RNA–Protein interactions for RNA: YJL192C

SOP4, Transcript of ER-membrane protein, yeast

Gene SOP4, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SOP4	YJL192C	ARV1	Q06541	321 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SOP4	YJL192C	RAD34	Q06665	692 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SOP4	YJL192C	SSK1	Q07084	712 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SOP4	YJL192C	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.83
SOP4	YJL192C	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
SOP4	YJL192C	YLR049C	Q12110	428 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SOP4	YJL192C	SIA1	Q12212	622 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SOP4	YJL192C	SET6	Q12529	373 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SOP4	YJL192C	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
SOP4	YJL192C	QCR7	P00128	127 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	STE3	P06783	470 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	SPT3	P06844	337 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	CDC26	P14724	124 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	UTR1	P21373	530 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	MCM10	P32354	571 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	UTR4	P32626	227 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	PDC2	P32896	925 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	NVJ1	P38881	321 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.58	□□□□□ -1.84	not detected
SOP4	YJL192C	RMD6	P39975	231 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	MAD2	P40958	196 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.58	□□□□□ -1.84	not detected
SOP4	YJL192C	AIM22	P47051	409 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	PET130	P47065	347 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	PMT5	P52867	743 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	MNT4	P53745	580 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	INN1	P53901	409 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	SLG1	P54867	378 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	YCL001W-A	P87012	153 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	STP1	Q00947	519 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	ACS1	Q01574	713 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	SKY1	Q03656	742 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	YML037C	Q03703	340 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	YDR109C	Q04585	715 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	GAS2	Q06135	555 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	YEH1	Q07804	573 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	YOL131W	Q08270	108 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	DIN7	Q12086	430 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	YPR022C	Q12139	1133 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	NBP2	Q12163	236 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	LCB4	Q12246	624 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	YLR108C	Q12259	485 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	MTR10	Q99189	972 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	ASP3-2	P0CX77	362 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	ASP3-3	P0CX78	362 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	ASP3-4	P0CX79	362 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	GRR1	P24814	1151 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	MGR1	P25573	417 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	NAM9	P27929	486 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	NDC1	P32500	655 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	SRB6	P32570	121 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	VAM7	P32912	316 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	SFC1	P33303	322 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	PMT1	P33775	817 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	SKT5	P34226	696 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	MRP21	P38175	177 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	FUI1	P38196	639 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	SIF2	P38262	535 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	YHR054C	P38780	354 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	RRG9	P40156	214 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	MAF1	P41910	395 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	RPE1	P46969	238 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	YJL043W	P47053	257 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	STE24	P47154	453 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	TOM22	P49334	152 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	BOL2	P53082	120 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	YGR026W	P53217	278 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	ERV29	P53337	310 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	BUD17	P53727	317 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	KAP120	Q02932	1032 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	YPL113C	Q02961	396 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	PEX25	Q02969	394 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	ODC1	Q03028	310 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	SNZ1	Q03148	297 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	NHP10	Q03435	203 aa		3.57	□□□□□ -1.84

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