□ 0,88
Shq1-202ENSMUST00000113312 Dcaf1Q80TR8 1506 aa20,53■□□□□ 0,88
Shq1-202ENSMUST00000113312 Trak1Q6PD31 939 aa20,53■□□□□ 0,88
Shq1-202ENSMUST00000113312 Kif3bQ61771 747 aa20,53■□□□□ 0,88
Shq1-202ENSMUST00000113312 Eva1cP58659 440 aa20,51■□□□□ 0,87
Shq1-202ENSMUST00000113312 Pkd2O35245 966 aa20,51■□□□□ 0,87
Shq1-202ENSMUST00000113312 SlkO54988 1233 aa20,51■□□□□ 0,87
Shq1-202ENSMUST00000113312 Taok2Q6ZQ29 1240 aa20,5■□□□□ 0,87
Shq1-202ENSMUST00000113312 A0A0U1RNP2 1173 aa20,5■□□□□ 0,87
Shq1-202ENSMUST00000113312 Gabpb2P81069 414 aa20,5■□□□□ 0,87
Shq1-202ENSMUST00000113312 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP20,5■□□□□ 0,87
Shq1-202ENSMUST00000113312 Exoc6Q8R313 802 aa20,5■□□□□ 0,87
Shq1-202ENSMUST00000113312 PtmsQ9D0J8 101 aaKnown RBP20,49■□□□□ 0,87
Shq1-202ENSMUST00000113312 Dnai1Q8C0M8 701 aa20,49■□□□□ 0,87
Shq1-202ENSMUST00000113312 Chmp4cQ9D7F7 232 aa20,49■□□□□ 0,87
Shq1-202ENSMUST00000113312 EspnQ9ET47 871 aa20,49■□□□□ 0,87
Shq1-202ENSMUST00000113312 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP20,49■□□□□ 0,87
Shq1-202ENSMUST00000113312 MycnP03966 462 aaKnown RBP20,49■□□□□ 0,87
Shq1-202ENSMUST00000113312 Polr3gQ6NXY9 223 aa20,48■□□□□ 0,87
Shq1-202ENSMUST00000113312 Rpap1Q80TE0 1409 aa20,48■□□□□ 0,87
Shq1-202ENSMUST00000113312 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP20,47■□□□□ 0,87
Shq1-202ENSMUST00000113312 Trim30aP15533 496 aa20,46■□□□□ 0,87
Shq1-202ENSMUST00000113312 Fan1Q69ZT1 1020 aa20,45■□□□□ 0,86
Shq1-202ENSMUST00000113312 Kif27Q7M6Z4 1394 aa20,44■□□□□ 0,86
Shq1-202ENSMUST00000113312 March6Q6ZQ89 909 aa20,44■□□□□ 0,86
Shq1-202ENSMUST00000113312 Rock2P70336 1388 aa20,44■□□□□ 0,86
Shq1-202ENSMUST00000113312 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa20,44■□□□□ 0,86
Shq1-202ENSMUST00000113312 Sf3a1Q8K4Z5 791 aaKnown RBP20,43■□□□□ 0,86
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ipo8Q7TMY7 1010 aa20,43■□□□□ 0,86
Shq1-202ENSMUST00000113312 Becn1O88597 448 aa20,42■□□□□ 0,86
Shq1-202ENSMUST00000113312 Neurod6P48986 337 aa20,42■□□□□ 0,86
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ddx11Q6AXC6 880 aa20,42■□□□□ 0,86
Shq1-202ENSMUST00000113312 Stk31Q99MW1 1018 aa20,41■□□□□ 0,86
Shq1-202ENSMUST00000113312 Tpm1P58771 284 aa20,39■□□□□ 0,85
Shq1-202ENSMUST00000113312 Rbm5Q91YE7 815 aaKnown RBP20,39■□□□□ 0,85
Shq1-202ENSMUST00000113312 Abl1P00520 1123 aa20,38■□□□□ 0,85
Shq1-202ENSMUST00000113312 Chmp7Q8R1T1 451 aa20,38■□□□□ 0,85
Shq1-202ENSMUST00000113312 Bcl2l13P59017 434 aa20,38■□□□□ 0,85
Shq1-202ENSMUST00000113312 Podxl2Q8CAE9 603 aa20,38■□□□□ 0,85
Shq1-202ENSMUST00000113312 Sf3b2Q3UJB0 878 aaKnown RBP20,37■□□□□ 0,85
Shq1-202ENSMUST00000113312 Irx3P81067 507 aa20,37■□□□□ 0,85
Shq1-202ENSMUST00000113312 Rsph4aQ8BYM7 716 aa20,37■□□□□ 0,85
Shq1-202ENSMUST00000113312 Smc4Q8CG47 1286 aa20,37■□□□□ 0,85
Shq1-202ENSMUST00000113312 Sycp1Q62209 993 aa20,36■□□□□ 0,85
Shq1-202ENSMUST00000113312 Gm21190A0A0G2JGJ6 266 aa20,36■□□□□ 0,85
Shq1-202ENSMUST00000113312 Tceal9Q9DD24 104 aa20,36■□□□□ 0,85
Shq1-202ENSMUST00000113312 CrcpO35427 148 aa20,36■□□□□ 0,85
Shq1-202ENSMUST00000113312 Tsen2Q6P7W5 460 aa20,36■□□□□ 0,85
