RNA–Protein interactions for RNA: YHR135C

YCK1, Transcript of Palmitoylated plasma membrane-bound casein kinase I (CK1) isoform, yeast

Gene YCK1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCK1	YHR135C	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	TPC1	P53257	314 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	COS1	P53822	381 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	YSA1	Q01976	231 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	INP1	Q03694	420 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	TPP1	Q03796	238 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	RNH1	Q04740	348 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	YML053C	Q04978	212 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	YLR446W	Q06204	433 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	PNS1	Q12412	539 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	FMP27	Q06179	2628 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	YOL163W	P0CF20	169 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	SNF6	P18888	332 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	MXR2	P25566	168 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	YCR100C	P25606	316 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	RIB7	P33312	244 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	BAP2	P38084	609 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	MGE1	P38523	228 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	YKR005C	Q02203	525 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	YMR087W	Q04299	284 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	ELP6	Q04868	273 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	ARV1	Q06541	321 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	SPC3	Q12133	184 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	YOL162W	P0CF19	215 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.66	□□□□□ -1.5	not detected
YCK1	YHR135C	AAC3	P18238	307 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	SNF5	P18480	905 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	GPX2	P38143	162 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	CHA4	P43634	648 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	YKR011C	Q02209	353 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	FIN1	Q03898	291 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	RSM24	Q03976	319 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	VID22	Q05934	901 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	CRT10	Q08226	957 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	ACF2	Q12168	779 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	DFG16	Q99234	619 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	GAL4	P04386	881 aa		5.65	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	CWP1	P28319	239 aa		5.65	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	PUP2	P32379	260 aa		5.65	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	HOG1	P32485	435 aa		5.65	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	TOD6	P34219	525 aa		5.65	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	YHR035W	P38769	630 aa		5.65	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	TRR2	P38816	342 aa		5.65	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	PEX18	P38855	283 aa		5.65	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	MDM31	P38880	579 aa		5.65	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	PEX7	P39108	375 aa		5.65	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	PZF1	P39933	429 aa		5.65	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	YEL068C	P39977	110 aa		5.65	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	PCL6	P40038	420 aa		5.65	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	CFD1	P40558	293 aa		5.65	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	AAD10	P47182	288 aa		5.65	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	EXG2	P52911	562 aa		5.65	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	BUD17	P53727	317 aa		5.65	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	CPR8	P53728	308 aa		5.65	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	CIK1	Q01649	594 aa		5.65	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	SSY1	Q03770	852 aa		5.65	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	YDL211C	Q12121	372 aa		5.65	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	MED2	Q12124	431 aa		5.65	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	NFT1	P0CE68	1218 aa		5.64	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	ERD1	P16151	362 aa		5.64	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	APN1	P22936	367 aa		5.64	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	GIT1	P25346	518 aa		5.64	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	HIR2	P32480	875 aa		5.64	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	ORC2	P32833	620 aa		5.64	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	VPS51	P36116	164 aa		5.64	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	RPS27B	P38711	82 aa		5.64	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	ANS1	P38832	159 aa		5.64	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	DDI1	P40087	428 aa		5.64	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	IRC6	P43615	237 aa		5.64	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	IRC7	P43623	340 aa		5.64	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	5.64	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	OST6	Q03723	332 aa		5.64	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	FRE5	Q08908	694 aa		5.64	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	UIP4	Q08926	304 aa		5.64	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	5.64	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
YCK1	YHR135C	TPO4	Q12256	659 aa		5.64	□□□□□ -1.51

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