RNA–Protein interactions for RNA: YDL113C

ATG20, Transcript of Sorting nexin family member, yeast

Gene ATG20, Length 1,923 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG20	YDL113C	INP1	Q03694	420 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	YLR352W	Q06479	807 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	CDA2	Q06703	312 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	MDM36	Q06820	579 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	YOR019W	Q99248	730 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	OAC1	P32332	324 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	PTR2	P32901	601 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	OAR1	P35731	278 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	SRO77	P38163	1010 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	RTC2	P38279	296 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	ZRG8	P40021	1076 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	GID8	P40208	455 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	SNM1	P40993	198 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	IRC6	P43615	237 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	SSY5	P47002	699 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	IBA57	P47158	497 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	SUN4	P53616	420 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	COS1	P53822	381 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	CIK1	Q01649	594 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	YPL068C	Q02749	293 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	FIN1	Q03898	291 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	RSF1	Q05043	376 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	NEJ1	Q06148	342 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	YDL114W	Q07530	308 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	YDR262W	Q12331	272 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG20	YDL113C	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	RPB5	P20434	215 aa		4.84	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	PTP1	P25044	335 aa		4.84	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	YCR100C	P25606	316 aa		4.84	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	DOA1	P36037	715 aa		4.84	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	YHR112C	P38716	378 aa		4.84	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	YNL195C	P40168	261 aa		4.84	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	JLP2	P40206	208 aa		4.84	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	LTP1	P40347	161 aa		4.84	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	LEM3	P42838	414 aa		4.84	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	BNA2	P47125	453 aa		4.84	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	NUP57	P48837	541 aa		4.84	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	YKR005C	Q02203	525 aa		4.84	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	RSM24	Q03976	319 aa		4.84	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	FDH1	Q08911	376 aa		4.84	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	LAG2	Q92325	660 aa		4.84	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	FMP27	Q06179	2628 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	CDC26	P14724	124 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	SRB5	P32585	307 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	MDM31	P38880	579 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	RCY1	P39531	840 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	YER158C	P40095	573 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	BIT61	P47041	543 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	YDR541C	Q03049	344 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	GAL83	Q04739	417 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	VID22	Q05934	901 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	SCM3	Q12334	223 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	PNS1	Q12412	539 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	CBS1	P14066	229 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	TFS1	P14306	219 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	SAC7	P17121	654 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	SNF6	P18888	332 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	RAD51	P25454	400 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	MXR2	P25566	168 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	MSN2	P33748	704 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	GPX2	P38143	162 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	CCZ1	P38273	704 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	YHR035W	P38769	630 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	PZF1	P39933	429 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	SMK1	P41808	388 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	TIM10	P87108	93 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	YSA1	Q01976	231 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	ABZ2	Q03266	374 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	ARV1	Q06541	321 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	XYL2	Q07993	356 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	AVO1	Q08236	1176 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	MED2	Q12124	431 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	SPC3	Q12133	184 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG20	YDL113C	ACF2	Q12168	779 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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