RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000034876.9

Tspan3-201, Transcript of Tetraspanin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Tspan3, Length 1,716 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP36,96■■■■□ 3,51
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Tspan3-201ENSMUST00000034876 Prex1Q69ZK0 1650 aa36,54■■■■□ 3,44
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Trpm1Q2TV84 1622 aa36,54■■■■□ 3,44
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa36,53■■■■□ 3,44
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa36,53■■■■□ 3,44
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP36,52■■■■□ 3,44
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ttc21bQ0HA38 1315 aa36,52■■■■□ 3,44
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Tspan3-201ENSMUST00000034876 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa36,5■■■■□ 3,43
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Gm13697A2AK42 830 aa36,49■■■■□ 3,43
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Tspan3-201ENSMUST00000034876 Mug2P28666 1451 aa36,37■■■■□ 3,41
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Grwd1Q810D6 446 aaKnown RBP36,35■■■■□ 3,41
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Iqgap3F8VQ29 1632 aa36,35■■■■□ 3,41
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Qser1A2BIE1 1698 aa36,32■■■■□ 3,41
Tspan3-201ENSMUST00000034876 NpatQ8BMA5 1420 aa36,32■■■■□ 3,4
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP36,31■■■■□ 3,4
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Polr3aB2RXC6 1390 aa36,3■■■■□ 3,4
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Dapk1Q80YE7 1442 aa36,29■■■■□ 3,4
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa36,28■■■■□ 3,4
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP36,28■■■■□ 3,4
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Tspan3-201ENSMUST00000034876 Akap12Q9WTQ5 1684 aa36,25■■■■□ 3,39
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Adamts13Q769J6 1426 aa36,24■■■■□ 3,39
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Tspan3-201ENSMUST00000034876 Talpid3E9PV87 1520 aa36,22■■■■□ 3,39
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Tspan3-201ENSMUST00000034876 Abca8aQ8K442 1620 aa36,2■■■■□ 3,39
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Tspan3-201ENSMUST00000034876 Tulp4Q9JIL5 1547 aa36,16■■■■□ 3,38
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Tecpr2Q3UH45 1423 aa36,16■■■■□ 3,38
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Afap1Q80YS6 731 aa36,16■■■■□ 3,38
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Tspan3-201ENSMUST00000034876 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa36,11■■■■□ 3,37
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Tspan3-201ENSMUST00000034876 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa36,07■■■■□ 3,36
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Tspan3-201ENSMUST00000034876 Myom2Q14BI5 1463 aa36,04■■■■□ 3,36
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