RNA–Protein interactions for RNA: YLR233C

EST1, Transcript of TLC1 RNA-associated factor involved in telomere length regulation, yeast

Gene EST1, Length 2,100 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EST1	YLR233C	ROX1	P25042	368 aa		0.03	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	0.03	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	PMT2	P31382	759 aa		0.03	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	MCM10	P32354	571 aa		0.03	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	TIR2	P33890	251 aa		0.03	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	RCK1	P38622	512 aa		0.03	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	CTM1	P38818	585 aa		0.03	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	0.03	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	RRG9	P40156	214 aa		0.03	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	ASG7	P46993	209 aa		0.03	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	AIM23	P47015	356 aa		0.03	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	STE24	P47154	453 aa		0.03	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	EFM3	P47163	339 aa		0.03	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	0.03	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	0.03	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	KAP120	Q02932	1032 aa		0.03	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	YMR010W	Q03687	405 aa		0.03	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	0.03	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	YDR131C	Q03899	556 aa		0.03	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	DCR2	Q05924	578 aa		0.03	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	VPS68	Q12016	184 aa		0.03	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	YOP1	Q12402	180 aa		0.03	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	GRX6	Q12438	231 aa		0.03	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	RTN2	Q12443	393 aa		0.03	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	ERG3	P32353	365 aa		0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	TOA2	P32774	122 aa		0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	SMF1	P38925	575 aa		0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	FCY21	P40039	528 aa		0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	ECO1	P43605	281 aa		0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	ABM1	P47146	123 aa		0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	NUP57	P48837	541 aa		0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	TOS2	P50078	622 aa		0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	MMT2	Q08970	484 aa		0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	RUP1	Q12242	671 aa		0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	MRX4	Q12467	430 aa		0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	YHR086W-A	Q3E746	53 aa		0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	DST1	P07273	309 aa		0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	YAK1	P14680	807 aa		0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	SCO1	P23833	295 aa		0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	IST2	P38250	946 aa		0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	TAE1	P38340	232 aa		0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	YIL054W	P40524	105 aa		0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	MIC19	P43594	170 aa		0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	YGL138C	P53122	345 aa		0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	SKO1	Q02100	647 aa		0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	SCS7	Q03529	384 aa		0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	YMR244W	Q04018	355 aa		0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	INM2	Q05533	292 aa		0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	GAS2	Q06135	555 aa		0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	YDL109C	Q12103	647 aa		0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	ENT1	Q12518	454 aa		0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	0.01	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	RPL12B	P0CX54	165 aa		0.01	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	0.01	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	STN1	P38960	494 aa		0.01	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	0.01	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	YER188W	P40103	239 aa		0.01	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	ATM1	P40416	690 aa		0.01	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	0.01	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	TOM22	P49334	152 aa		0.01	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	PMT5	P52867	743 aa		0.01	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	PIB2	P53191	635 aa		0.01	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	OCA2	P53949	197 aa		0.01	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	YMR166C	Q03829	368 aa		0.01	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	0.01	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	TY3A-G	Q12173	290 aa		0.01	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	TY3A-I	Q99219	290 aa		0.01	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	0.01	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	TPK3	P05986	398 aa		0.01	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	0.01	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	SSH4	P32343	579 aa		0.01	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	ZRT3	P34240	503 aa		0.01	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	CAB3	P36076	571 aa		0.01	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	INM1	P38710	295 aa		0.01	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	VID27	P40157	782 aa		0.01	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	YFR018C	P43599	363 aa		0.01	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	DSK2	P48510	373 aa		0.01	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	SDS23	P53172	527 aa		0.01	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	0.01	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	SUR7	P54003	302 aa		0.01	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	0.01	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	MMR1	Q06324	491 aa		0.01	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	AEP3	Q12089	606 aa		0.01	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	MED2	Q12124	431 aa		0.01	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	IES3	Q12345	250 aa		0.01	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	YOR012W	Q12351	137 aa		0.01	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	VPS63	O13549	108 aa		0	□□□□□ -2.41

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