RNA–Protein interactions for RNA: YMR229C

RRP5, Transcript of RNA binding protein involved in synthesis of both 18S and 5.8S rRNAs, yeast

Gene RRP5, Length 5,190 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP5	YMR229C	GPX2	P38143	162 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	NAS2	P40555	220 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	GPG1	P53130	126 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	SLI1	P53304	468 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	HXT11	P54862	567 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	YFT2	Q06676	274 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	YPR091C	Q06833	770 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	HMS1	Q12398	434 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	COX5A	P00424	153 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	CYT1	P07143	309 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	HIS5	P07172	385 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	PMT2	P31382	759 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	SCD5	P34758	872 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	YKR051W	P36142	418 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	OMA1	P36163	345 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	SHG1	P38337	142 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	TAE1	P38340	232 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	YHR033W	P38690	423 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	AIM2	P39721	246 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	ELO3	P40319	345 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	YGR067C	P53243	804 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	YKR011C	Q02209	353 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	RSC58	Q07979	502 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	CRT10	Q08226	957 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	ICT1	Q12385	394 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	DAP2	P18962	818 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	HSP30	P25619	332 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	VHR1	P40522	640 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	NEO1	P40527	1151 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	GAB1	P41733	394 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	PTR3	P43606	678 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	HMS2	P47175	358 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	MNT2	P53059	558 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	RSM27	P53305	110 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	MTM1	P53320	366 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	OAZ1	Q02803	292 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	YLR030W	Q07967	263 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	APC2	Q12440	853 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	FMP16	Q12497	93 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	MGR1	P25573	417 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	AFG1	P32317	509 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	SRL3	P36167	246 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	LEU5	P38702	357 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	IDP2	P41939	412 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	NRK1	P53915	240 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	MPS1	P54199	764 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	KAP120	Q02932	1032 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	YLR283W	Q05867	314 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	CDA2	Q06703	312 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	ASR1	Q06834	288 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	YLR040C	Q07988	224 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.14	□□□□□ -1.91	not detected
RRP5	YMR229C	ERD1	P16151	362 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	HNM1	P19807	563 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	ZRC1	P20107	442 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	OCA4	P25366	362 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	TIP20	P33891	701 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	UBA4	P38820	440 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	AXL2	P38928	823 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	YER184C	P39961	794 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	ULI1	P43604	169 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	PET130	P47065	347 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	TPN1	P53099	579 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	SAY1	P53324	424 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	CPR8	P53728	308 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	TMN2	Q04562	672 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	FRE3	Q08905	711 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	TRM13	Q12383	476 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	SPS2	P08459	502 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.14	□□□□□ -1.91	not detected
RRP5	YMR229C	CLN1	P20437	546 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	MRPL8	P22353	238 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	PRO1	P32264	428 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	BCK2	P33306	851 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	PCL6	P40038	420 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	GLC8	P41818	229 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91

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