RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000018810.9

Cbx1-201, Transcript of Chromobox protein homolog 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Cbx1, Length 1,824 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Synj2Q9D2G5 1434 aa26.47■■□□□ 1.83
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Clstn2Q9ER65 966 aa26.46■■□□□ 1.83
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ttll5Q8CHB8 1328 aa26.45■■□□□ 1.83
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Map4P27546 1125 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Plch2A2AP18 1501 aa26.45■■□□□ 1.82
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa26.42■■□□□ 1.82
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Trpm1Q2TV84 1622 aa26.4■■□□□ 1.82
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Robo2Q7TPD3 1470 aa26.4■■□□□ 1.82
Cbx1-201ENSMUST00000018810 PtprgQ05909 1442 aa26.4■■□□□ 1.82
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pcgf6Q99NA9 353 aa26.39■■□□□ 1.82
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gli2Q0VGT2 1544 aa26.38■■□□□ 1.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pkd2O35245 966 aa26.37■■□□□ 1.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Uggt2E9Q4X2 1504 aa26.36■■□□□ 1.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Trak1Q6PD31 939 aa26.34■■□□□ 1.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa26.34■■□□□ 1.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Yeats2Q3TUF7 1407 aa26.33■■□□□ 1.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pik3c2gO70167 1506 aa26.33■■□□□ 1.8
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cd109Q8R422 1442 aa26.3■■□□□ 1.8
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pde4cQ3UEI1 686 aa26.3■■□□□ 1.8
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Kif3bQ61771 747 aa26.3■■□□□ 1.8
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Naip6Q9JIB6 1403 aa26.29■■□□□ 1.8
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Abca6Q8K441 1624 aa26.28■■□□□ 1.8
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cfap65Q3V0B4 1847 aa26.28■■□□□ 1.8
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Dhx9O70133 1380 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Prex1Q69ZK0 1650 aa26.26■■□□□ 1.79
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Usp47Q8BY87 1376 aa26.26■■□□□ 1.79
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Qser1A2BIE1 1698 aa26.25■■□□□ 1.79
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Naip5Q9R016 1403 aa26.25■■□□□ 1.79
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Nsd2Q8BVE8 1365 aa26.24■■□□□ 1.79
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa26.24■■□□□ 1.79
Cbx1-201ENSMUST00000018810 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Myom3A2ABU4 1439 aa26.23■■□□□ 1.79
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Atp7aQ64430 1491 aa26.21■■□□□ 1.79
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Dot1lQ6XZL8 1540 aa26.21■■□□□ 1.79
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 AnkarA2RT91 1465 aa26.15■■□□□ 1.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 NpatQ8BMA5 1420 aa26.15■■□□□ 1.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Camsap2Q8C1B1 1461 aa26.13■■□□□ 1.77
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Prdm2A2A7B5 1709 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tarbp1E9Q368 1579 aa26.1■■□□□ 1.77
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa26.1■■□□□ 1.77
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Iqgap3F8VQ29 1632 aa26.09■■□□□ 1.77
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Adamts7Q68SA9 1657 aa26.08■■□□□ 1.77
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Akap12Q9WTQ5 1684 aa26.08■■□□□ 1.77
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rock1P70335 1354 aa26.07■■□□□ 1.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ttc21bQ0HA38 1315 aa26.04■■□□□ 1.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Talpid3E9PV87 1520 aa26.02■■□□□ 1.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Adamtsl3G3UXC7 1706 aa26.02■■□□□ 1.76
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa26.01■■□□□ 1.75
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ino80Q6ZPV2 1559 aa26■■□□□ 1.75
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Plppr3Q7TPB0 716 aa25.99■■□□□ 1.75
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Iqgap1Q9JKF1 1657 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Abca8aQ8K442 1620 aa25.98■■□□□ 1.75
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Dnajc5gQ8C632 165 aa25.98■■□□□ 1.75
Cbx1-201ENSMUST00000018810 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Wdr66E9Q743 1299 aa25.98■■□□□ 1.75
Cbx1-201ENSMUST00000018810 RictorQ6QI06 1708 aa25.97■■□□□ 1.75
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mbd5B1AYB6 1498 aa25.97■■□□□ 1.75
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rgl3Q3UYI5 709 aa25.96■■□□□ 1.75
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa25.94■■□□□ 1.74
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tecpr2Q3UH45 1423 aa25.94■■□□□ 1.74
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Knl1Q66JQ7 1612 aa25.93■■□□□ 1.74
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Sall2Q9QX96 1004 aa25.93■■□□□ 1.74
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Washc2Q6PGL7 1334 aa25.93■■□□□ 1.74
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rsph4aQ8BYM7 716 aa25.92■■□□□ 1.74
Cbx1-201ENSMUST00000018810 ClspnQ80YR7 1315 aa25.92■■□□□ 1.74
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Alpk3Q924C5 1678 aa25.91■■□□□ 1.74
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Myom2Q14BI5 1463 aa25.91■■□□□ 1.74
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Efcab6Q6P1E8 1516 aa25.9■■□□□ 1.74
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa25.9■■□□□ 1.74
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Erich6D3Z6S9 713 aa25.89■■□□□ 1.74
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Abcc6Q9R1S7 1498 aa25.89■■□□□ 1.73
Cbx1-201ENSMUST00000018810 ErbinQ80TH2 1402 aa25.88■■□□□ 1.73
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa25.88■■□□□ 1.73
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Arhgap23Q69ZH9 1483 aa25.87■■□□□ 1.73
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Afap1Q80YS6 731 aa25.86■■□□□ 1.73
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mug2P28666 1451 aa25.85■■□□□ 1.73
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Uggt1Q6P5E4 1551 aa25.85■■□□□ 1.73
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Neurod1Q60867 357 aa25.84■■□□□ 1.73
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Hfm1D3Z4R1 1434 aa25.84■■□□□ 1.73
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tulp4Q9JIL5 1547 aa25.84■■□□□ 1.73
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Adamts13Q769J6 1426 aa25.84■■□□□ 1.73
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cdk13Q69ZA1 1511 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Polr3aB2RXC6 1390 aa25.8■■□□□ 1.72
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Sall3Q62255 1320 aa25.77■■□□□ 1.72
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa25.77■■□□□ 1.72
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Skint5A7XUY5 1461 aa25.76■■□□□ 1.71
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm13697A2AK42 830 aa25.74■■□□□ 1.71
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