RNA–Protein interactions for RNA: YGL248W

PDE1, Transcript of Low-affinity cyclic AMP phosphodiesterase, yeast

Gene PDE1, Length 1,110 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PDE1	YGL248W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDE1	YGL248W	RAV1	P47104	1357 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE1	YGL248W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDE1	YGL248W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDE1	YGL248W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDE1	YGL248W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDE1	YGL248W	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDE1	YGL248W	CLG1	P35190	452 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE1	YGL248W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDE1	YGL248W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDE1	YGL248W	MRX3	P38172	270 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE1	YGL248W	TSC10	P38342	320 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE1	YGL248W	ATG7	P38862	630 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE1	YGL248W	FMP52	P40008	231 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE1	YGL248W	GET2	P40056	285 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE1	YGL248W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDE1	YGL248W	POP1	P41812	875 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE1	YGL248W	CIN2	P46670	268 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE1	YGL248W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDE1	YGL248W	AIM24	P47127	394 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE1	YGL248W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDE1	YGL248W	AZR1	P50080	613 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE1	YGL248W	NIF3	P53081	288 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE1	YGL248W	FHN1	P53279	174 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE1	YGL248W	BUD17	P53727	317 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE1	YGL248W	IBD2	P53892	351 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE1	YGL248W	SED5	Q01590	340 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE1	YGL248W	YPL068C	Q02749	293 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE1	YGL248W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDE1	YGL248W	YDR209C	Q03480	137 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE1	YGL248W	TRM82	Q03774	444 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE1	YGL248W	SMP3	Q04174	516 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE1	YGL248W	PRM6	Q04705	352 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE1	YGL248W	YLR224W	Q05947	369 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE1	YGL248W	SOR2	Q07786	357 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE1	YGL248W	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE1	YGL248W	YOR114W	Q12219	294 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE1	YGL248W	BBP1	Q12365	385 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDE1	YGL248W	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	PET54	P10834	293 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	NAM2	P11325	894 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	URA6	P15700	204 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	DBF2	P22204	572 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	MXR2	P25566	168 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	FUB1	P25659	250 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	TIP20	P33891	701 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	SHP1	P34223	423 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	MYO3	P36006	1272 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	DDI1	P40087	428 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	ALG8	P40351	577 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	YGR201C	P42936	225 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	TRS85	P46944	698 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	PHO23	P50947	330 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	MGA1	P53050	456 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	GTR2	P53290	341 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	COS6	P53344	381 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	MSC1	Q03104	513 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	SNO1	Q03144	224 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	NUP53	Q03790	475 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	MFG1	Q07684	458 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	YOR387C	Q08910	206 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	YPQ1	Q12010	308 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	RNH203	Q12338	110 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	JLP1	Q12358	412 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	CDC8	P00572	216 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	ACB1	P31787	87 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	CUE1	P38428	203 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	DBP8	P38719	431 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	PHM8	P40025	321 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	BMT5	P40493	336 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	YIR016W	P40572	265 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	YFH7	P43591	353 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	TAD2	P47058	250 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	MKC7	P53379	596 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	YPR003C	P53394	754 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	NUP49	Q02199	472 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	RAD34	Q06665	692 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	DAS2	Q12084	232 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	RKM5	Q12367	367 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE1	YGL248W	RPN6	Q12377	434 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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