RNA–Protein interactions for RNA: tL(CAA)N

tL(CAA)N, Transcript of Leucine tRNA (tRNA-Leu), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeast

Gene tL(CAA)N, Length 82 nt, Biotype tRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
tL(CAA)N	tL(CAA)N	RPO26	P20435	155 aa		3.21	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	RPD3	P32561	433 aa		3.21	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	SEC17	P32602	292 aa		3.21	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	SEC61	P32915	480 aa		3.21	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	PHO89	P38361	574 aa		3.21	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	YHR180W	P38868	163 aa		3.21	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	YNL195C	P40168	261 aa		3.21	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	YNL320W	P42840	284 aa		3.21	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	BIO4	P53630	237 aa		3.21	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	YPL109C	Q02981	657 aa		3.21	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	USA1	Q03714	838 aa		3.21	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	YDR124W	Q04608	324 aa		3.21	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	VPS74	Q06385	345 aa		3.21	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	VAC14	Q06708	880 aa		3.21	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	HNT3	Q08702	217 aa		3.21	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	YDR215C	Q12240	137 aa		3.21	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	YLR122C	Q12312	125 aa		3.21	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	SPO16	P17122	198 aa		3.2	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	DMC1	P25453	334 aa		3.2	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	STE14	P32584	239 aa		3.2	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	MKS1	P34072	584 aa		3.2	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	CLG1	P35190	452 aa		3.2	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	SPT10	P35208	640 aa		3.2	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	YOR062C	P36025	268 aa		3.2	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	PRY2	P36110	329 aa		3.2	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	YCR041W	P37265	110 aa		3.2	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	SCO2	P38072	301 aa		3.2	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	EXO84	P38261	753 aa		3.2	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	YBR138C	P38277	524 aa		3.2	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	ECM34	P38728	170 aa		3.2	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	RBG1	P39729	369 aa		3.2	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	YFL066C	P43538	392 aa		3.2	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	TOS2	P50078	622 aa		3.2	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	UBC13	P52490	153 aa		3.2	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	SCW11	P53189	542 aa		3.2	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	SNF12	P53628	566 aa		3.2	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	YPL077C	Q02831	240 aa		3.2	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	TAF11	Q04226	346 aa		3.2	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	NAT4	Q04751	285 aa		3.2	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	CTS2	Q06350	511 aa		3.2	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	ENB1	Q08299	606 aa		3.2	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	FIT3	Q08907	204 aa		3.2	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	YDL176W	Q12027	708 aa		3.2	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	BTS1	Q12051	335 aa		3.2	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	YDL109C	Q12103	647 aa		3.2	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	MCP1	Q12106	302 aa		3.2	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	FSH3	Q99369	266 aa		3.2	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	HAP4	P14064	554 aa		3.19	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	YAK1	P14680	807 aa		3.19	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	CLB2	P24869	491 aa		3.19	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	CTR86	P25355	563 aa		3.19	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	MIG1	P27705	504 aa		3.19	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	RAD14	P28519	371 aa		3.19	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	FIG1	P38224	298 aa		3.19	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	PSD1	P39006	500 aa		3.19	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	QDR2	P40474	542 aa		3.19	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	MRPS18	P42847	217 aa		3.19	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	GTR2	P53290	341 aa		3.19	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	ECM11	Q04110	302 aa		3.19	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	NDL1	Q06568	189 aa		3.19	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	UNG1	P12887	359 aa		3.18	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	PET123	P17558	318 aa		3.18	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	NPP1	P25353	742 aa		3.18	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.18	□□□□□ -1.9	not detected
tL(CAA)N	tL(CAA)N	CLB6	P32943	380 aa		3.18	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	YHR035W	P38769	630 aa		3.18	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.18	□□□□□ -1.9	not detected
tL(CAA)N	tL(CAA)N	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	NIT3	P49954	291 aa		3.18	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	YNL046W	P53956	172 aa		3.18	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	CTR9	P89105	1077 aa		3.18	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	RSM24	Q03976	319 aa		3.18	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	PNP1	Q05788	311 aa		3.18	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	AVO1	Q08236	1176 aa		3.18	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	RTN2	Q12443	393 aa		3.18	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	MHF1	Q3E835	90 aa		3.18	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		3.18	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	RPL39	P04650	51 aa		3.17	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	RPS23B	P0CX30	145 aa		3.17	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
tL(CAA)N	tL(CAA)N	SEC12	P11655	471 aa		3.17	□□□□□ -1.9

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.9 ms