RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549007.1

APAF1-208, Transcript of apoptotic peptidase activating factor 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene APAF1, Length 3,492 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APAF1-208	ENST00000549007	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	MRC1	P22897	1456 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	AP1G1	O43747	822 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	APP	P05067	770 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	KIF11	P52732	1056 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	CEP68	Q76N32	757 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	ZNF521	Q96K83	1311 aa		4.61	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007		A6NNZ2	444 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	CHL1	O00533	1208 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	KDM1A	O60341	852 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	PAM	P19021	973 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	TACR1	P25103	407 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	BMP8B	P34820	402 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	KIR3DS1	Q14943	382 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	NGEF	Q8N5V2	710 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	SERPINB3	P29508	390 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	ZNF827	Q17R98	1081 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	GATA6	Q92908	595 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	TEKT5	Q96M29	485 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	CEP41	Q9BYV8	373 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	FNIP2	Q9P278	1114 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	USP16	Q9Y5T5	823 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	TMEM82	A0PJX8	343 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	LTF	P02788	710 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	A1BG	P04217	495 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	ZNF853	P0CG23	659 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	GNAI1	P63096	354 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	KCNAB2	Q13303	367 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	MBTPS1	Q14703	1052 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	UBE2F	Q969M7	185 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	ANO3	Q9BYT9	981 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	PMM2	O15305	246 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	RFPL1	O75677	317 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	GNAT1	P11488	350 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	GPR3	P46089	330 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	PROSER3	Q2NL68	480 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	MYL6B	P14649	208 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	SLFN5	Q08AF3	891 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	TERF2	Q15554	542 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APAF1-208	ENST00000549007	CRY1	Q16526	586 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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