RNA–Protein interactions for RNA: YJR147W

HMS2, Transcript of Protein with similarity to heat shock transcription factors, yeast

Gene HMS2, Length 1,077 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HMS2	YJR147W	ECT1	P33412	323 aa		6.27	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	SHP1	P34223	423 aa		6.27	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	LST4	P34239	828 aa		6.27	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	MBA1	P38300	278 aa		6.27	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	CYC2	P38909	366 aa		6.27	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	SHU2	P38957	223 aa		6.27	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	PSD1	P39006	500 aa		6.27	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	YJL206C	P39529	758 aa		6.27	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	AFG3	P39925	761 aa		6.27	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	VAB2	P40003	282 aa		6.27	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	ATM1	P40416	690 aa		6.27	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	CHS6	P40955	746 aa		6.27	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	FET4	P40988	552 aa		6.27	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	GLC8	P41818	229 aa		6.27	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	SLS1	P42900	643 aa		6.27	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	ASG7	P46993	209 aa		6.27	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	TIM21	P53220	239 aa		6.27	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	YAT1	P80235	687 aa		6.27	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	SAE3	P89114	91 aa		6.27	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	ESA1	Q08649	445 aa		6.27	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.27	□□□□□ -1.41	not detected
HMS2	YJR147W	SRO7	Q12038	1033 aa		6.27	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	YLL058W	Q12198	575 aa		6.27	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	SFM1	Q12314	213 aa		6.27	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		6.27	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	PCC1	Q3E833	88 aa		6.27	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		6.27	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	IMG1	P25626	169 aa		6.26	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	ERV1	P27882	189 aa		6.26	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.26	□□□□□ -1.41	not detected
HMS2	YJR147W	BEM1	P29366	551 aa		6.26	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	YSC84	P32793	468 aa		6.26	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	IST2	P38250	946 aa		6.26	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	TAE1	P38340	232 aa		6.26	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	MRH4	P53166	561 aa		6.26	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	MTQ1	P53944	314 aa		6.26	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	YMR210W	Q03649	449 aa		6.26	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	CAC2	Q04199	468 aa		6.26	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	HSP31	Q04432	237 aa		6.26	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	SWT1	Q12104	458 aa		6.26	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	LCB4	Q12246	624 aa		6.26	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	YLR108C	Q12259	485 aa		6.26	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	YOP1	Q12402	180 aa		6.26	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	AGC1	Q12482	902 aa		6.26	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		6.26	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	CPR4	P25334	318 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	UBC8	P28263	218 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	ARO7	P32178	256 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	TCA17	P32613	152 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	UGA4	P32837	571 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	YKL071W	P36086	256 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	MRPL4	P36517	319 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	APT2	P36973	181 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	UBA4	P38820	440 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	YJR056C	P47115	236 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	MRX6	P48564	524 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	GND2	P53319	492 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	BUD32	P53323	261 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	ECM9	Q02202	377 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	MRP51	Q02950	344 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	YPL113C	Q02961	396 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	OST6	Q03723	332 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	YHM2	Q04013	314 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	PEX12	Q04370	399 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	YPR127W	Q06494	345 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	YET3	Q07451	203 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	GUP2	Q08929	609 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	YPL066W	Q12194	479 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	UBX3	Q12229	455 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	ECM3	Q99252	613 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	RIB3	Q99258	208 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	FLO11	P08640	1367 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	VPS63	O13549	108 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	BI2	P03873	423 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	DST1	P07273	309 aa		6.24	□□□□□ -1.41

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.7 ms