RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498007.1

HLA-B-255, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 1,087 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-255ENST00000498007 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
HLA-B-255ENST00000498007 CALML4Q96GE6 196 aa22.03■■□□□ 1.12
HLA-B-255ENST00000498007 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.03■■□□□ 1.12
HLA-B-255ENST00000498007 NLRP4Q96MN2 994 aa22.03■■□□□ 1.12
HLA-B-255ENST00000498007 NT5C3AQ9H0P0 336 aa22.03■■□□□ 1.12
HLA-B-255ENST00000498007 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa22.03■■□□□ 1.12
HLA-B-255ENST00000498007 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
HLA-B-255ENST00000498007 MICAL3Q7RTP6 2002 aa22.02■■□□□ 1.12
HLA-B-255ENST00000498007 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
HLA-B-255ENST00000498007 BAIAP3O94812 1187 aa22.02■■□□□ 1.12
HLA-B-255ENST00000498007 KARSQ15046 597 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
HLA-B-255ENST00000498007 HYIQ5T013 277 aa22.02■■□□□ 1.12
HLA-B-255ENST00000498007 PADI6Q6TGC4 694 aa22.02■■□□□ 1.12
HLA-B-255ENST00000498007 KSR1Q8IVT5 923 aa22.02■■□□□ 1.12
HLA-B-255ENST00000498007 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
HLA-B-255ENST00000498007 EPSTI1Q96J88 318 aa22.02■■□□□ 1.12
HLA-B-255ENST00000498007 ADAMTS10Q9H324 1103 aa22.02■■□□□ 1.12
HLA-B-255ENST00000498007 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
HLA-B-255ENST00000498007 CFAP45Q9UL16 551 aa22.02■■□□□ 1.12
HLA-B-255ENST00000498007 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa22.02■■□□□ 1.12
HLA-B-255ENST00000498007 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa22.01■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 RPS6KA5O75582 802 aa22.01■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 EYA4O95677 639 aa22.01■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 DDIT3P35638 169 aa22.01■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 KCNJ6P48051 423 aa22.01■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 NUCB2P80303 420 aa22.01■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 IKBKEQ14164 716 aa22.01■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 TMEM119Q4V9L6 283 aa22.01■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 RASIP1Q5U651 963 aa22.01■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 ATL3Q6DD88 541 aa22.01■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 USP49Q70CQ1 688 aa22.01■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 USP38Q8NB14 1042 aa22.01■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 APBB2Q92870 758 aa22.01■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.01■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa22.01■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 PTPRSQ13332 1948 aa22■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 A0A087WZ62 844 aa22■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 PPP6R2O75170 966 aa22■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP22■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 TXLNAP40222 546 aa22■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 WDR5P61964 334 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 FAM102BQ5T8I3 360 aa22■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 MCPH1Q8NEM0 835 aa22■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 KCNG4Q8TDN1 519 aa22■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 GPRC5CQ9NQ84 441 aa22■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 PADI3Q9ULW8 664 aa22■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 SQORQ9Y6N5 450 aa22■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa21.99■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 SLC26A4O43511 780 aa21.99■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 PLCG1P19174 1290 aa21.99■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 KRT85P78386 507 aa21.99■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa21.99■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 ZNF410Q86VK4 478 aa21.99■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 FAM228AQ86W67 206 aa21.99■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 ZNF710Q8N1W2 664 aa21.99■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 ASAP3Q8TDY4 903 aa21.99■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 EFCAB14O75071 495 aa21.98■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa21.98■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 DARSP14868 501 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 ME1P48163 572 aa21.98■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 DEFB103AP81534 67 aa21.98■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 CDC42EP1Q00587 391 aa21.98■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 LRIT3Q3SXY7 679 aa21.98■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 CCSER1Q9C0I3 900 aa21.98■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 ERVK-5Q9HDB9 667 aa21.98■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 GBF1Q92538 1859 aa21.98■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 GRXCR1A8MXD5 290 aa21.97■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 PLA2G4BP0C869 781 aa21.97■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 CYP11B2P19099 503 aa21.97■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 FGFR4P22455 802 aa21.97■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.111e-7■■□□□ 12
HLA-B-255ENST00000498007 RNF149Q8NC42 400 aa21.97■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 LRRC15Q8TF66 581 aa21.97■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 RUSC1Q9BVN2 902 aa21.97■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 CCDC39Q9UFE4 941 aa21.97■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa21.97■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 GPR182O15218 404 aa21.96■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 CUTAO60888 179 aa21.96■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 ARL2P36404 184 aa21.96■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 CAPSQ13938 189 aa21.96■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 ODR4Q5SWX8 454 aa21.96■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 KCTD17Q8N5Z5 321 aa21.96■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 SPATA32Q96LK8 384 aa21.96■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 SLC9A7Q96T83 725 aa21.96■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 POLD4Q9HCU8 107 aa21.96■■□□□ 1.11
HLA-B-255ENST00000498007 ASAP2O43150 1006 aa21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms