Protein–RNA interactions for Protein: P97863

Nfib, Nuclear factor 1 B-type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfibP97863 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43,85■■■■■ 4,61
NfibP97863 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40,54■■■■■ 4,08
NfibP97863 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,93■■■■□ 3,98
NfibP97863 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38,32■■■■□ 3,72
NfibP97863 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38,01■■■■□ 3,68
NfibP97863 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,84■■■■□ 3,65
NfibP97863 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37,52■■■■□ 3,6
NfibP97863 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,14■■■■□ 3,54
NfibP97863 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,13■■■■□ 3,54
NfibP97863 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3,51
NfibP97863 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36,69■■■■□ 3,46
NfibP97863 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36,58■■■■□ 3,45
NfibP97863 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,58■■■■□ 3,45
NfibP97863 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,41■■■■□ 3,42
NfibP97863 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,77■■■■□ 3,32
NfibP97863 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,75■■■■□ 3,31
NfibP97863 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35,54■■■■□ 3,28
NfibP97863 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,43■■■■□ 3,26
NfibP97863 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35,42■■■■□ 3,26
NfibP97863 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35,36■■■■□ 3,25
NfibP97863 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,3■■■■□ 3,24
NfibP97863 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35,23■■■■□ 3,23
NfibP97863 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
NfibP97863 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,01■■■■□ 3,19
NfibP97863 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3,19
NfibP97863 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,99■■■■□ 3,19
NfibP97863 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,92■■■■□ 3,18
NfibP97863 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
NfibP97863 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,86■■■■□ 3,17
NfibP97863 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34,82■■■■□ 3,17
NfibP97863 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34,79■■■■□ 3,16
NfibP97863 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,75■■■■□ 3,15
NfibP97863 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,7■■■■□ 3,15
NfibP97863 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34,62■■■■□ 3,13
NfibP97863 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,54■■■■□ 3,12
NfibP97863 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34,52■■■■□ 3,12
NfibP97863 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,44■■■■□ 3,1
NfibP97863 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34,14■■■■□ 3,06
NfibP97863 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33,89■■■■□ 3,02
NfibP97863 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
NfibP97863 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
NfibP97863 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3
NfibP97863 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
NfibP97863 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33,75■■■□□ 2,99
NfibP97863 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33,64■■■□□ 2,98
NfibP97863 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,62■■■□□ 2,97
NfibP97863 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33,6■■■□□ 2,97
NfibP97863 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,52■■■□□ 2,96
NfibP97863 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33,48■■■□□ 2,95
NfibP97863 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33,47■■■□□ 2,95
NfibP97863 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,42■■■□□ 2,94
NfibP97863 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,42■■■□□ 2,94
NfibP97863 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33,32■■■□□ 2,92
NfibP97863 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33,31■■■□□ 2,92
NfibP97863 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,91
NfibP97863 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33,14■■■□□ 2,89
NfibP97863 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33,09■■■□□ 2,89
NfibP97863 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,06■■■□□ 2,88
NfibP97863 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
NfibP97863 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,87
NfibP97863 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32,95■■■□□ 2,87
NfibP97863 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,93■■■□□ 2,86
NfibP97863 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
NfibP97863 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,85■■■□□ 2,85
NfibP97863 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32,84■■■□□ 2,85
NfibP97863 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,84
NfibP97863 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
NfibP97863 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
NfibP97863 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32,64■■■□□ 2,82
NfibP97863 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,63■■■□□ 2,81
NfibP97863 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32,62■■■□□ 2,81
NfibP97863 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32,61■■■□□ 2,81
NfibP97863 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32,59■■■□□ 2,81
NfibP97863 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,57■■■□□ 2,8
NfibP97863 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
NfibP97863 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32,55■■■□□ 2,8
NfibP97863 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
NfibP97863 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
NfibP97863 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
NfibP97863 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32,53■■■□□ 2,8
NfibP97863 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,52■■■□□ 2,8
NfibP97863 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
NfibP97863 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32,45■■■□□ 2,79
NfibP97863 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
NfibP97863 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
NfibP97863 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,33■■■□□ 2,77
NfibP97863 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32,28■■■□□ 2,76
NfibP97863 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32,27■■■□□ 2,76
NfibP97863 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32,26■■■□□ 2,75
NfibP97863 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,75
NfibP97863 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC32,24■■■□□ 2,75
NfibP97863 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,21■■■□□ 2,75
NfibP97863 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,19■■■□□ 2,74
NfibP97863 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,19■■■□□ 2,74
NfibP97863 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
NfibP97863 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
NfibP97863 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC32,12■■■□□ 2,73
NfibP97863 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,11■■■□□ 2,73
NfibP97863 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC32,09■■■□□ 2,73
NfibP97863 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32,06■■■□□ 2,72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,8 ms