RNA–Protein interactions for RNA: YKR093W

PTR2, Transcript of Integral membrane peptide transporter, yeast

Gene PTR2, Length 1,806 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PTR2	YKR093W	ATR1	P13090	542 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	PHA2	P32452	334 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	MKK1	P32490	508 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	TAE1	P38340	232 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	RBG1	P39729	369 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	SIA1	Q12212	622 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	AYT1	Q12226	474 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	RAD7	P06779	565 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	PET123	P17558	318 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	YKR015C	P36111	568 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	PCI8	P40512	444 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	MKC7	P53379	596 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	SPP2	Q02521	185 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	MED4	Q12343	284 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	UBA3	Q99344	299 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	CDC42	P19073	191 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	SPS22	P25380	463 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	ERG9	P29704	444 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	YHR182W	P38870	785 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	RPR2	P40571	144 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	OKP1	P53298	406 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	COX20	Q04935	205 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	ALE1	Q08548	619 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	DCC1	P25559	380 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	ACB1	P31787	87 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	YHR045W	P38775	560 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	COX16	P47081	118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	TIM21	P53220	239 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	FMP42	Q04991	504 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	MDM36	Q06820	579 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	YLR108C	Q12259	485 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.62	not detected
PTR2	YKR093W	MSF1	P08425	469 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	MSN4	P33749	630 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	ASK1	P35734	292 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	DTR1	P38125	572 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	YND1	P40009	630 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	YFL040W	P43562	540 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	YJL118W	P47022	219 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	AIM24	P47127	394 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	MNT4	P53745	580 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	SRL4	Q03085	281 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	YLR281C	Q05863	155 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	CTS2	Q06350	511 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	GPN3	Q06543	272 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	SET6	Q12529	373 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PTR2	YKR093W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	TMT1	P32643	299 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	ATO2	P32907	282 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	COS9	P36034	407 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	NAT2	P37293	288 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	MMS21	P38632	267 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	HIS2	P38635	335 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	SLM1	P40485	686 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	IBD2	P53892	351 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	PET117	Q02771	107 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	YRM1	Q12340	786 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	COX2	P00410	251 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	YCR043C	P25361	127 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	POP5	P28005	173 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	MTC6	P38849	526 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	BNA6	P43619	295 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	YAR1	P46683	200 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	YJR030C	P47101	745 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	GOR1	P53839	350 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	YPL080C	Q02826	108 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	CHD1	P32657	1468 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	CDC23	P16522	626 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	YIL169C	P40442	995 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	YPQ1	Q12010	308 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	RBK1	P25332	333 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	CWP1	P28319	239 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63

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