RNA–Protein interactions for RNA: YKR088C

TVP38, Transcript of Integral membrane protein, yeast

Gene TVP38, Length 1,014 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TVP38	YKR088C	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	RBK1	P25332	333 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	PCL2	P25693	308 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	MRPL9	P31334	269 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	HOG1	P32485	435 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	SEC17	P32602	292 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	TAF14	P35189	244 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	DRE2	P36152	348 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	YCR087C-A	P37263	153 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	NAT2	P37293	288 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	APM3	P38153	483 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	BMT2	P38278	337 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	UBA4	P38820	440 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	YHR202W	P38887	602 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	MLH1	P38920	769 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	RRG9	P40156	214 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	PMT4	P46971	762 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	MDV1	P47025	714 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	AIM22	P47051	409 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	NBP35	P52920	328 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	VAC7	P53950	1165 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	MRPS16	Q02608	121 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	COS7	Q07788	383 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	RRT8	Q08219	342 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	ATP16	Q12165	160 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	YOR214C	Q12282	236 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	YDR061W	Q12298	539 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	MHT1	Q12525	324 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	YPR096C	O13587	100 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	HAP2	P06774	265 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	TFS1	P14306	219 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	GSH1	P32477	678 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	TIP20	P33891	701 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	ALY1	P36117	915 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	PHM8	P40025	321 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	BUR6	P40096	142 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	VRG4	P40107	337 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	PAN6	P40459	309 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	IME4	P41833	600 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	SSU1	P41930	458 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	IRC7	P43623	340 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	MDE1	P47095	244 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	STE24	P47154	453 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	HMS2	P47175	358 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	YGL117W	P53133	265 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	IPI3	P53877	555 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	YNL143C	P53908	130 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	DID2	P69771	204 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	MET31	Q03081	177 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	HER2	Q03557	464 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	YLR446W	Q06204	433 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	YPL199C	Q08954	240 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	MDM32	Q12171	622 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	SUS1	Q6WNK7	96 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	YOR019W	Q99248	730 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	UBR1	P19812	1950 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	ATP4	P05626	244 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	CDC21	P06785	304 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	KAR1	P11927	433 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	SIR1	P21691	654 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	MRPL8	P22353	238 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.24	□□□□□ -1.73	not detected
TVP38	YKR088C	JEN1	P36035	616 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	PIM1	P36775	1133 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	HMT1	P38074	348 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	YBR071W	P38243	211 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	YBR137W	P38276	179 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	COS111	P38308	924 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	YBR225W	P38321	900 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	LEU5	P38702	357 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	EXO1	P39875	702 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	LAS21	P40367	830 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	YIL077C	P40508	320 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	GDS1	P41913	522 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	YJL043W	P47053	257 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	APS3	P47064	194 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	GPG1	P53130	126 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	NUP116	Q02630	1113 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	VPS74	Q06385	345 aa		4.24	□□□□□ -1.73

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 33 ms