RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ShprhQ7TPQ3 1674 aa17.51■□□□□ 0.39
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nos1Q9Z0J4 1429 aa17.46■□□□□ 0.39
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Myom3A2ABU4 1439 aa17.46■□□□□ 0.39
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stk24Q99KH8 431 aa17.44■□□□□ 0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Myo5cE9Q1F5 1742 aa17.44■□□□□ 0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa17.44■□□□□ 0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mug2P28666 1451 aa17.44■□□□□ 0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa17.43■□□□□ 0.38
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dip2cE9PWR4 1557 aa17.36■□□□□ 0.37
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rock1P70335 1354 aa17.34■□□□□ 0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Naip6Q9JIB6 1403 aa17.34■□□□□ 0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AglF8VPN4 1532 aa17.34■□□□□ 0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fndc1E9Q043 1732 aa17.33■□□□□ 0.37
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AdgbG3UZ78 1657 aa17.3■□□□□ 0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Polr3aB2RXC6 1390 aa17.29■□□□□ 0.36
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adamts13Q769J6 1426 aa17.26■□□□□ 0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ErbinQ80TH2 1402 aa17.26■□□□□ 0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa17.26■□□□□ 0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AnkarA2RT91 1465 aa17.25■□□□□ 0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Afap1Q80YS6 731 aa17.25■□□□□ 0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P3h3Q8CG70 732 aa17.25■□□□□ 0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bcl11aQ9QYE3 773 aa17.25■□□□□ 0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa17.25■□□□□ 0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Abcc6Q9R1S7 1498 aa17.25■□□□□ 0.35
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa17.24■□□□□ 0.35
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