RNA–Protein interactions for RNA: YLL017W

YLL017W, Transcript of Non-essential Ras guanine nucleotide exchange factor (GEF), yeast

Gene YLL017W, Length 312 nt, Biotype pseudogene.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLL017W	YLL017W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	GAL3	P13045	520 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	MRPL25	P23369	157 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	PET18	P25362	215 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	IST2	P38250	946 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	RTC2	P38279	296 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	SPT8	P38915	602 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	RBG1	P39729	369 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	SSO2	P39926	295 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	SHY1	P53266	389 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	ARP5	P53946	755 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	YMR010W	Q03687	405 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	STE23	Q06010	1027 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	YDR262W	Q12331	272 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	SPO24	Q3E752	67 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	DRS2	P39524	1355 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	YEL045C	P32616	141 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	MRPL10	P36520	322 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	ATG7	P38862	630 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	GAB1	P41733	394 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	YMR027W	Q04371	470 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	RBD2	Q12270	262 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	HEM4	P06174	275 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	YER186C	P40101	306 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	YJR030C	P47101	745 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	SDT1	P53078	280 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	YDL109C	Q12103	647 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	HMS1	Q12398	434 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	TY3A-I	Q99219	290 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	UBA3	Q99344	299 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	RAD1	P06777	1100 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	UTR1	P21373	530 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	CIN8	P27895	1000 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	ERG9	P29704	444 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	NTG1	P31378	399 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	HXT1	P32465	570 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	MIG3	P39943	394 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	OXA1	P39952	402 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	YET2	Q04210	160 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	MSC3	Q05812	728 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YLL017W	YLL017W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	NUP2	P32499	720 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	CSM3	Q04659	317 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	YLR413W	Q06689	675 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	VPS63	O13549	108 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	GIT1	P25346	518 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	DCC1	P25559	380 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	MKK1	P32490	508 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	AIM20	P40451	204 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	NAS6	P50086	228 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	INP2	Q03824	705 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	YLR297W	Q05899	129 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	SFM1	Q12314	213 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	APC2	Q12440	853 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	UNG1	P12887	359 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	CDC42	P19073	191 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	DOA4	P32571	926 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	SPR1	P32603	445 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	MYO3	P36006	1272 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	OM14	P38325	134 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YLL017W	YLL017W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.4 ms