Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43.76■■■■■ 4.6
Stag2O35638 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Stag2O35638 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
Stag2O35638 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Stag2O35638 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
Stag2O35638 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Stag2O35638 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
Stag2O35638 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Stag2O35638 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
Stag2O35638 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Stag2O35638 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Stag2O35638 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Stag2O35638 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Stag2O35638 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Stag2O35638 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Stag2O35638 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
Stag2O35638 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Stag2O35638 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Stag2O35638 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Stag2O35638 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Stag2O35638 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Stag2O35638 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Stag2O35638 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Stag2O35638 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Stag2O35638 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Stag2O35638 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Stag2O35638 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
Stag2O35638 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Stag2O35638 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
Stag2O35638 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Stag2O35638 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Stag2O35638 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Stag2O35638 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Stag2O35638 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Stag2O35638 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Stag2O35638 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Stag2O35638 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Stag2O35638 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Stag2O35638 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
Stag2O35638 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Stag2O35638 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Stag2O35638 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Stag2O35638 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Stag2O35638 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Stag2O35638 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Stag2O35638 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Stag2O35638 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Stag2O35638 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Stag2O35638 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Stag2O35638 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Stag2O35638 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Stag2O35638 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Stag2O35638 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Stag2O35638 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Stag2O35638 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Stag2O35638 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Stag2O35638 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Stag2O35638 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Stag2O35638 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Stag2O35638 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Stag2O35638 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Stag2O35638 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Stag2O35638 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Stag2O35638 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Stag2O35638 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Stag2O35638 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Stag2O35638 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Stag2O35638 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Stag2O35638 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Stag2O35638 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Stag2O35638 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Stag2O35638 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Stag2O35638 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Stag2O35638 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Stag2O35638 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Stag2O35638 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Stag2O35638 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Stag2O35638 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Stag2O35638 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Stag2O35638 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Stag2O35638 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Stag2O35638 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Stag2O35638 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Stag2O35638 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Stag2O35638 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Stag2O35638 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Stag2O35638 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Stag2O35638 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Stag2O35638 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Stag2O35638 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Stag2O35638 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Stag2O35638 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Stag2O35638 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Stag2O35638 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Stag2O35638 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Stag2O35638 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Stag2O35638 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Stag2O35638 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Stag2O35638 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Stag2O35638 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms