RNA–Protein interactions for RNA: YDR369C

XRS2, Transcript of Protein required for DNA repair, yeast

Gene XRS2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
XRS2	YDR369C	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	CBP1	P07252	654 aa		3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	SEC12	P11655	471 aa		3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	LOT5	P34234	306 aa		3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YCR087C-A	P37263	153 aa		3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YBR220C	P38318	560 aa		3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	FMC1	P40491	155 aa		3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	MET28	P40573	187 aa		3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	SSU1	P41930	458 aa		3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	NIT2	P47016	307 aa		3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YJR149W	P47177	404 aa		3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	ERV29	P53337	310 aa		3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	EOS1	P53938	366 aa		3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	GRX5	Q02784	150 aa		3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	STD1	Q02794	444 aa		3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	SNO1	Q03144	224 aa		3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	SPR28	Q04921	423 aa		3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	POM33	Q12164	279 aa		3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	MHT1	Q12525	324 aa		3.42	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	AI3	P03877	415 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	RHO2	P06781	192 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	DDI2	P0CH63	225 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	DDI3	P0CH64	225 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	RPP1B	P10622	106 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	UNG1	P12887	359 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	ERD2	P18414	219 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	KIN82	P25341	720 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	PEX2	P32800	271 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YOX1	P34161	385 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YBR284W	P38150	797 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	POP8	P38208	133 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	GIP2	P40036	548 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	COG3	P40094	801 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	GAT2	P40209	560 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	CIT3	P43635	486 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	TAX4	P47030	604 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	MKC7	P53379	596 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YPR003C	P53394	754 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	ARG5,6	Q01217	863 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	AAT1	Q01802	451 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YAP6	Q03935	383 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	TRM12	Q04235	462 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	PRM6	Q04705	352 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YMR253C	Q04835	414 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	PEX30	Q06169	523 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	CTS2	Q06350	511 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	GPM2	Q12008	311 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	SRO7	Q12038	1033 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	TPO4	Q12256	659 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YDL199C	Q12407	687 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	SUS1	Q6WNK7	96 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YOR304C-A	O14468	76 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	ALG7	P07286	448 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	SGA1	P08019	549 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.41	□□□□□ -1.86	not detected
XRS2	YDR369C	EPT1	P22140	391 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	BOS1	P25385	244 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	TRS65	P32893	560 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	GMH1	P36125	273 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	GPT2	P36148	743 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	MRPL28	P36527	147 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	EHT1	P38295	451 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	EFM1	P38732	585 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	PFS1	P38872	237 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	PHO90	P39535	881 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YAR1	P46683	200 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	BNA1	P47096	177 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	DAN1	P47178	298 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	COQ6	P53318	479 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	NRK1	P53915	240 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	EKI1	Q03764	534 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	NAT4	Q04751	285 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	ENT4	Q07872	247 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	CRT10	Q08226	957 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	TGS1	Q12052	315 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	TFC7	Q12415	435 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	SKS1	Q12505	502 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86

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