Protein–RNA interactions for Protein: Q08879

Fbln1, Fibulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbln1Q08879 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43.69■■■■■ 4.58
Fbln1Q08879 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Fbln1Q08879 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Fbln1Q08879 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Fbln1Q08879 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
Fbln1Q08879 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
Fbln1Q08879 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Fbln1Q08879 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
Fbln1Q08879 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
Fbln1Q08879 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Fbln1Q08879 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Fbln1Q08879 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Fbln1Q08879 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Fbln1Q08879 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Fbln1Q08879 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Fbln1Q08879 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
Fbln1Q08879 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Fbln1Q08879 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Fbln1Q08879 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Fbln1Q08879 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Fbln1Q08879 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
Fbln1Q08879 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Fbln1Q08879 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Fbln1Q08879 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Fbln1Q08879 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Fbln1Q08879 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Fbln1Q08879 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Fbln1Q08879 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Fbln1Q08879 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Fbln1Q08879 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Fbln1Q08879 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Fbln1Q08879 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Fbln1Q08879 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Fbln1Q08879 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
Fbln1Q08879 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Fbln1Q08879 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Fbln1Q08879 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Fbln1Q08879 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Fbln1Q08879 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Fbln1Q08879 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Fbln1Q08879 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Fbln1Q08879 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Fbln1Q08879 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Fbln1Q08879 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Fbln1Q08879 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Fbln1Q08879 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Fbln1Q08879 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Fbln1Q08879 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Fbln1Q08879 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Fbln1Q08879 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Fbln1Q08879 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Fbln1Q08879 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Fbln1Q08879 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Fbln1Q08879 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Fbln1Q08879 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Fbln1Q08879 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Fbln1Q08879 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Fbln1Q08879 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Fbln1Q08879 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Fbln1Q08879 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Fbln1Q08879 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Fbln1Q08879 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Fbln1Q08879 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Fbln1Q08879 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Fbln1Q08879 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Fbln1Q08879 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Fbln1Q08879 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Fbln1Q08879 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Fbln1Q08879 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Fbln1Q08879 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Fbln1Q08879 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Fbln1Q08879 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Fbln1Q08879 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Fbln1Q08879 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Fbln1Q08879 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Fbln1Q08879 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Fbln1Q08879 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Fbln1Q08879 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Fbln1Q08879 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Fbln1Q08879 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Fbln1Q08879 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Fbln1Q08879 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Fbln1Q08879 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Fbln1Q08879 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Fbln1Q08879 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Fbln1Q08879 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Fbln1Q08879 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Fbln1Q08879 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Fbln1Q08879 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Fbln1Q08879 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Fbln1Q08879 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Fbln1Q08879 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Fbln1Q08879 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Fbln1Q08879 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Fbln1Q08879 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Fbln1Q08879 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Fbln1Q08879 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Fbln1Q08879 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Fbln1Q08879 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Fbln1Q08879 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms