RNA–Protein interactions for RNA: YHR085W

IPI1, Transcript of Component of the Rix1 complex and possibly pre-replicative complexes, yeast

Gene IPI1, Length 1,005 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IPI1	YHR085W	NAS6	P50086	228 aa		5.1	□□□□□ -1.59
IPI1	YHR085W	YGL117W	P53133	265 aa		5.1	□□□□□ -1.59
IPI1	YHR085W	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
IPI1	YHR085W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
IPI1	YHR085W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
IPI1	YHR085W	BNA5	Q05979	453 aa		5.1	□□□□□ -1.59
IPI1	YHR085W	YLR456W	Q06199	204 aa		5.1	□□□□□ -1.59
IPI1	YHR085W	YLR413W	Q06689	675 aa		5.1	□□□□□ -1.59
IPI1	YHR085W	OSW1	Q08692	278 aa		5.1	□□□□□ -1.59
IPI1	YHR085W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
IPI1	YHR085W	YDR262W	Q12331	272 aa		5.1	□□□□□ -1.59
IPI1	YHR085W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
IPI1	YHR085W	TRA1	P38811	3744 aa		5.1	□□□□□ -1.59
IPI1	YHR085W	NMT1	P14743	455 aa		5.09	□□□□□ -1.59
IPI1	YHR085W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
IPI1	YHR085W	TYR1	P20049	452 aa		5.09	□□□□□ -1.59
IPI1	YHR085W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
IPI1	YHR085W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
IPI1	YHR085W	SFC1	P33303	322 aa		5.09	□□□□□ -1.59
IPI1	YHR085W	CAF4	P36130	643 aa		5.09	□□□□□ -1.59
IPI1	YHR085W	RRN10	P38204	145 aa		5.09	□□□□□ -1.59
IPI1	YHR085W	TSC10	P38342	320 aa		5.09	□□□□□ -1.59
IPI1	YHR085W	MEP2	P41948	499 aa		5.09	□□□□□ -1.59
IPI1	YHR085W	FET5	P43561	622 aa		5.09	□□□□□ -1.59
IPI1	YHR085W	USE1	P53146	245 aa		5.09	□□□□□ -1.59
IPI1	YHR085W	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
IPI1	YHR085W	SKO1	Q02100	647 aa		5.09	□□□□□ -1.59
IPI1	YHR085W	ARO10	Q06408	635 aa		5.09	□□□□□ -1.59
IPI1	YHR085W	BSC6	Q08280	497 aa		5.09	□□□□□ -1.59
IPI1	YHR085W	FRE3	Q08905	711 aa		5.09	□□□□□ -1.59
IPI1	YHR085W	REX3	Q12090	404 aa		5.09	□□□□□ -1.59
IPI1	YHR085W	YOR114W	Q12219	294 aa		5.09	□□□□□ -1.59
IPI1	YHR085W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	RIP1	P08067	215 aa		5.08	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	BUB3	P26449	341 aa		5.08	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.08	□□□□□ -1.6	not detected
IPI1	YHR085W	SLM4	P38247	162 aa		5.08	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	ARN1	P38731	627 aa		5.08	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	APQ12	P40532	138 aa		5.08	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	PRM10	P42946	383 aa		5.08	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	YFL015C	P43578	164 aa		5.08	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	MET31	Q03081	177 aa		5.08	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	COS7	Q07788	383 aa		5.08	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	TEN1	Q07921	160 aa		5.08	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	UAF30	Q08747	228 aa		5.08	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		5.08	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	SRN2	Q99176	213 aa		5.08	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	YPR096C	O13587	100 aa		5.07	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	MDM35	O60200	86 aa		5.07	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	ARG81	P05085	880 aa		5.07	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	RSR1	P13856	272 aa		5.07	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	ADE1	P27616	306 aa		5.07	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	WSS1	P38838	269 aa		5.07	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	MIT1	P40002	666 aa		5.07	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	YIL152W	P40455	235 aa		5.07	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	AIM22	P47051	409 aa		5.07	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	YGR149W	P48236	432 aa		5.07	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	YNL260C	P53846	198 aa		5.07	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	MSC1	Q03104	513 aa		5.07	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	YOL131W	Q08270	108 aa		5.07	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	MMT2	Q08970	484 aa		5.07	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	YPR202W	Q08993	238 aa		5.07	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	MED2	Q12124	431 aa		5.07	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	YDR061W	Q12298	539 aa		5.07	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	ATP6	P00854	259 aa		5.06	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	RAP1	P11938	827 aa		5.06	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	MXR2	P25566	168 aa		5.06	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	PHO91	P27514	894 aa		5.06	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	COX13	P32799	129 aa		5.06	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	HPM1	P40481	377 aa		5.06	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	PMT4	P46971	762 aa		5.06	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	ROG1	P53118	685 aa		5.06	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	ECM11	Q04110	302 aa		5.06	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	AEP3	Q12089	606 aa		5.06	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	ACF2	Q12168	779 aa		5.06	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	SPS4	P09937	338 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	PTP1	P25044	335 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	ATO2	P32907	282 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	LEU5	P38702	357 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	MNL1	P38888	796 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	YIL086C	P40503	102 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	MDE1	P47095	244 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IPI1	YHR085W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6

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