RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000060956.12

Trappc1-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc1, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Asb16Q8VHS5 453 aa6.32□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tmco4Q91WU4 631 aa6.32□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 SdhbQ9CQA3 282 aa6.32□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Themis3Q9CU24 569 aa6.32□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Atp6ap2Q9CYN9 350 aa6.32□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Wdr89Q9D0R9 386 aa6.32□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pramef12Q9D2F1 463 aa6.32□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cdc42ep4Q9JM96 349 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 NpwA0A1L1STR8 176 aa6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mamdc4A2AJA7 1228 aa6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm10073E9Q3T0 114 aa6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kdelc2G5E897 503 aa6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc4a4O88343 1079 aa6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Myl3P09542 204 aa6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gas2P11862 314 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fgfr1P16092 822 aa6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Il4rP16382 810 aa6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cyp2d10P24456 504 aa6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cst8P32766 142 aa6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Eya3P97480 510 aa6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pou2f2Q00196 463 aa6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cobll1Q3UMF0 1273 aa6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fam196aQ3USH1 422 aa6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm29609Q3UU56 907 aa6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Trappc3lQ4KL14 181 aa6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mctp2Q5RJH2 878 aa6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pou4f3Q63955 338 aa6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Actn1Q7TPR4 892 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dsg1bQ7TSF1 1060 aa6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Trim56Q80VI1 734 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 HomezQ80W88 542 aa6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gtf2a2Q80ZM7 109 aa6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc2a12Q8BFW9 622 aa6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fbxo9Q8BK06 437 aa6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gtf3c2Q8BL74 907 aa6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Trpa1Q8BLA8 1125 aa6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 PisdQ8BSF4 406 aa6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gbp9Q8BTS3 619 aa6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Trmt13Q8BYH3 481 aa6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Map1sQ8C052 973 aa6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fez1Q8K0X8 392 aa6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Bst2Q8R2Q8 172 aa6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr127Q8VF25 323 aa6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mtmr4Q91XS1 1190 aa6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cwh43Q91YL7 699 aa6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mfsd5Q921Y4 450 aa6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nrif1Q923B3 828 aa6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tas1r1Q99PG6 842 aa6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 PdhbQ9D051 359 aa6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 PrameQ9D4Z5 464 aa6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ddx21Q9JIK5 851 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mtmr7Q9Z2C9 660 aa6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Bnip3lQ9Z2F7 218 aa6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Znf638Q61464 1960 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Scn3aA2ASI5 1947 aa6.31□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ano3A2AHL1 981 aa6.3□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sec14l1A8Y5H7 715 aa6.3□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 StrnO55106 780 aa6.3□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mt-CybP00158 381 aa6.3□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc2a7P0C6A1 513 aa6.3□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Wee1P47810 646 aa6.3□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pla2g6P97819 807 aa6.3□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sap30bpQ02614 308 aa6.3□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fbln1Q08879 705 aa6.3□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ttbk2Q3UVR3 1243 aa6.3□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kctd1Q5M956 257 aa6.3□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Myo19Q5SV80 963 aa6.3□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Satb1Q60611 764 aa6.3□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Il17raQ60943 864 aa6.3□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Swap70Q6A028 585 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tacc1Q6Y685 774 aa6.3□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 HhipQ7TN16 700 aa6.3□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ttll4Q80UG8 1193 aa6.3□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ece2Q80Z60 881 aa6.3□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 NkrfQ8BY02 690 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 MslnlQ8C160 685 aa6.3□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tceal5Q8CCT4 200 aa6.3□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Iqsec1Q8R0S2 961 aa6.3□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Calhm5Q8R100 309 aa6.3□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Atp5c1Q91VR2 298 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 WwoxQ91WL8 414 aa6.3□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mdm1Q9D067 708 aa6.3□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Chmp5Q9D7S9 219 aa6.3□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Add2Q9QYB8 725 aa6.3□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Wdr46Q9Z0H1 622 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Wdfy3Q6VNB8 3508 aa6.3□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Wdr19Q3UGF1 1341 aa6.29□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 A0A1W2P6Q8 802 aa6.29□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm9048A0A1W2P7H4 802 aa6.29□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 A0A1W2P7Z8 802 aa6.29□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm9046A0A1W2P855 802 aa6.29□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm5624F6ZZG8 207 aa6.29□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Angpt1O08538 498 aa6.29□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Stag2O35638 1231 aa6.29□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mmp8O70138 465 aa6.29□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nmt2O70311 529 aa6.29□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Xrcc6P23475 608 aa6.29□□□□□ -1.4
Trappc1-201ENSMUST00000060956 NfibP97863 570 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.1 ms