Shq1-202ENSMUST00000113312 Kcnn1Q9EQR3 537 aa20,36■□□□□ 0,85
Shq1-202ENSMUST00000113312 Sugp2Q8CH09 1067 aa20,35■□□□□ 0,85
Shq1-202ENSMUST00000113312 Erich4Q3UNU4 136 aa20,34■□□□□ 0,85
Shq1-202ENSMUST00000113312 Rsph6aQ8CDR2 708 aa20,34■□□□□ 0,85
Shq1-202ENSMUST00000113312 Zscan21Q07231 555 aa20,33■□□□□ 0,85
Shq1-202ENSMUST00000113312 Gtf2f1Q3THK3 508 aaKnown RBP20,33■□□□□ 0,84
Shq1-202ENSMUST00000113312 Mia2Q91ZV0 1396 aa20,32■□□□□ 0,84
Shq1-202ENSMUST00000113312 Nap1l3Q794H2 544 aa20,32■□□□□ 0,84
Shq1-202ENSMUST00000113312 CenpjQ569L8 1344 aa20,32■□□□□ 0,84
Shq1-202ENSMUST00000113312 Nap1l1P28656 391 aaKnown RBP20,31■□□□□ 0,84
Shq1-202ENSMUST00000113312 Cplx1P63040 134 aa20,31■□□□□ 0,84
Shq1-202ENSMUST00000113312 Cabp1Q9JLK7 227 aa20,31■□□□□ 0,84
Shq1-202ENSMUST00000113312 Rec8Q8C5S7 591 aa20,31■□□□□ 0,84
Shq1-202ENSMUST00000113312 Srcin1Q9QWI6 1250 aa20,31■□□□□ 0,84
Shq1-202ENSMUST00000113312 Abcc8B2RUS7 1588 aa20,31■□□□□ 0,84
Shq1-202ENSMUST00000113312 Fyb1O35601 819 aa20,31■□□□□ 0,84
Shq1-202ENSMUST00000113312 Shq1Q7TMX5 569 aa20,3■□□□□ 0,84
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ipo4Q8VI75 1082 aa20,3■□□□□ 0,84
Shq1-202ENSMUST00000113312 Utp3Q9JI13 469 aaKnown RBP20,3■□□□□ 0,84
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ccdc60Q8C4J0 545 aa20,3■□□□□ 0,84
Shq1-202ENSMUST00000113312 Mink1Q9JM52 1308 aa20,3■□□□□ 0,84
Shq1-202ENSMUST00000113312 Fbln2P37889 1221 aa20,29■□□□□ 0,84
Shq1-202ENSMUST00000113312 IkQ9Z1M8 557 aaKnown RBP20,29■□□□□ 0,84
Shq1-202ENSMUST00000113312 ArsiQ32KI9 573 aa20,28■□□□□ 0,84
Shq1-202ENSMUST00000113312 Sh3bgrQ9WUZ7 214 aa20,27■□□□□ 0,84
Shq1-202ENSMUST00000113312 Commd10Q8JZY2 202 aa20,27■□□□□ 0,84
Shq1-202ENSMUST00000113312 Themis2Q91YX0 663 aa20,27■□□□□ 0,84
Shq1-202ENSMUST00000113312 ChgaP26339 463 aaKnown RBP20,27■□□□□ 0,83
Shq1-202ENSMUST00000113312 Zpr1Q62384 459 aa20,27■□□□□ 0,83
Shq1-202ENSMUST00000113312 Atp6v1dP57746 247 aa20,25■□□□□ 0,83
Shq1-202ENSMUST00000113312 Cplx2P84086 134 aa20,25■□□□□ 0,83
Shq1-202ENSMUST00000113312 Hs1bp3Q3TC93 395 aa20,25■□□□□ 0,83
Shq1-202ENSMUST00000113312 Hnrnpul1Q8VDM6 859 aaKnown RBP20,25■□□□□ 0,83
Shq1-202ENSMUST00000113312 Cdca7Q9D0M2 382 aa20,25■□□□□ 0,83
Shq1-202ENSMUST00000113312 Sirt1Q923E4 737 aa20,24■□□□□ 0,83
Shq1-202ENSMUST00000113312 Mphosph9A6H5Y1 991 aa20,24■□□□□ 0,83
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ppp4r3bQ922R5 820 aa20,24■□□□□ 0,83
Shq1-202ENSMUST00000113312 Bicd2Q921C5 820 aa20,24■□□□□ 0,83
Shq1-202ENSMUST00000113312 Rad54l2Q99NG0 1466 aa20,24■□□□□ 0,83
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ipo7Q9EPL8 1038 aaKnown RBP20,23■□□□□ 0,83
Shq1-202ENSMUST00000113312 Q8C5K5 320 aa20,23■□□□□ 0,83
Shq1-202ENSMUST00000113312 Cspp1B2RX88 1205 aa20,23■□□□□ 0,83
Shq1-202ENSMUST00000113312 Filip1lQ6P6L0 1131 aa20,22■□□□□ 0,83
Shq1-202ENSMUST00000113312 Kdm4aQ8BW72 1064 aa20,22■□□□□ 0,83
Shq1-202ENSMUST00000113312 Srek1Q8BZX4 494 aaKnown RBP20,22■□□□□ 0,83
Shq1-202ENSMUST00000113312 Rrp12Q6P5B0 1295 aaKnown RBP20,22■□□□□ 0,83
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10,9 ms