RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeastyeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3YPR069C TPK2P06245 380 aa6.2□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C MOD5P07884 428 aa6.2□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C SEC2P17065 759 aa6.2□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C SAN1P22470 610 aa6.2□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C GFD2P25370 566 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C CSM1P25651 190 aa6.2□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C PRS3P38689 320 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C ECM34P38728 170 aa6.2□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C RRP4P38792 359 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C MTC6P38849 526 aa6.2□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C COG3P40094 801 aa6.2□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C YFL051CP43552 160 aa6.2□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C MRPL19P53875 158 aa6.2□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C MTQ1P53944 314 aa6.2□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C RSC9Q03124 581 aa6.2□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C COX20Q04935 205 aa6.2□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C GGA1Q06336 557 aa6.2□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C PML1Q07930 204 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C NOP12Q08208 459 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C BRX1Q08235 291 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C RHO1P06780 209 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C DBP3P20447 523 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C ARN2P38724 620 aa6.19□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C BIG1P38813 335 aa6.19□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C YHR180WP38868 163 aa6.19□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C YTA6P40328 754 aa6.19□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C HXT9P40885 567 aa6.19□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C TOS2P50078 622 aa6.19□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C TWF1P53250 332 aa6.19□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C COS6P53344 381 aa6.19□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C HXT11P54862 567 aa6.19□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C YML119WQ03208 357 aa6.19□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C RAD33Q04231 177 aa6.19□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C VBA4Q04602 768 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C COQ11Q05892 277 aa6.19□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C ARV1Q06541 321 aa6.19□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C RRT8Q08219 342 aa6.19□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C YDL180WQ12301 547 aa6.19□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C MF(ALPHA)1P01149 165 aa6.18□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C TFS1P14306 219 aa6.18□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C YCK1P23291 538 aa6.18□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C HIS7P33734 552 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C MRPS5P33759 307 aa6.18□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C CHK1P38147 527 aa6.18□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C SKN7P38889 622 aa6.18□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C RFC4P40339 323 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C IDP2P41939 412 aa6.18□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C YGR201CP42936 225 aa6.18□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C MOT3P54785 490 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C TIM10P87108 93 aa6.18□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C HSP31Q04432 237 aa6.18□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C UTP21Q06078 939 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C SPO77Q06134 477 aa6.18□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C PSR1Q07800 427 aa6.18□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C YDL109CQ12103 647 aa6.18□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C DET1Q99288 334 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C THP2O13539 261 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C PRB1P09232 635 aa6.17□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C CYS4P32582 507 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C YKL187CP34231 750 aa6.17□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C SWH1P35845 1188 aa6.17□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C MTW1P39731 289 aa6.17□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C YNL195CP40168 261 aa6.17□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C SNM1P40993 198 aa6.17□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C ARF3P40994 183 aaRIP-Chip data6.17□□□□□ -1.42not detected
SPE3YPR069C TRS85P46944 698 aa6.17□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C NIT2P47016 307 aa6.17□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C PCP1P53259 346 aa6.17□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C DAM1P53267 343 aa6.17□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C YGR126WP53274 230 aa6.17□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C NAN1Q02931 896 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C YMR265CQ03508 461 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C HAS1Q03532 505 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C IRC19Q07843 230 aa6.17□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C SPO24Q3E752 67 aa6.17□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C YAL064W-BO13512 126 aa6.16□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C ERD2P18414 219 aa6.16□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C TSL1P38427 1098 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C RFC3P38629 340 aa6.16□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C YHR097CP38809 366 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C RSP5P39940 809 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C YIL165CP40446 119 aa6.16□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C ACS1Q01574 713 aa6.16□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C DYN3Q04949 312 aa6.16□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C ARO10Q06408 635 aa6.16□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C RLM1Q12224 676 aa6.16□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C SFM1Q12314 213 aa6.16□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C SUI3P09064 285 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C CDC10P25342 322 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C MET28P40573 187 aa6.15□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C TOM22P49334 152 aa6.15□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C NUP116Q02630 1113 aa6.15□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C SCS7Q03529 384 aa6.15□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C KRE28Q04431 385 aa6.15□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C DIA2Q08496 732 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C NIP7Q08962 181 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C SET6Q12529 373 aa6.15□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C MHF1Q3E835 90 aa6.15□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C DFG16Q99234 619 aa6.15□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C PEP4P07267 405 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.9 ms