Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43,76■■■■■ 4,6
Stag2O35638 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40,36■■■■■ 4,05
Stag2O35638 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,76■■■■□ 3,96
Stag2O35638 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,11■■■■□ 3,85
Stag2O35638 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38,46■■■■□ 3,75
Stag2O35638 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,22■■■■□ 3,71
Stag2O35638 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37,85■■■■□ 3,65
Stag2O35638 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,78■■■■□ 3,64
Stag2O35638 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37,72■■■■□ 3,63
Stag2O35638 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,17■■■■□ 3,54
Stag2O35638 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,92■■■■□ 3,5
Stag2O35638 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,69■■■■□ 3,46
Stag2O35638 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36,53■■■■□ 3,44
Stag2O35638 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36,49■■■■□ 3,43
Stag2O35638 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,35■■■■□ 3,41
Stag2O35638 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36,26■■■■□ 3,4
Stag2O35638 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36,16■■■■□ 3,38
Stag2O35638 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,89■■■■□ 3,34
Stag2O35638 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,88■■■■□ 3,33
Stag2O35638 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,86■■■■□ 3,33
Stag2O35638 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,84■■■■□ 3,33
Stag2O35638 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,82■■■■□ 3,32
Stag2O35638 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,67■■■■□ 3,3
Stag2O35638 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,57■■■■□ 3,28
Stag2O35638 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35,45■■■■□ 3,27
Stag2O35638 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,44■■■■□ 3,26
Stag2O35638 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35,4■■■■□ 3,26
Stag2O35638 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,36■■■■□ 3,25
Stag2O35638 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35,32■■■■□ 3,24
Stag2O35638 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35,04■■■■□ 3,2
Stag2O35638 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,19
Stag2O35638 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,94■■■■□ 3,18
Stag2O35638 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34,84■■■■□ 3,17
Stag2O35638 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,75■■■■□ 3,15
Stag2O35638 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34,7■■■■□ 3,15
Stag2O35638 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,69■■■■□ 3,14
Stag2O35638 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,62■■■■□ 3,13
Stag2O35638 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,59■■■■□ 3,13
Stag2O35638 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34,51■■■■□ 3,12
Stag2O35638 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,51■■■■□ 3,12
Stag2O35638 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34,32■■■■□ 3,08
Stag2O35638 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,29■■■■□ 3,08
Stag2O35638 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,17■■■■□ 3,06
Stag2O35638 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34,15■■■■□ 3,06
Stag2O35638 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Stag2O35638 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3,03
Stag2O35638 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3,03
Stag2O35638 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3,03
Stag2O35638 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33,99■■■■□ 3,03
Stag2O35638 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
Stag2O35638 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Stag2O35638 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Stag2O35638 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33,78■■■■□ 3
Stag2O35638 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33,76■■■□□ 2,99
Stag2O35638 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
Stag2O35638 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33,73■■■□□ 2,99
Stag2O35638 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
Stag2O35638 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,55■■■□□ 2,96
Stag2O35638 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33,49■■■□□ 2,95
Stag2O35638 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33,48■■■□□ 2,95
Stag2O35638 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33,43■■■□□ 2,94
Stag2O35638 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,42■■■□□ 2,94
Stag2O35638 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
Stag2O35638 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,37■■■□□ 2,93
Stag2O35638 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33,37■■■□□ 2,93
Stag2O35638 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33,3■■■□□ 2,92
Stag2O35638 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,3■■■□□ 2,92
Stag2O35638 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,3■■■□□ 2,92
Stag2O35638 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,26■■■□□ 2,92
Stag2O35638 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33,21■■■□□ 2,91
Stag2O35638 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,21■■■□□ 2,91
Stag2O35638 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Stag2O35638 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Stag2O35638 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33,06■■■□□ 2,88
Stag2O35638 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33,03■■■□□ 2,88
Stag2O35638 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
Stag2O35638 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Stag2O35638 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Stag2O35638 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32,95■■■□□ 2,87
Stag2O35638 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32,93■■■□□ 2,86
Stag2O35638 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Stag2O35638 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,87■■■□□ 2,85
Stag2O35638 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32,82■■■□□ 2,84
Stag2O35638 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32,81■■■□□ 2,84
Stag2O35638 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32,71■■■□□ 2,83
Stag2O35638 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32,7■■■□□ 2,83
Stag2O35638 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
Stag2O35638 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32,64■■■□□ 2,82
Stag2O35638 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,64■■■□□ 2,82
Stag2O35638 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32,63■■■□□ 2,81
Stag2O35638 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Stag2O35638 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32,56■■■□□ 2,8
Stag2O35638 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
Stag2O35638 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
Stag2O35638 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Stag2O35638 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
Stag2O35638 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,36■■■□□ 2,77
Stag2O35638 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,33■■■□□ 2,77
Stag2O35638 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,76
Stag2O35638 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,28■■■□□ 2,76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,5 ms