RNA–Protein interactions for RNA: YML035C

AMD1, Transcript of AMP deaminase, yeast

Gene AMD1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AMD1	YML035C	REX3	Q12090	404 aa		5.29	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	MOD5	P07884	428 aa		5.29	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	MET2	P08465	486 aa		5.29	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	STP22	P25604	385 aa		5.29	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	PMT2	P31382	759 aa		5.29	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	ACH1	P32316	526 aa		5.29	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	HIR2	P32480	875 aa		5.29	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	IFA38	P38286	347 aa		5.29	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	JLP2	P40206	208 aa		5.29	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	MSE1	P48525	536 aa		5.29	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	SRL4	Q03085	281 aa		5.29	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	SIR3	P06701	978 aa		5.28	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	YOL163W	P0CF20	169 aa		5.28	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	CDC26	P14724	124 aa		5.28	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	IPT1	P38954	527 aa		5.28	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	YIL067C	P40514	678 aa		5.28	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	NUP57	P48837	541 aa		5.28	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	SPT20	P50875	604 aa		5.28	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	LCL3	P53153	274 aa		5.28	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	TPC1	P53257	314 aa		5.28	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	YGR168C	P53293	376 aa		5.28	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	YLR345W	Q06137	509 aa		5.28	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	PEX27	Q08580	376 aa		5.28	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	YDL211C	Q12121	372 aa		5.28	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	MED2	Q12124	431 aa		5.28	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		5.28	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	COX1	P00401	534 aa		5.28	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	AI4	P03878	556 aa		5.28	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	RPL17A	P05740	184 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	STE4	P18851	423 aa		5.28	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	LEU5	P38702	357 aa		5.28	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	ARN2	P38724	620 aa		5.28	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	YHR210C	P38893	341 aa		5.28	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	RPL17B	P46990	184 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	HMS2	P47175	358 aa		5.28	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	SNZ1	Q03148	297 aa		5.28	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	YOL073C	Q08232	322 aa		5.28	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	AI1	P03875	834 aa		5.27	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	RIP1	P08067	215 aa		5.27	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	SAM35	P14693	329 aa		5.27	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	ALG3	P38179	458 aa		5.27	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	ANS1	P38832	159 aa		5.27	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	MAL11	P53048	616 aa		5.27	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	YGR067C	P53243	804 aa		5.27	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	DMA2	P53924	522 aa		5.27	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	YSA1	Q01976	231 aa		5.27	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	YMD8	Q03697	442 aa		5.27	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	FIN1	Q03898	291 aa		5.27	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	URC2	Q04411	772 aa		5.27	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	VPS36	Q06696	566 aa		5.27	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	UIP4	Q08926	304 aa		5.27	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	NFT1	P0CE68	1218 aa		5.27	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	TFS1	P14306	219 aa		5.27	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	TOD6	P34219	525 aa		5.27	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	RCN1	P36054	211 aa		5.27	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	GPX2	P38143	162 aa		5.27	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	PZF1	P39933	429 aa		5.27	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	YEL068C	P39977	110 aa		5.27	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	GID8	P40208	455 aa		5.27	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	SMK1	P41808	388 aa		5.27	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	YDR541C	Q03049	344 aa		5.27	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	5.27	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	BAR1	P12630	587 aa		5.26	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	YLF2	P38746	405 aa		5.26	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	ALP1	P38971	573 aa		5.26	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	IES5	P40060	125 aa		5.26	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	MRPL13	Q02204	264 aa		5.26	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	TRS23	Q03784	219 aa		5.26	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	RCN2	Q12044	265 aa		5.26	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	ACF2	Q12168	779 aa		5.26	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	TRM10	Q12400	293 aa		5.26	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	GPI12	P23797	304 aa		5.26	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	RNP1	P32385	249 aa		5.26	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	CTF8	P38877	133 aa		5.26	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	YER158C	P40095	573 aa		5.26	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	CHA4	P43634	648 aa		5.26	□□□□□ -1.57
AMD1	YML035C	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57

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